Characterising the determinants of hypoxia inducible transcription factors binding to chromatin

Characterising the determinants of hypoxia inducible transcription factors binding to chromatin

<p>Hypoxia regulates many hundreds of genes that play important roles in numerous physiological and pathophysiological processes. The hypoxia inducible transcription factors (HIFs) are central to the transcriptional activation of these hypoxia-regulated genes. However, to date, little is known...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автор:	Smythies, J
Інші автори:	Ratcliffe, P
Формат:	Дисертація
Мова:	English
Опубліковано:	2017
Предмети:	Transcription factors

Схожі ресурси

Regulation of chromatin architecture by transcription factor binding
за авторством: Stephanie Portillo-Ledesma, та інші
Опубліковано: (2024-01-01)

Transcription factors organize into functional groups on the linear genome and in 3D chromatin
за авторством: Rakesh Netha Vadnala, та інші
Опубліковано: (2023-08-01)

Assessing the model transferability for prediction of transcription factor binding sites based on chromatin accessibility
за авторством: Sheng Liu, та інші
Опубліковано: (2017-07-01)

MORC proteins regulate transcription factor binding by mediating chromatin compaction in active chromatin regions
за авторством: Zhenhui Zhong, та інші
Опубліковано: (2023-04-01)

Mechanisms governing target search and binding dynamics of hypoxia-inducible factors
за авторством: Yu Chen, та інші
Опубліковано: (2022-11-01)

E-box binding transcription factors in cancer
за авторством: Yuanzhong Pan, та інші
Опубліковано: (2023-08-01)

The chromatin remodeling protein Lsh alters nucleosome occupancy at putative enhancers and modulates binding of lineage specific transcription factors
за авторством: Jianke Ren, та інші
Опубліковано: (2019-03-01)

Hypoxia and Chromatin: A Focus on Transcriptional Repression Mechanisms
за авторством: Michael Batie, та інші
Опубліковано: (2018-04-01)

An Algorithm for Identifying Novel Targets of Transcription Factor Families: Application to Hypoxia-inducible Factor 1 Targets
за авторством: Yue Jiang, та інші
Опубліковано: (2009-01-01)

The interplay between chromatin and transcription factor networks during B cell development: who pulls the trigger first?
за авторством: Mohamed-Amin eChoukrallah, та інші
Опубліковано: (2014-04-01)

Profiling of chromatin accessibility identifies transcription factor binding sites across the genome of Aspergillus species
за авторством: Lianggang Huang, та інші
Опубліковано: (2021-09-01)

TF-chRDP: a method for simultaneously capturing transcription factor binding chromatin-associated RNA, DNA and protein
за авторством: Duo Ning, та інші
Опубліковано: (2025-03-01)

Role of transcription factors and chromatin modifiers in driving lineage reprogramming in treatment-induced neuroendocrine prostate cancer
за авторством: Amritha Sreekumar, та інші
Опубліковано: (2023-01-01)

DeepCAGE: Incorporating Transcription Factors in Genome-wide Prediction of Chromatin Accessibility
за авторством: Qiao Liu, та інші
Опубліковано: (2022-06-01)

A screening system to identify transcription factors that induce binding site-directed DNA demethylation
за авторством: Takahiro Suzuki, та інші
Опубліковано: (2017-12-01)

Mutations and binding sites of human transcription factors
за авторством: Frederick Kinyua Kamanu, та інші
Опубліковано: (2012-06-01)

H3.3 contributes to chromatin accessibility and transcription factor binding at promoter-proximal regulatory elements in embryonic stem cells
за авторством: Amanuel Tafessu, та інші
Опубліковано: (2023-02-01)

Differential Grainy head binding correlates with variation in chromatin structure and gene expression in Drosophila melanogaster
за авторством: Henry A. Ertl, та інші
Опубліковано: (2022-12-01)

Restriction of Cellular Plasticity of Differentiated Cells Mediated by Chromatin Modifiers, Transcription Factors and Protein Kinases
за авторством: Dylan P. Rahe, та інші
Опубліковано: (2019-07-01)

Using methylation data to improve transcription factor binding prediction
за авторством: Daniel Morgan, та інші
Опубліковано: (2024-12-01)

A regulatory role for repeated decoy transcription factor binding sites in target gene expression
за авторством: Tek‐Hyung Lee, та інші
Опубліковано: (2012-03-01)

Concentration dependent chromatin states induced by the bicoid morphogen gradient
за авторством: Colleen E Hannon, та інші
Опубліковано: (2017-09-01)

Proteomic analyses reveal distinct chromatin‐associated and soluble transcription factor complexes
за авторством: Xu Li, та інші
Опубліковано: (2015-01-01)

BTFBS: Binding Prediction of Bacterial Transcription Factors and Binding Sites Based on Deep Learning
за авторством: Bingbing Jin, та інші
Опубліковано: (2025-02-01)

Comprehensive analysis of computational approaches in plant transcription factors binding regions discovery
за авторством: Jyoti, та інші
Опубліковано: (2024-10-01)

Calmodulin-Binding Transcription Factors: Roles in Plant Response to Abiotic Stresses
за авторством: Yayu Liu, та інші
Опубліковано: (2025-02-01)

DNA methylation presents distinct binding sites for human transcription factors
за авторством: Shaohui Hu, та інші
Опубліковано: (2013-09-01)

Editorial: Transcription factors and regulation of transcriptional programs in fungi
за авторством: Richard B. Todd, та інші
Опубліковано: (2022-12-01)

Emerging Roles of Plant DNA-Binding With One Finger Transcription Factors in Various Hormone and Stress Signaling Pathways
за авторством: Zemin Wang, та інші
Опубліковано: (2022-05-01)

Genome-wide identification and characterisation of bHLH transcription factors in Artemisia annua
за авторством: Shuwei Chang, та інші
Опубліковано: (2023-02-01)

TF-COMB – Discovering grammar of transcription factor binding sites
за авторством: Mette Bentsen, та інші
Опубліковано: (2022-01-01)

Modeling binding specificities of transcription factor pairs with random forests
за авторством: Anni A. Antikainen, та інші
Опубліковано: (2022-06-01)

Transcription factor binding sites are highly enriched within microRNA precursor sequences
за авторством: Piriyapongsa Jittima, та інші
Опубліковано: (2011-12-01)

A continuum of zinc finger transcription factor retention on native chromatin underlies dynamic genome organization
за авторством: Siling Hu, та інші
Опубліковано: (2024-05-01)

Transcription and chromatin determinants of de novo DNA methylation timing in oocytes
за авторством: Lenka Gahurova, та інші
Опубліковано: (2017-05-01)

The Binding Occupancy of Pro-Hypertrophic Transcription Factors among Cardiac Developmental Enhancers
за авторством: Rabail Zehra Raza, та інші
Опубліковано: (2024-01-01)

Recent Advances in the Computational Discovery of Transcription Factor Binding Sites
за авторством: Ioannis P. Androulakis, та інші
Опубліковано: (2009-03-01)

A preliminary computational outputs versus experimental results: Application of sTRAP, a biophysical tool for the analysis of SNPs of transcription factor‐binding sites
за авторством: Shirin Moradifard, та інші
Опубліковано: (2020-05-01)

Hypoxia‐Inducible Factor‐2α Signaling in the Skeletal System
за авторством: Sarah V Mendoza, та інші
Опубліковано: (2023-04-01)

Analysis of genomic sequence motifs for deciphering transcription factor binding and transcriptional regulation in eukaryotic cells
за авторством: Valentina eBoeva, та інші
Опубліковано: (2016-02-01)