Comparing two sequential Monte Carlo samplers for exact and approximate Bayesian inference on biological models

Comparing two sequential Monte Carlo samplers for exact and approximate Bayesian inference on biological models

Bayesian methods are advantageous for biological modeling studies due to their ability to quantify and characterize posterior variability in model parameters. When Bayesian methods cannot be applied, due either to nondeterminism in the model or limitations on system observability, approximate Bayesi...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Daly, A, Cooper, J, Gavaghan, D, Holmes, C
Materyal Türü:	Journal article
Baskı/Yayın Bilgisi:	Royal Society 2017

Benzer Materyaller

Sequential Monte Carlo samplers
Yazar:: Del Moral, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

Interacting sequential Monte Carlo samplers for trans-dimensional simulation
Yazar:: Jasra, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

Monte Carlo samplers for efficient network inference.
Yazar:: Zeliha Kilic, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-07-01)

Approximating multivariate posterior distribution functions from Monte Carlo samples for sequential Bayesian inference.
Yazar:: Bram Thijssen, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020-01-01)

Evolutionary Sequential Monte Carlo Samplers for Change-Point Models
Yazar:: Arnaud Dufays
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016-03-01)

An adaptive sequential Monte Carlo method for approximate Bayesian computation
Yazar:: Del Moral, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

An adaptive sequential Monte Carlo method for approximate Bayesian computation
Yazar:: Del Moral, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Stability of sequential Monte Carlo samplers via the Foster-Lyapunov condition
Yazar:: Jasra, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

Stability of sequential Monte Carlo samplers via the Foster-Lyapunov condition
Yazar:: Jasra, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

Multifidelity approximate Bayesian computation with sequential Monte Carlo parameter sampling
Yazar:: Prescott, TP, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Monte Carlo algorithsm for Bayesian inference
Yazar:: Pompe, E
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Sequential Monte Carlo methods for demographic inference
Yazar:: Henderson, D
Baskı/Yayın Bilgisi: (2017)

Biological Network Inference With GRASP: A Bayesian Network Structure Learning Method Using Adaptive Sequential Monte Carlo
Yazar:: Kaixian Yu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-11-01)

Model Selection and Parameter Estimation for an Improved Approximate Bayesian Computation Sequential Monte Carlo Algorithm
Yazar:: Yue Deng, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-01-01)

On sequential Monte Carlo sampling methods for Bayesian filtering
Yazar:: Doucet, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2000)

Parameter estimation from aggregate observations: a Wasserstein distance-based sequential Monte Carlo sampler
Yazar:: Chen Cheng, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-08-01)

Adaptive Hamiltonian and Riemann Manifold Monte Carlo Samplers
Yazar:: Wang, Z, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Optimization of mesh hierarchies in multilevel Monte Carlo samplers
Yazar:: Haji-Ali, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Multifidelity multilevel Monte Carlo to accelerate approximate Bayesian parameter inference for partially observed stochastic processes
Yazar:: Warne, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Markov chain Monte Carlo : stochastic simulation for Bayesian inference /
Yazar:: 360681 Gamerman, Dani, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

“Exact” and Approximate Methods for Bayesian Inference: Stochastic Volatility Case Study
Yazar:: Yuliya Shapovalova
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-04-01)

Bayesian optimization with informative parametric models via sequential Monte Carlo
Yazar:: Rafael Oliveira, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-01-01)

A sequential Monte Carlo algorithm for inference of subclonal structure in cancer.
Yazar:: Oyetunji E Ogundijo, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-01-01)

SeqClone: sequential Monte Carlo based inference of tumor subclones
Yazar:: Oyetunji E. Ogundijo, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-01-01)

Hodgkin-Huxley revisited: reparameterization and identifiability analysis of the classic action potential model with approximate Bayesian methods
Yazar:: Daly, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Hodgkin–Huxley revisited: reparametrization and identifiability analysis of the classic action potential model with approximate Bayesian methods
Yazar:: Daly, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Robust Inference of Dynamic Covariance Using Wishart Processes and Sequential Monte Carlo
Yazar:: Hester Huijsdens, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024-08-01)

Kernel sequential Monte Carlo
Yazar:: Schuster, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2017)

Controlled sequential Monte Carlo
Yazar:: Heng, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Sequential Monte Carlo with transformations
Yazar:: Everitt, RG, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

Sequential Monte Carlo in sequence
Yazar:: Nur Nabihah Rusyda, Roslan, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Quantum self-learning Monte Carlo and quantum-inspired Fourier transform sampler
Yazar:: Katsuhiro Endo, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020-12-01)

Hodgkin–Huxley revisited: reparametrization and identifiability analysis of the classic action potential model with approximate Bayesian methods
Yazar:: Aidan C. Daly, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015-01-01)

Inference for Levy-Driven Stochastic Volatility Models via Adaptive Sequential Monte Carlo
Yazar:: Jasra, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

Sequential Monte Carlo for inference of latent ARMA time-series with innovations correlated in time
Yazar:: Iñigo Urteaga, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2017-12-01)

Approximate Bayesian Inference
Yazar:: Pierre Alquier
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020-11-01)

Calibrating the Discrete Boundary Conditions of a Dynamic Simulation: A Combinatorial Approximate Bayesian Computation Sequential Monte Carlo (ABC-SMC) Approach
Yazar:: Jah Shamas, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024-07-01)

Auto-encoding sequential Monte Carlo
Yazar:: Le, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018)

Measuring diachronic sense change: new models and Monte Carlo methods for Bayesian inference
Yazar:: Zafar, S, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Photometric Calibrations of M-dwarf Metallicity with Markov Chain Monte Carlo and Bayesian Inference
Yazar:: C. Duque-Arribas, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-01-01)