An improved method for quantitative ChIP studies of nuclear receptor function

An improved method for quantitative ChIP studies of nuclear receptor function

Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is a valuable tool for the endocrine researcher, providing a means to measure the recruitment of hormone-activated nuclear receptors, for example. However, the technique can be challenging to perform and has multiple experimental steps, risking introduction of er...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Hunter, A, Narang, N, Baxter, M, Ray, D, Poolman, T
Định dạng:	Journal article
Được phát hành:	Bioscientifica 2019

Những quyển sách tương tự

Impact of artefact removal on ChIP quality metrics in ChIP-seq and ChIP-exo data.
Bằng: Thomas Samuel Carroll, et al.
Được phát hành: (2014-04-01)

Comparison of sample preparation methods for ChIP-chip assays
Bằng: Henriette O'Geen, et al.
Được phát hành: (2006-11-01)

Analysis of the mouse embryonic stem cell regulatory networks obtained by ChIP-chip and ChIP-PET
Bằng: Mathur, Divya, et al.
Được phát hành: (2010)

Impact of genome assembly status on ChIP-Seq and ChIP-PET data mapping
Bằng: Sachs Laurent, et al.
Được phát hành: (2009-12-01)

Fish the ChIPs: a pipeline for automated genomic annotation of ChIP-Seq data
Bằng: Minucci Saverio, et al.
Được phát hành: (2011-10-01)

Quantitative ChIP-seq by Adding Spike-in from Another Species
Bằng: Kongyan Niu, et al.
Được phát hành: (2018-08-01)

Epigenomic profiling of archived FFPE tissues by enhanced PAT-ChIP (EPAT-ChIP) technology
Bằng: Stefano Amatori, et al.
Được phát hành: (2018-11-01)

ChIP-Seq in Candida albicans
Bằng: Sadri Znaidi, et al.
Được phát hành: (2014-06-01)

Simplified ChIP-exo assays
Bằng: Matthew J. Rossi, et al.
Được phát hành: (2018-07-01)

An integrated workflow for analysis of ChIP-chip data
Bằng: Karin Weigelt, et al.
Được phát hành: (2008-08-01)

Optimising oligonucleotide array design for ChIP-on-chip
Bằng: Birney Ewan, et al.
Được phát hành: (2007-11-01)

Normalization and experimental design for ChIP-chip data
Bằng: Alekseyenko Artyom A, et al.
Được phát hành: (2007-06-01)

ChIP on Chip: surprising results are often artifacts
Bằng: Skarstad Kirsten, et al.
Được phát hành: (2010-07-01)

Analyzing ChIP-chip data using bioconductor.
Bằng: Joern Toedling, et al.
Được phát hành: (2008-11-01)

Probing the cohesin loading reaction using forward genetics and quantitative ChIP-sequencing
Bằng: Petela, N
Được phát hành: (2016)

ChIPseqR: analysis of ChIP-seq experiments
Bằng: Helliwell Chris A, et al.
Được phát hành: (2011-01-01)

De novo ChIP-seq analysis
Bằng: He, Xin, et al.
Được phát hành: (2015)

Dual agarose magnetic (DAM) ChIP
Bằng: Balakrishnan Lata, et al.
Được phát hành: (2009-12-01)

Modeling ChIP sequencing in silico with applications.
Bằng: Zhengdong D Zhang, et al.
Được phát hành: (2008-08-01)

Shape-based peak identification for ChIP-Seq
Bằng: Evans Steven N, et al.
Được phát hành: (2011-01-01)

A widespread distribution of genomic CeMyoD binding sites revealed and cross validated by ChIP-Chip and ChIP-Seq techniques.
Bằng: Haiyan Lei, et al.
Được phát hành: (2010-12-01)

Ringo – an R/Bioconductor package for analyzing ChIP-chip readouts
Bằng: Huber Wolfgang, et al.
Được phát hành: (2007-06-01)

Parameter estimation for robust HMM analysis of ChIP-chip data
Bằng: Humburg Peter, et al.
Được phát hành: (2008-08-01)

Bayesian modeling of ChIP-chip data using latent variables
Bằng: Tian Yanan, et al.
Được phát hành: (2009-10-01)

aFARP-ChIP-seq, a convenient and reliable method for genome profiling in as few as 100 cells with a capability for multiplexing ChIP-seq
Bằng: Wenbin Liu, et al.
Được phát hành: (2019-09-01)

A flexible ChIP-sequencing simulation toolkit
Bằng: Zheng, An, et al.
Được phát hành: (2021)

Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Bằng: Zhang, Yong, et al.
Được phát hành: (2010)

In silico pooling of ChIP-seq control experiments.
Bằng: Guannan Sun, et al.
Được phát hành: (2014-01-01)

CATCHprofiles: clustering and alignment tool for ChIP profiles.
Bằng: Fiona G G Nielsen, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

HaloChIP-seq for Antibody-Independent Mapping of Mouse Transcription Factor Cistromes in vivo
Bằng: Ann Louise Hunter, et al.
Được phát hành: (2022-07-01)

Improvement of the Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Assay by DNA Fragment Size Fractionation
Bằng: Trina A. Johnson, et al.
Được phát hành: (2001-10-01)

The Triform algorithm: improved sensitivity and specificity in ChIP-Seq peak finding
Bằng: Kornacker Karl, et al.
Được phát hành: (2012-07-01)

WACS: improving ChIP-seq peak calling by optimally weighting controls
Bằng: Aseel Awdeh, et al.
Được phát hành: (2021-02-01)

Starr: Simple Tiling ARRay analysis of Affymetrix ChIP-chip data
Bằng: Tresch Achim, et al.
Được phát hành: (2010-04-01)

A Brazilian version of the "Children's Interview for Psychiatric Syndromes" (ChIPS) A versão brasileira do "Children's Interview for Psychiatric Syndromes" (ChIPS)
Bằng: Isabella G. S. de Souza, et al.
Được phát hành: (2009-01-01)

Novel sequential ChIP and simplified basic ChIP protocols for promoter co-occupancy and target gene identification in human embryonic stem cells
Bằng: Elayaperumal Anuratha, et al.
Được phát hành: (2009-06-01)

About the variability, quality and reproducibility of ChIP-seq data
Bằng: Hamzavi-Pinon Violaine, et al.
Được phát hành: (2016-06-01)

RNA Chromatin Immunoprecipitation (RNA-ChIP) in Caenorhabditis elegans
Bằng: Germano Cecere, et al.
Được phát hành: (2014-12-01)

Illumina Sequencing Library Construction from ChIP DNA
Bằng: Wei Zheng
Được phát hành: (2012-02-01)

Histone modification ChIP-seq on Arabidopsis thaliana Plantlets
Bằng: Juan Ramirez-Prado, et al.
Được phát hành: (2021-11-01)