RNA polymerase pausing during initial transcription

RNA polymerase pausing during initial transcription

In bacteria, RNA polymerase (RNAP) initiates transcription by synthesizing short transcripts that are either released or extended to allow RNAP to escape from the promoter. The mechanism of initial transcription is unclear due to the presence of transient intermediates and molecular heterogeneity. H...

Ամբողջական նկարագրություն

Մատենագիտական մանրամասներ
Հիմնական հեղինակներ:	Duchi, D, Bauer, D, Fernandez, L, Evans, G, Robb, N, Hwang, L, Gryte, K, Tomescu, A, Zawadzki, P, Morichaud, Z, Brodolin, K, Kapanidis, A
Ձևաչափ:	Journal article
Լեզու:	English
Հրապարակվել է:	Cell Press 2016

Նմանատիպ նյութեր

Conformational heterogeneity and bubble dynamics in single bacterial transcription initiation complexes
‌: Duchi, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

Pausing controls branching between productive and non-productive pathways during initial transcription in bacteria
‌: Dulin, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: Implications for transcription start-site selection
‌: Robb, N, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: implications for transcription start-site selection.
‌: Robb, N, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

Pausing controls branching between productive and non-productive pathways during initial transcription in bacteria
‌: David Dulin, և այլն
Հրապարակվել է: (2018-04-01)

Single-Molecule Studies of Transcription Initiation using a Vesicle Approach
‌: Llumigusin, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

CDK9-dependent RNA polymerase II pausing controls transcription initiation
‌: Saskia Gressel, և այլն
Հրապարակվել է: (2017-10-01)

Real-time transcription initiation by E. coli RNA polymerase in vitro and in vivo
‌: Plochowietz, A, և այլն
Հրապարակվել է: (2015)

RNA polymerase II pausing in development: orchestrating transcription
‌: Abderhman Abuhashem, և այլն
Հրապարակվել է: (2022-01-01)

Sensing DNA opening in transcription using quenchable Forster resonance energy transfer.
‌: Cordes, T, և այլն
Հրապարակվել է: (2010)

A pause site for RNA polymerase II is associated with termination of transcription.
‌: Enriquez-Harris, P, և այլն
Հրապարակվել է: (1991)

Role of R-loops in pause-dependent transcriptional termination of RNA polymerase II
‌: Skourti-Stathaki, K
Հրապարակվել է: (2012)

Pause sequences facilitate entry into long-lived paused states by reducing RNA polymerase transcription rates
‌: Ronen Gabizon, և այլն
Հրապարակվել է: (2018-07-01)

Pause sites promote transcriptional termination of mammalian RNA polymerase II.
‌: Gromak, N, և այլն
Հրապարակվել է: (2006)

Role of RNA Polymerase II Promoter-Proximal Pausing in Viral Transcription
‌: Marilyn Whelan, և այլն
Հրապարակվել է: (2022-09-01)

Characterizing Influenza a RNA Polymerase - Promoter Interaction using Ensemble Fluorescence Spectroscopy
‌: Tomescu, A, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

Single-molecule FRET reveals a corkscrew RNA structure for the polymerase-bound influenza virus promoter.
‌: Tomescu, A, և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

Initial transcription by RNA polymerase proceeds through a DNA-scrunching mechanism.
‌: Kapanidis, A, և այլն
Հրապարակվել է: (2006)

Structural basis of the mycobacterial stress-response RNA polymerase auto-inhibition via oligomerization
‌: Zakia Morichaud, և այլն
Հրապարակվել է: (2023-01-01)

Single-molecule studies of transcription initiation
‌: Duchi Llumigusin, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

The RNA polymerase clamp interconverts dynamically among three states and is stabilized in a partly closed state by ppGpp
‌: Duchi, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

A Role for FACT in RNA Polymerase II Promoter-Proximal Pausing
‌: Theophilus T. Tettey, և այլն
Հրապարակվել է: (2019-06-01)

A-MYB and BRDT-dependent RNA Polymerase II pause release orchestrates transcriptional regulation in mammalian meiosis
‌: Adriana K. Alexander, և այլն
Հրապարակվել է: (2023-03-01)

The pause-initiation limit restricts transcription activation in human cells
‌: Saskia Gressel, և այլն
Հրապարակվել է: (2019-08-01)

Reporter-ChIP-nexus reveals strong contribution of the Drosophila initiator sequence to RNA polymerase pausing
‌: Wanqing Shao, և այլն
Հրապարակվել է: (2019-04-01)

The elemental mechanism of transcriptional pausing
‌: Jason Saba, և այլն
Հրապարակվել է: (2019-01-01)

Poly(A) signals and transcriptional pause sites combine to prevent interference between RNA polymerase II promoters.
‌: Eggermont, J, և այլն
Հրապարակվել է: (1993)

RNA polymerase II pausing downstream of core histone genes is different from genes producing polyadenylated transcripts.
‌: Krishanpal Anamika, և այլն
Հրապարակվել է: (2012-01-01)

Improved temporal resolution and linked hidden Markov modeling for switchable single-molecule FRET.
‌: Uphoff, S, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Transcription Pause and Escape in Neurodevelopmental Disorders
‌: Kristel N. Eigenhuis, և այլն
Հրապարակվել է: (2022-05-01)

Tyrosine 1-phosphorylated RNA polymerase II transcribes PROMPTs to facilitate proximal promoter pausing and induce global transcriptional repression in response to DNA damage
‌: Ajit, K, և այլն
Հրապարակվել է: (2024)

New core promoter element in RNA polymerase II-dependent transcription: sequence-specific DNA binding by transcription factor IIB.
‌: Lagrange, T, և այլն
Հրապարակվել է: (1998)

Transcriptional regulation: effects of promoter proximal pausing on speed, synchrony and reliability.
‌: Alistair N Boettiger, և այլն
Հրապարակվել է: (2011-05-01)

RNA Polymerase II pausing temporally coordinates cell cycle progression and erythroid differentiation
‌: Martell, DJ, և այլն
Հրապարակվել է: (2023)

RNA polymerase II pausing temporally coordinates cell cycle progression and erythroid differentiation.
‌: Martell, DJ, և այլն
Հրապարակվել է: (2023)

Grounded: Transcriptional Pausing in Naive mESCs
‌: Guenther, Matthew G., և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

YEAST RNA POLYMERASE-II TRANSCRIPTION - ENZYMATIC-ACTIVITIES OF GENERAL INITIATION-FACTORS, 3-D STRUCTURES OF INITIATION-FACTORS AND RNA-POLYMERASE, AND MECHANISM OF TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION
‌: Kornberg, R, և այլն
Հրապարակվել է: (1992)

Structures of co-transcriptional RNA capping enzymes on paused transcription complex
‌: Yan Li, և այլն
Հրապարակվել է: (2024-05-01)

Definition of transcriptional pause elements in fission yeast.
‌: Aranda, A, և այլն
Հրապարակվել է: (1999)

c-Myc regulates transcriptional pause release
‌: Rahl, Peter B., և այլն
Հրապարակվել է: (2012)