Extensive regulation of the non-coding transcriptome by hypoxia: role of HIF in releasing paused RNApol2.

Extensive regulation of the non-coding transcriptome by hypoxia: role of HIF in releasing paused RNApol2.

Ցույց տալ այլ տարբերակներ (1)

Hypoxia is central to both ischaemic and neoplastic diseases. However, the non-coding transcriptional response to hypoxia is largely uncharacterized. We undertook integrated genomic analyses of both non-coding and coding transcripts using massively parallel sequencing and interfaced this data with p...

Ամբողջական նկարագրություն

Մատենագիտական մանրամասներ
Հիմնական հեղինակներ:	Choudhry, H, Schödel, J, Oikonomopoulos, S, Camps, C, Grampp, S, Harris, A, Ratcliffe, P, Ragoussis, J, Mole, D
Ձևաչափ:	Journal article
Լեզու:	English
Հրապարակվել է:	2014

Նմանատիպ նյութեր

Extensive regulation of the non-coding transcriptome by hypoxia: role of HIF in releasing paused RNApol2
‌: Choudhry, H, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

High-resolution genome-wide mapping of HIF-binding sites by ChIP-seq.
‌: Schödel, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Hypoxia drives glucose transporter 3 expression through HIF-mediated induction of the long non-coding RNA NICI
‌: Lauer, V, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Tumor hypoxia induces nuclear paraspeckle formation through HIF-2α dependent transcriptional activation of NEAT1 leading to cancer cell survival.
‌: Choudhry, H, և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

Genome-wide association of hypoxia-inducible factor (HIF)-1alpha and HIF-2alpha DNA binding with expression profiling of hypoxia-inducible transcripts.
‌: Mole, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2009)

Multiple renal cancer susceptibility polymorphisms modulate the HIF pathway.
‌: Grampp, S, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

Pan-genomic binding of hypoxia-inducible transcription factors.
‌: Schödel, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)

Multiple renal cancer susceptibility polymorphisms modulate the HIF pathway.
‌: Steffen Grampp, և այլն
Հրապարակվել է: (2017-07-01)

Tuning the transcriptional response to hypoxia by inhibiting HIF prolyl- and asparaginyl-hydroxylases
‌: Chan, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

Integrated analysis of microRNA and mRNA expression and association with HIF binding reveals the complexity of microRNA expression regulation under hypoxia
‌: Camps, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

HIF-1 and HIF-2: working alone or together in hypoxia?
‌: Ratcliffe, P
Հրապարակվել է: (2007)

Signalling hypoxia by HIF hydroxylases.
‌: Schofield, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2005)

Regulation of type II transmembrane serine proteinase TMPRSS6 by hypoxia-inducible factors: new link between hypoxia signaling and iron homeostasis.
‌: Lakhal, S, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Genetic variation at the 8q24.21 renal cancer susceptibility locus affects HIF binding to a MYC enhancer
‌: Grampp, S, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

Predominant role of hypoxia-inducible transcription factor (Hif)-1alpha versus Hif-2alpha in regulation of the transcriptional response to hypoxia.
‌: Sowter, H, և այլն
Հրապարակվել է: (2003)

Multi-level interaction between HIF and AHR transcriptional pathways in kidney carcinoma
‌: Lafleur, VN, և այլն
Հրապարակվել է: (2023)

Concordant regulation of gene expression by hypoxia and 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase inhibition: the role of HIF-1alpha, HIF-2alpha, and other pathways.
‌: Elvidge, G, և այլն
Հրապարակվել է: (2006)

The tumour hypoxia induced non-coding transcriptome.
‌: Choudhry, H, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

Mechanisms of hypoxia signalling: new implications for nephrology
‌: Schödel, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Toll-like receptor activation and hypoxia use distinct signaling pathways to stabilize hypoxia-inducible factor 1α (HIF1A) and result in differential HIF1A-dependent gene expression
‌: Jantsch, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Toll-like receptor activation and hypoxia use distinct signaling pathways to stabilize hypoxia-inducible factor 1α (HIF1A) and result in differential HIF1A-dependent gene expression.
‌: Jantsch, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Regulation of angiogenesis by hypoxia: role of the HIF system.
‌: Pugh, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2003)

Regulation of Jumonji-domain-containing histone demethylases by hypoxia-inducible factor (HIF)-1alpha.
‌: Pollard, P, և այլն
Հրապարակվել է: (2008)

Regulation of HIF: prolyl hydroxylases.
‌: Stolze, I, և այլն
Հրապարակվել է: (2006)

Pan-cancer analysis of tissue and single-cell HIF-pathway activation using a conserved gene signature
‌: Lombardi, O, և այլն
Հրապարակվել է: (2022)

Inherent DNA‐binding specificities of the HIF‐1α and HIF‐2α transcription factors in chromatin
‌: Smythies, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Capture-C reveals preformed chromatin interactions between HIF-binding sites and distant promoters
‌: Platt, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

Capture‐C reveals preformed chromatin interactions between HIF‐binding sites and distant promoters
‌: Platt, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

Genetic variation at the 8q24.21 renal cancer susceptibility locus affects HIF binding to a MYC enhancer
‌: Steffen Grampp, և այլն
Հրապարակվել է: (2016-10-01)

Hypoxia, hypoxia-inducible factors (HIF), HIF hydroxylases and oxygen sensing.
‌: Webb, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2009)

Human AlkB homologue 5 is a nuclear 2-oxoglutarate dependent oxygenase and a direct target of hypoxia-inducible factor 1(Alpha) (HIF-1(Alpha)).
‌: Thalhammer, A, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Role of hypoxia-inducible factor-1 (HIF-1) is angiogenesis and tumour biology
‌: Ratcliffe, P
Հրապարակվել է: (1999)

The lysyl oxidases LOX and LOXL2 are necessary and sufficient to repress E-cadherin in hypoxia: insights into cellular transformation processes mediated by HIF-1.
‌: Schietke, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2010)

Regulation of the HIF pathway: enzymatic hydroxylation of a conserved prolyl residue in hypoxia-inducible factor alpha subunits governs capture by the pVHL E3 ubiquitin ligase complex.
‌: Mole, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2002)

Human AlkB homologue 5 is a nuclear 2-oxoglutarate dependent oxygenase and a direct target of hypoxia-inducible factor 1α (HIF-1α).
‌: Armin Thalhammer, և այլն
Հրապարակվել է: (2011-01-01)

Common genetic variants at the 11q13.3 renal cancer susceptibility locus influence binding of HIF to an enhancer of cyclin D1 expression
‌: Schödel, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

Common genetic variants at the 11q13.3 renal cancer susceptibility locus influence binding of HIF to an enhancer of cyclin D1 expression.
‌: Schödel, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

Common genetic variants at the 11q13.3 renal cancer susceptibility locus influence binding of HIF to an enhancer of cyclin D1 expression
‌: Schödel, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2012)

Structure of factor-inhibiting hypoxia-inducible factor (HIF) reveals mechanism of oxidative modification of HIF-1 alpha.
‌: Elkins, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2003)

Contrasting properties of hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1) and HIF-2 in von Hippel-Lindau-associated renal cell carcinoma.
‌: Raval, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2005)