Inferring genomic flux in bacteria.

Inferring genomic flux in bacteria.

Acquisition and loss of genetic material are essential forces in bacterial microevolution. They have been repeatedly linked with adaptation of lineages to new lifestyles, and in particular, pathogenicity. Comparative genomics has the potential to elucidate this genetic flux, but there are many metho...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Didelot, X, Darling, A, Falush, D
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2009

Những quyển sách tương tự

Inference of homologous recombination in bacteria using whole-genome sequences.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2010)

Inference of bacterial microevolution using multilocus sequence data.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2007)

Impact of homologous and non-homologous recombination in the genomic evolution of Escherichia coli
Bằng: Didelot Xavier, et al.
Được phát hành: (2012-06-01)

ClonalFrameML: efficient inference of recombination in whole bacterial genomes
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2015)

Genome-wide association mapping in bacteria?
Bằng: Falush, D, et al.
Được phát hành: (2006)

Toward the use of genomics to study microevolutionary change in bacteria.
Bằng: Daniel Falush
Được phát hành: (2009-10-01)

A Bayesian approach to inferring the phylogenetic structure of communities from metagenomic data.
Bằng: O'Brien, J, et al.
Được phát hành: (2014)

SimMLST: simulation of multi-locus sequence typing data under a neutral model.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2009)

A bimodal pattern of relatedness between the Salmonella Paratyphi A and Typhi genomes: convergence or divergence by homologous recombination?
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2007)

ClonalFrameML: efficient inference of recombination in whole bacterial genomes.
Bằng: Xavier Didelot, et al.
Được phát hành: (2015-02-01)

Genealogical typing of Neisseria meningitidis.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2009)

Evolution of pathogenicity in the Bacillus cereus group.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2009)

Genome plasticity during chronic infection with H-pylori
Bằng: Kennemann, L, et al.
Được phát hành: (2008)

Bayesian inference of the evolution of a phenotype distribution on a phylogenetic tree
Bằng: Ansari, M, et al.
Được phát hành: (2016)

Epistasis, core-genome disharmony, and adaptation in recombining bacteria
Bằng: Taylor, AJ, et al.
Được phát hành: (2024)

Inference of recombination properties in bacteria from whole genomes
Bằng: Ansari, M
Được phát hành: (2014)

Inference of population structure using dense haplotype data.
Bằng: Lawson, D, et al.
Được phát hành: (2012)

Mosaic DNA imports with interspersions of recipient sequence after natural transformation of Helicobacter pylori.
Bằng: Kulick, S, et al.
Được phát hành: (2008)

A comparison of homologous recombination rates in bacteria and archaea.
Bằng: Vos, M, et al.
Được phát hành: (2009)

Helicobacter pylori genome evolution during human infection.
Bằng: Kennemann, L, et al.
Được phát hành: (2011)

Inferring human colonization history using a copying model.
Bằng: Garrett Hellenthal, et al.
Được phát hành: (2008-05-01)

Mismatch induced speciation in Salmonella: model and data.
Bằng: Falush, D, et al.
Được phát hành: (2006)

Correction: Inferring Human Colonization History Using a Copying Model.
Bằng: Garrett Hellenthal, et al.
Được phát hành: (2008-06-01)

Inference and prediction of metabolic network fluxes.
Bằng: Nikoloski, Z, et al.
Được phát hành: (2015)

Bayesian inference of ancestral dates on bacterial phylogenetic trees
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2018)

Inference of population structure using dense haplotype data.
Bằng: Daniel John Lawson, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

Epistasis, core-genome disharmony, and adaptation in recombining bacteria
Bằng: Aidan J. Taylor, et al.
Được phát hành: (2024-06-01)

Sequencing of seven haloarchaeal genomes reveals patterns of genomic flux.
Bằng: Erin A Lynch, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

Germs, genomes and genealogies.
Bằng: Wilson, D, et al.
Được phát hành: (2005)

Microevolution of Helicobacter pylori during prolonged infection of single hosts and within families.
Bằng: Morelli, G, et al.
Được phát hành: (2010)

An examination of speciation in recombining bacteria: The relationship between Campylobacter jejuni and Campylobacter coli
Bằng: Sheppard, S, et al.
Được phát hành: (2007)

Interplay of recombination and selection in the genomes of Chlamydia trachomatis.
Bằng: Joseph, S, et al.
Được phát hành: (2011)

Progressive genome-wide introgression in agricultural Campylobacter coli.
Bằng: Sheppard, S, et al.
Được phát hành: (2013)

Transforming clinical microbiology with bacterial genome sequencing.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2012)

Inferred basal friction and mass flux affected by crystal-orientation fabrics
Bằng: Nicholas M. Rathmann, et al.
Được phát hành: (2022-04-01)

SimBac: simulation of whole bacterial genomes with homologous recombination
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2015)

Colistin resistance in Gram-negative bacteria analysed by five phenotypic assays and inference of the underlying genomic mechanisms
Bằng: Diana Albertos Torres, et al.
Được phát hành: (2021-11-01)

Fidelity of hyperbolic space for Bayesian phylogenetic inference.
Bằng: Matthew Macaulay, et al.
Được phát hành: (2023-04-01)

Simultaneous inference of phylogenetic and transmission trees in infectious disease outbreaks.
Bằng: Don Klinkenberg, et al.
Được phát hành: (2017-05-01)

Progressive genome-wide introgression in agricultural Campylobacter coli
Bằng: Sheppard, S, et al.
Được phát hành: (2013)