An efficient algorithm for statistical multiple alignment on arbitrary phylogenetic trees.
We present an efficient algorithm for statistical multiple alignment based on the TKF91 model of Thorne, Kishino, and Felsenstein (1991) on an arbitrary k-leaved phylogenetic tree. The existing algorithms use a hidden Markov model approach, which requires at least O( radical 5(k)) states and leads t...
প্রধান লেখক: | Lunter, G, Miklós, I, Song, Y, Hein, J |
---|---|
বিন্যাস: | Journal article |
ভাষা: | English |
প্রকাশিত: |
2003
|
অনুরূপ উপাদানগুলি
অনুরূপ উপাদানগুলি
-
Phylogenetic automata, pruning, and multiple alignment
অনুযায়ী: Westesson, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011) -
Bayesian phylogenetic inference under a statistical insertion-deletion model
অনুযায়ী: Lunter, G, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003) -
Polynomial algorithms for the Maximal Pairing Problem: efficient phylogenetic targeting on arbitrary trees
অনুযায়ী: Stadler Peter F, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010-06-01) -
An algorithm for statistical alignment of sequences related by a binary tree.
অনুযায়ী: Hein, J
প্রকাশিত: (2001) -
Genome-wide functional element detection using pairwise statistical alignment outperforms multiple genome footprinting techniques.
অনুযায়ী: Satija, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010)