Joint modelling of diffusion MRI and microscopy

Joint modelling of diffusion MRI and microscopy

The combination of diffusion MRI with microscopy provides unique opportunities to study microstructural features of tissue, particularly when acquired in the same sample. Microscopy is frequently used to validate diffusion MRI microstructure models, addressing the indirect nature of dMRI signals. Ty...

Ամբողջական նկարագրություն

Մատենագիտական մանրամասներ
Հիմնական հեղինակներ:	Howard, A, Mollink, J, Kleinnijenhuis, M, Pallebage-Gamarallage, M, Bastiani, M, Cottaar, M, Miller, K, Jbabdi, S
Ձևաչափ:	Journal article
Հրապարակվել է:	Elsevier 2019

Նմանատիպ նյութեր

Diffusion MRI fibre orientation dispersion estimates evaluated with polarized light imaging and histological analysis
‌: Mollink, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

Evaluating fibre orientation dispersion in white matter: Comparison of diffusion MRI, histology and polarized light imaging.
‌: Mollink, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

An open resource combining multi-contrast MRI and microscopy in the macaque brain
‌: Howard, AFD, և այլն
Հրապարակվել է: (2023)

An automated pipeline for extracting histological stain area fraction for voxelwise quantitative MRI-histology comparisons
‌: Kor, DZL, և այլն
Հրապարակվել է: (2022)

Choice of reference measurements affects quantification of long diffusion time behaviour using stimulated echoes
‌: Kleinnijenhuis, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

Automated quality control for within and between studies diffusion MRI data using a non-parametric framework for movement and distortion correction
‌: Bastiani, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Estimating axial diffusivity in the NODDI model
‌: Howard, AF, և այլն
Հրապարակվել է: (2022)

An open resource combining multi-contrast MRI and microscopy in the macaque brain
‌: Amy F. D. Howard, և այլն
Հրապարակվել է: (2023-07-01)

Dissecting the pathobiology of altered MRI signal in amyotrophic lateral sclerosis: A post mortem whole brain sampling strategy for the integration of ultra-high-field MRI and quantitative neuropathology
‌: Pallebage-Gamarallage, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Modelling an equivalent b-value in diffusion-weighted steady-state free precession
‌: Tendler, B, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Microstructure imaging with diffusion MRI and microscopy
‌: Howard, A
Հրապարակվել է: (2020)

Dentatorubrothalamic tract localization with postmortem MR diffusion tractography compared to histological 3D reconstruction.
‌: Mollink, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2015)

An automated pipeline for extracting histological stain area fraction for voxelwise quantitative MRI-histology comparisons
‌: Daniel Z.L. Kor, և այլն
Հրապարակվել է: (2022-12-01)

Estimating axial diffusivity in the NODDI model
‌: Amy FD Howard, և այլն
Հրապարակվել է: (2022-11-01)

Identifying microstructural changes in diffusion MRI; How to circumvent parameter degeneracy
‌: Hossein Rafipoor, և այլն
Հրապարակվել է: (2022-10-01)

Quantifying myelin in crossing fibers using diffusion-prepared phase imaging: theory and simulations
‌: Cottaar, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2021)

White matter changes in the perforant path area in patients with amyotrophic lateral sclerosis
‌: Mollink, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Modelling fibre fanning in diffusion-weighted MRI.
‌: Sotiropoulos, SN, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

Diffusion tensor characteristics of gyrencephaly using high resolution diffusion MRI in vivo at 7T.
‌: Kleinnijenhuis, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2015)

Modelling white matter in gyral blades as a continuous vector field
‌: Cottaar, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Dissecting the pathobiology of altered MRI signal in amyotrophic lateral sclerosis: A post mortem whole brain sampling strategy for the integration of ultra-high-field MRI and quantitative neuropathology
‌: Menuka Pallebage-Gamarallage, և այլն
Հրապարակվել է: (2018-03-01)

Methods for quantitative susceptibility and R2* mapping in whole post-mortem brains at 7T applied to amyotrophic lateral sclerosis
‌: Wang, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Functional and diffusion MRI reveal the neurophysiological basis of neonates’ noxious-stimulus evoked brain activity
‌: Baxter, L, և այլն
Հրապարակվել է: (2021)

The spatial correspondence and genetic influence of interhemispheric connectivity with white matter microstructure
‌: Mollink, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

The spatial correspondence and genetic influence of interhemispheric connectivity with white matter microstructure
‌: Mollink, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Tensor image registration library: Deformable registration of stand‐alone histology images to whole‐brain post‐mortem MRI data
‌: Istvan N. Huszar, և այլն
Հրապարակվել է: (2023-01-01)

A gyral coordinate system predictive of fibre orientations
‌: Cottaar, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Use of multi-flip angle measurements to account for transmit inhomogeneity and non-Gaussian diffusion in DW-SSFP.
‌: Tendler, BC, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Improved fibre dispersion estimation using b-tensor encoding
‌: Cottaar, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Improved tractography using asymmetric fibre orientation distributions
‌: Bastiani, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

Automated processing pipeline for neonatal diffusion MRI in the developing Human Connectome Project
‌: Bastiani, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Cross-Subject Comparison of Local Diffusion MRI Parameters
‌: Smith, S, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

Connectivity-based segmentation of the periaqueductal gray matter in human with brainstem optimized diffusion MRI.
‌: Ezra, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

Structure Tensor Informed Fiber Tractography (STIFT) by combining gradient echo MRI and diffusion weighted imaging.
‌: Kleinnijenhuis, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

A method to remove the influence of fixative concentration on postmortem T2 maps using a kinetic tensor model
‌: Tendler, BC, և այլն
Հրապարակվել է: (2021)

RubiX: combining spatial resolutions for Bayesian inference of crossing fibers in diffusion MRI.
‌: Sotiropoulos, SN, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

Ball and rackets: Inferring fiber fanning from diffusion-weighted MRI.
‌: Sotiropoulos, SN, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

Human cortical connectome reconstruction from diffusion weighted MRI: the effect of tractography algorithm.
‌: Bastiani, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

Functional and diffusion MRI reveal the neurophysiological basis of neonates’ noxious-stimulus evoked brain activity
‌: Luke Baxter, և այլն
Հրապարակվել է: (2021-05-01)

Using GPUs to accelerate computational diffusion MRI: From microstructure estimation to tractography and connectomes
‌: Hernandez-Fernandez, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)