RNA polymerase pausing during initial transcription

RNA polymerase pausing during initial transcription

In bacteria, RNA polymerase (RNAP) initiates transcription by synthesizing short transcripts that are either released or extended to allow RNAP to escape from the promoter. The mechanism of initial transcription is unclear due to the presence of transient intermediates and molecular heterogeneity. H...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Duchi, D, Bauer, D, Fernandez, L, Evans, G, Robb, N, Hwang, L, Gryte, K, Tomescu, A, Zawadzki, P, Morichaud, Z, Brodolin, K, Kapanidis, A
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	Cell Press 2016

Схожі ресурси

Conformational heterogeneity and bubble dynamics in single bacterial transcription initiation complexes
за авторством: Duchi, D, та інші
Опубліковано: (2017)

Pausing controls branching between productive and non-productive pathways during initial transcription in bacteria
за авторством: Dulin, D, та інші
Опубліковано: (2018)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: Implications for transcription start-site selection
за авторством: Robb, N, та інші
Опубліковано: (2013)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: implications for transcription start-site selection.
за авторством: Robb, N, та інші
Опубліковано: (2013)

Pausing controls branching between productive and non-productive pathways during initial transcription in bacteria
за авторством: David Dulin, та інші
Опубліковано: (2018-04-01)

Single-Molecule Studies of Transcription Initiation using a Vesicle Approach
за авторством: Llumigusin, D, та інші
Опубліковано: (2012)

CDK9-dependent RNA polymerase II pausing controls transcription initiation
за авторством: Saskia Gressel, та інші
Опубліковано: (2017-10-01)

Real-time transcription initiation by E. coli RNA polymerase in vitro and in vivo
за авторством: Plochowietz, A, та інші
Опубліковано: (2015)

RNA polymerase II pausing in development: orchestrating transcription
за авторством: Abderhman Abuhashem, та інші
Опубліковано: (2022-01-01)

Sensing DNA opening in transcription using quenchable Forster resonance energy transfer.
за авторством: Cordes, T, та інші
Опубліковано: (2010)

A pause site for RNA polymerase II is associated with termination of transcription.
за авторством: Enriquez-Harris, P, та інші
Опубліковано: (1991)

Role of R-loops in pause-dependent transcriptional termination of RNA polymerase II
за авторством: Skourti-Stathaki, K
Опубліковано: (2012)

Pause sequences facilitate entry into long-lived paused states by reducing RNA polymerase transcription rates
за авторством: Ronen Gabizon, та інші
Опубліковано: (2018-07-01)

Pause sites promote transcriptional termination of mammalian RNA polymerase II.
за авторством: Gromak, N, та інші
Опубліковано: (2006)

Role of RNA Polymerase II Promoter-Proximal Pausing in Viral Transcription
за авторством: Marilyn Whelan, та інші
Опубліковано: (2022-09-01)

Characterizing Influenza a RNA Polymerase - Promoter Interaction using Ensemble Fluorescence Spectroscopy
за авторством: Tomescu, A, та інші
Опубліковано: (2013)

Single-molecule FRET reveals a corkscrew RNA structure for the polymerase-bound influenza virus promoter.
за авторством: Tomescu, A, та інші
Опубліковано: (2014)

Initial transcription by RNA polymerase proceeds through a DNA-scrunching mechanism.
за авторством: Kapanidis, A, та інші
Опубліковано: (2006)

Structural basis of the mycobacterial stress-response RNA polymerase auto-inhibition via oligomerization
за авторством: Zakia Morichaud, та інші
Опубліковано: (2023-01-01)

Single-molecule studies of transcription initiation
за авторством: Duchi Llumigusin, D, та інші
Опубліковано: (2014)

The RNA polymerase clamp interconverts dynamically among three states and is stabilized in a partly closed state by ppGpp
за авторством: Duchi, D, та інші
Опубліковано: (2018)

A Role for FACT in RNA Polymerase II Promoter-Proximal Pausing
за авторством: Theophilus T. Tettey, та інші
Опубліковано: (2019-06-01)

A-MYB and BRDT-dependent RNA Polymerase II pause release orchestrates transcriptional regulation in mammalian meiosis
за авторством: Adriana K. Alexander, та інші
Опубліковано: (2023-03-01)

The pause-initiation limit restricts transcription activation in human cells
за авторством: Saskia Gressel, та інші
Опубліковано: (2019-08-01)

Reporter-ChIP-nexus reveals strong contribution of the Drosophila initiator sequence to RNA polymerase pausing
за авторством: Wanqing Shao, та інші
Опубліковано: (2019-04-01)

The elemental mechanism of transcriptional pausing
за авторством: Jason Saba, та інші
Опубліковано: (2019-01-01)

Poly(A) signals and transcriptional pause sites combine to prevent interference between RNA polymerase II promoters.
за авторством: Eggermont, J, та інші
Опубліковано: (1993)

RNA polymerase II pausing downstream of core histone genes is different from genes producing polyadenylated transcripts.
за авторством: Krishanpal Anamika, та інші
Опубліковано: (2012-01-01)

Improved temporal resolution and linked hidden Markov modeling for switchable single-molecule FRET.
за авторством: Uphoff, S, та інші
Опубліковано: (2011)

Transcription Pause and Escape in Neurodevelopmental Disorders
за авторством: Kristel N. Eigenhuis, та інші
Опубліковано: (2022-05-01)

Tyrosine 1-phosphorylated RNA polymerase II transcribes PROMPTs to facilitate proximal promoter pausing and induce global transcriptional repression in response to DNA damage
за авторством: Ajit, K, та інші
Опубліковано: (2024)

New core promoter element in RNA polymerase II-dependent transcription: sequence-specific DNA binding by transcription factor IIB.
за авторством: Lagrange, T, та інші
Опубліковано: (1998)

Transcriptional regulation: effects of promoter proximal pausing on speed, synchrony and reliability.
за авторством: Alistair N Boettiger, та інші
Опубліковано: (2011-05-01)

RNA Polymerase II pausing temporally coordinates cell cycle progression and erythroid differentiation
за авторством: Martell, DJ, та інші
Опубліковано: (2023)

RNA polymerase II pausing temporally coordinates cell cycle progression and erythroid differentiation.
за авторством: Martell, DJ, та інші
Опубліковано: (2023)

Grounded: Transcriptional Pausing in Naive mESCs
за авторством: Guenther, Matthew G., та інші
Опубліковано: (2014)

YEAST RNA POLYMERASE-II TRANSCRIPTION - ENZYMATIC-ACTIVITIES OF GENERAL INITIATION-FACTORS, 3-D STRUCTURES OF INITIATION-FACTORS AND RNA-POLYMERASE, AND MECHANISM OF TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION
за авторством: Kornberg, R, та інші
Опубліковано: (1992)

Structures of co-transcriptional RNA capping enzymes on paused transcription complex
за авторством: Yan Li, та інші
Опубліковано: (2024-05-01)

Definition of transcriptional pause elements in fission yeast.
за авторством: Aranda, A, та інші
Опубліковано: (1999)

c-Myc regulates transcriptional pause release
за авторством: Rahl, Peter B., та інші
Опубліковано: (2012)