Global analysis of RNA-binding protein dynamics by comparative and enhanced RNA interactome capture

Global analysis of RNA-binding protein dynamics by comparative and enhanced RNA interactome capture

Interactions between RNA-binding proteins (RBPs) and RNAs are critical to cell biology. However, methods to comprehensively and quantitatively assess these interactions within cells were lacking. RNA interactome capture (RIC) uses in vivo UV crosslinking, oligo(dT) capture, and proteomics to identif...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Perez-Perri, JI, Noerenberg, M, Kamel, W, Lenz, CE, Mohammed, S, Hentze, MW, Castello, A
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	Springer Nature 2020

Những quyển sách tương tự

Discovery of RNA-binding proteins and characterization of their dynamic responses by enhanced RNA interactome capture
Bằng: Joel I. Perez-Perri, et al.
Được phát hành: (2018-10-01)

Identification of RNA-binding proteins in macrophages by interactome capture
Bằng: Liepelt, A, et al.
Được phát hành: (2016)

Discovering the RNA-binding proteome of plant leaves with an improved RNA interactome capture method
Bằng: Bach-Pages, M, et al.
Được phát hành: (2020)

Discovering the RNA-Binding Proteome of Plant Leaves with an Improved RNA Interactome Capture Method
Bằng: Marcel Bach-Pages, et al.
Được phát hành: (2020-04-01)

Plant RNA interactome capture: Revealing the plant RBPome.
Bằng: Bach-Pages, M, et al.
Được phát hành: (2017)

Comprehensive Identification of mRNA-Binding Proteins of Leishmania donovani by Interactome Capture.
Bằng: Devki Nandan, et al.
Được phát hành: (2017-01-01)

Metabolic enzymes enjoying new partnerships as RNA-binding proteins
Bằng: Castello, A, et al.
Được phát hành: (2015)

A brave new world of RNA-binding proteins
Bằng: Preiss, T, et al.
Được phát hành: (2018)

Revealing the Arabidopsis AtGRP7 mRNA binding proteome by specific enhanced RNA interactome capture
Bằng: Marlene Reichel, et al.
Được phát hành: (2024-06-01)

Tau interactome and RNA binding proteins in neurodegenerative diseases
Bằng: Tomas Kavanagh, et al.
Được phát hành: (2022-10-01)

Comprehensive identification of RNA-binding domains in human cells
Bằng: Castello, A, et al.
Được phát hành: (2016)

RBDmap: a proteome-wide repertoire of RNA-binding domains of human RNA-binding proteins
Bằng: Palomares, A, et al.
Được phát hành: (2017)

Identification of RNA-binding domains of RNA-binding proteins in cultured cells on a system-wide scale with RBDmap
Bằng: Castello, A, et al.
Được phát hành: (2017)

Cellular dsRNA interactome captured by K1 antibody reveals the regulatory map of exogenous RNA sensing
Bằng: JinA Lim, et al.
Được phát hành: (2025-03-01)

Transcriptome-Wide Identification of Coding and Noncoding RNA-Binding Proteins Defines the Comprehensive RNA Interactome of Leishmania mexicana
Bằng: Karunakaran Kalesh, et al.
Được phát hành: (2022-02-01)

Defining the RNA interactome by total RNA‐associated protein purification
Bằng: Vadim Shchepachev, et al.
Được phát hành: (2019-04-01)

Mapping RNA–RNA interactome and RNA structure in vivo by MARIO
Bằng: Tri C. Nguyen, et al.
Được phát hành: (2016-06-01)

The transcript interactome of skeletal muscle RNA binding protein motif 3 (RBM3)
Bằng: Zachary R. Hettinger, et al.
Được phát hành: (2023-02-01)

System-wide analyses of the fission yeast poly(A)+ RNA interactome reveal insights into organisation and function of RNA-protein complexes
Bằng: Kilchert, C, et al.
Được phát hành: (2020)

The cardiomyocyte RNA-binding proteome: Links to intermediary metabolism and heart disease
Bằng: Liao, Y, et al.
Được phát hành: (2016)

Comprehensive identification of RNA-binding domains in human cells
Bằng: Castello, A, et al.
Được phát hành: (2016)

The new (dis)order in RNA regulation
Bằng: Jarvelin, A, et al.
Được phát hành: (2016)

Viral RNA Interactome: The Ultimate Researcher’s Guide to RNA–Protein Interactions
Bằng: Wesley A. Hanson, et al.
Được phát hành: (2024-10-01)

The RNA-binding protein landscapes differ between mammalian organs and cultured cells
Bằng: Joel I. Perez-Perri, et al.
Được phát hành: (2023-04-01)

Protein-mRNA interactome capture: cartography of the mRNP landscape [version 1; referees: 3 approved]
Bằng: Sean P. Ryder
Được phát hành: (2016-11-01)

Comprehensive Analysis of Human microRNA–mRNA Interactome
Bằng: Olga Plotnikova, et al.
Được phát hành: (2019-10-01)

Dissection of protein interactomics highlights microRNA synergy.
Bằng: Wenliang Zhu, et al.
Được phát hành: (2013-01-01)

Discovering RNA-Protein Interactome by Using Chemical Context Profiling of the RNA-Protein Interface
Bằng: Marc Parisien, et al.
Được phát hành: (2013-05-01)

Role of miRNA–mRNA Interactome in Pathophysiology of Arrhythmogenic Cardiomyopathy
Bằng: Fernando Bonet, et al.
Được phát hành: (2024-08-01)

Hepatitis B virus Core protein nuclear interactome identifies SRSF10 as a host RNA-binding protein restricting HBV RNA production.
Bằng: Hélène Chabrolles, et al.
Được phát hành: (2020-11-01)

Unveiling the protein-protein interactome of the RNA-binding protein Rev in HIV-1 infected T CD4+ lymphocytic cells
Bằng: Truman, C
Được phát hành: (2021)

Dengue and Zika RNA-RNA interactomes reveal pro- and anti-viral RNA in human cells
Bằng: Liao, Kuo-Chieh, et al.
Được phát hành: (2024)

Dengue and Zika RNA-RNA interactomes reveal pro- and anti-viral RNA in human cells
Bằng: Kuo-Chieh Liao, et al.
Được phát hành: (2023-12-01)

Expanded palette of RNA base editors for comprehensive RBP-RNA interactome studies
Bằng: Hugo C. Medina-Munoz, et al.
Được phát hành: (2024-01-01)

RNA Interactome Identification via RNA-BioID in Mouse Embryonic Fibroblasts
Bằng: Joyita Mukherjee, et al.
Được phát hành: (2020-01-01)

Single Oligonucleotide Capture of RNA And Temperature Elution Series (SOCRATES) for Identification of RNA-binding Proteins
Bằng: Allen Yu, et al.
Được phát hành: (2022-12-01)

Endogenous ZAP affects Zika virus RNA interactome
Bằng: Ahmad Jawad Sabir, et al.
Được phát hành: (2024-12-01)

Chemoproteomic capture of RNA binding activity in living cells
Bằng: Andrew J. Heindel, et al.
Được phát hành: (2023-10-01)

Characterization of an RNA binding protein interactome reveals a context-specific post-transcriptional landscape of MYC-amplified medulloblastoma
Bằng: Michelle M. Kameda-Smith, et al.
Được phát hành: (2022-12-01)

System-wide profiling of RNA-binding proteins uncovers key regulators of virus infection
Bằng: Garcia Moreno, M, et al.
Được phát hành: (2019)