Occurrence and consequences of coding sequence insertions and deletions in Mammalian genomes.

Occurrence and consequences of coding sequence insertions and deletions in Mammalian genomes.

Nucleotide insertion and deletion (indel) events, together with substitutions, represent the major mutational processes of gene evolution. Through the alignment of 8148 orthologous genes from human, mouse, and rat, we have identified 1743 indel events within rodent protein-coding sequences. Using hu...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Taylor, MS, Ponting, C, Copley, R
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	2004

Схожі ресурси

Evolutionary consequences of genomic deletions and insertions in the woolly mammoth genome
за авторством: Tom van der Valk, та інші
Опубліковано: (2022-08-01)

Massive turnover of functional sequence in human and other mammalian genomes.
за авторством: Meader, S, та інші
Опубліковано: (2010)

Natural genetic variation caused by small insertions and deletions in the human genome.
за авторством: Mills, R, та інші
Опубліковано: (2011)

Cloning of Deleted Sequences (CODE): A Genomic Subtraction Method for Enriching and Cloning Deleted Sequences
за авторством: J. Li, та інші
Опубліковано: (2001-10-01)

Codes correcting bursts of deletions/insertions and tandem duplications
за авторством: Nguyen, Tuan Thanh
Опубліковано: (2018)

Irregular Marker Codes for Insertion/Deletion-AWGN Channels
за авторством: Yuan Liu, та інші
Опубліковано: (2020-01-01)

Mammalian BEX, WEX and GASP genes: Coding and non-coding chimaerism sustained by gene conversion events
за авторством: Winter, E, та інші
Опубліковано: (2005)

Mammalian BEX, WEX and GASP genes: Coding and non-coding chimaerism sustained by gene conversion events
за авторством: Winter, E, та інші
Опубліковано: (2005)

Ruler arrays detect genomic insertions and deletions
за авторством: Rolfe, P. Alexander (Philip Alexander), 1979-
Опубліковано: (2010)

Detection and annotation of transposable element insertions and deletions on the human genome using nanopore sequencing
за авторством: Javier Cuenca-Guardiola, та інші
Опубліковано: (2023-11-01)

Genome-wide characterization of insertion and deletion variation in chicken using next generation sequencing.
за авторством: Yiyuan Yan, та інші
Опубліковано: (2014-01-01)

ParMap, an algorithm for the identification of small genomic insertions and deletions in nextgen sequencing data
за авторством: Palomero Teresa, та інші
Опубліковано: (2010-05-01)

Efficiently list-decodable insertion and deletion codes via concatenation
за авторством: Liu, Shu, та інші
Опубліковано: (2022)

Stochastic models of sequence evolution including insertion-deletion events.
за авторством: Miklós, I, та інші
Опубліковано: (2009)

Assessing Autosomal InDel Loci With Multiple Insertions or Deletions of Random DNA Sequences in Human Genome
за авторством: Yining Yao, та інші
Опубліковано: (2022-02-01)

The genomic pattern of insertion/deletion variations during rice improvement
за авторством: Xia Zhou, та інші
Опубліковано: (2024-12-01)

Optical genome mapping identified deletions, inversions, and insertions in hemophilia
за авторством: Boyan Liu, та інші
Опубліковано: (2025-01-01)

Sialidase-like Asp-boxes: sequence-similar structures within different protein folds.
за авторством: Copley, R, та інші
Опубліковано: (2001)

Eukaryotic domain evolution inferred from genome comparisons.
за авторством: Copley, R, та інші
Опубліковано: (2003)

Optimized detection of insertions/deletions (INDELs) in whole-exome sequencing data.
за авторством: Bo-Young Kim, та інші
Опубліковано: (2017-01-01)

Whole genome sequencing data of 1110 Mycobacterium tuberculosis isolates identifies insertions and deletions associated with drug resistance
за авторством: Xi Zeng, та інші
Опубліковано: (2018-05-01)

Molecular crowding inhibits U-insertion/deletion RNA editing in vitro: consequences for the in vivo reaction.
за авторством: Venkata Subbaraju Katari, та інші
Опубліковано: (2013-01-01)

Correlated occurrence and bypass of frame-shifting insertion-deletions (InDels) to give functional proteins.
за авторством: Liat Rockah-Shmuel, та інші
Опубліковано: (2013-10-01)

De novo activated transcription of inserted foreign coding sequences is inheritable in the plant genome.
за авторством: Takayuki Hata, та інші
Опубліковано: (2021-01-01)

De novo activated transcription of inserted foreign coding sequences is inheritable in the plant genome
за авторством: Takayuki Hata, та інші
Опубліковано: (2021-01-01)

Vowel Deletion and Insertion in Úwù
за авторством: Allison Idris Olawale
Опубліковано: (2017-06-01)

Hierarchical Interleaving and Chained Recovery Schemes of LDPC Codes for Noisy Insertion and Deletion Channels
за авторством: Ryo Shibata
Опубліковано: (2024-01-01)

Marker Codes Using the Decoding Based on Weighted Levenshtein Distance in the Presence of Insertions/Deletions
за авторством: Yuan Liu, та інші
Опубліковано: (2020-01-01)

Locating protein-coding sequences under selection for additional, overlapping functions in 29 mammalian genomes
за авторством: Lin, Michael F., та інші
Опубліковано: (2012)

Probabilistic phylogenetic inference with insertions and deletions.
за авторством: Elena Rivas, та інші
Опубліковано: (2008-09-01)

Analyses of functional sequence in mammalian and avian genomes
за авторством: Rands, C, та інші
Опубліковано: (2014)

Genome and gene alterations by insertions and deletions in the evolution of human and chimpanzee chromosome 22
за авторством: Volfovsky Natalia, та інші
Опубліковано: (2009-01-01)

Short sequence motifs, overrepresented in mammalian conserved non-coding sequences
за авторством: Kondrashov Alexey S, та інші
Опубліковано: (2007-10-01)

Unexpected insertion of carrier DNA sequences into the fission yeast genome during CRISPR–Cas9 mediated gene deletion
за авторством: Sophie Longmuir, та інші
Опубліковано: (2019-03-01)

Fast mapping of short sequences with mismatches, insertions and deletions using index structures.
за авторством: Steve Hoffmann, та інші
Опубліковано: (2009-09-01)

Sequence analysis of multidomain proteins: past perspectives and future directions.
за авторством: Copley, R, та інші
Опубліковано: (2002)

Pathogenicity and functional impact of non-frameshifting insertion/deletion variation in the human genome.
за авторством: Kymberleigh A Pagel, та інші
Опубліковано: (2019-06-01)

Large genomic fragment deletions and insertions in mouse using CRISPR/Cas9.
за авторством: Luqing Zhang, та інші
Опубліковано: (2015-01-01)

Approximating the edit distance for genomes with duplicate genes under DCJ, insertion and deletion
за авторством: Shao Mingfu, та інші
Опубліковано: (2012-12-01)

Using the Neandertal genome to study the evolution of small insertions and deletions in modern humans
за авторством: Manjusha Chintalapati, та інші
Опубліковано: (2017-08-01)