Amplicon sequencing as a potential surveillance tool for complexity of infection and drug resistance markers in Plasmodium falciparum asymptomatic infections

Amplicon sequencing as a potential surveillance tool for complexity of infection and drug resistance markers in Plasmodium falciparum asymptomatic infections

<p><strong><i>Background.</i></strong> Genotyping <i>Plasmodium falciparum</i> subpopulations in malaria infections is an important aspect of malaria molecular epidemiology to understand within-host diversity and the frequency of drug resistance markers.<...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Wamae, K, Kimenyi, KM, Osoti, V, de Laurent, ZR, Ndwiga, L, Kharabora, O, Hathaway, NJ, Bailey, JA, Juliano, JJ, Bejon, P, Ochola-Oyier, LI
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	Oxford University Press 2022

Схожі ресурси

Maintenance of high temporal Plasmodium falciparum genetic diversity and complexity of infection in asymptomatic and symptomatic infections in Kilifi, Kenya from 2007 to 2018
за авторством: Kimenyi, KM, та інші
Опубліковано: (2022)

Understanding P. falciparum asymptomatic infections: a proposition for a transcriptomic approach
за авторством: Kimenyi, KM, та інші
Опубліковано: (2019)

Maintenance of high temporal Plasmodium falciparum genetic diversity and complexity of infection in asymptomatic and symptomatic infections in Kilifi, Kenya from 2007 to 2018
за авторством: Kelvin M. Kimenyi, та інші
Опубліковано: (2022-06-01)

Understanding P. falciparum Asymptomatic Infections: A Proposition for a Transcriptomic Approach
за авторством: Kelvin M. Kimenyi, та інші
Опубліковано: (2019-10-01)

The Plasmodium falciparum Rh5 invasion protein complex reveals an excess of rare variant mutations
за авторством: Ndwiga, L, та інші
Опубліковано: (2021)

A cross-sectional analysis identifies a low prevalence of Plasmodium ovale species infections in symptomatic and asymptomatic individuals in Kilifi county, Kenya. [version 4; peer review: 2 approved]
за авторством: Leonard Ndwiga, та інші
Опубліковано: (2024-09-01)

The Plasmodium falciparum Rh5 invasion protein complex reveals an excess of rare variant mutations
за авторством: Leonard Ndwiga, та інші
Опубліковано: (2021-06-01)

Targeted amplicon deep sequencing for monitoring antimalarial resistance markers in western Kenya
за авторством: Osoti, V, та інші
Опубліковано: (2022)

No evidence of P. falciparum K13 artemisinin conferring mutations over a 24-year analysis in Coastal Kenya, but a near complete reversion to chloroquine wild type parasites
за авторством: Wamae, K, та інші
Опубліковано: (2019)

Targeted amplicon deep sequencing of ama1 and mdr1 to track within-host P. falciparum diversity throughout treatment in a clinical drug trial [version 4; peer review: 2 approved, 2 approved with reservations]
за авторством: Mainga Hamaluba, та інші
Опубліковано: (2024-03-01)

Targeted amplicon deep sequencing of ama1 and mdr1 to track within-host P. falciparum diversity throughout treatment in a clinical drug trial [version 3; peer review: 2 approved, 2 approved with reservations]
за авторством: Mainga Hamaluba, та інші
Опубліковано: (2023-10-01)

Targeted amplicon deep sequencing of ama1 and mdr1 to track within-host P. falciparum diversity throughout treatment in a clinical drug trial [version 2; peer review: 2 approved, 1 approved with reservations]
за авторством: Mainga Hamaluba, та інші
Опубліковано: (2022-12-01)

Transmission and age impact the risk of developing febrile malaria in children with asymptomatic Plasmodium falciparum parasitemia
за авторством: Wamae, K, та інші
Опубліковано: (2018)

Low frequency of Plasmodium falciparum hrp2/3 deletions from symptomatic infections at a primary healthcare facility in Kilifi, Kenya
за авторством: Dorcas Okanda, та інші
Опубліковано: (2023-02-01)

A review of the frequencies of Plasmodium falciparum Kelch 13 artemisinin resistance mutations in Africa
за авторством: Ndwiga, L, та інші
Опубліковано: (2021)

A review of the frequencies of Plasmodium falciparum Kelch 13 artemisinin resistance mutations in Africa
за авторством: Leonard Ndwiga, та інші
Опубліковано: (2021-08-01)

Distinct transcriptomic signatures define febrile malaria depending on initial infective states, asymptomatic or uninfected
за авторством: Kimenyi, KM, та інші
Опубліковано: (2024)

Comparison of allele frequencies of Plasmodium falciparum merozoite antigens in malaria infections sampled in different years in a Kenyan population.
за авторством: Ochola-Oyier, L, та інші
Опубліковано: (2016)

Detection of low-density Plasmodium falciparum infections using amplicon deep sequencing
за авторством: Angela M. Early, та інші
Опубліковано: (2019-07-01)

Detection of low frequency artemisinin resistance mutations, C469Y, P553L and A675V, and fixed antifolate resistance mutations in asymptomatic primary school children in Kenya
за авторством: Osoti, V, та інші
Опубліковано: (2025)

A deep sequencing approach to estimate Plasmodium falciparum complexity of infection (COI) and explore apical membrane antigen 1 diversity
за авторством: Robin H. Miller, та інші
Опубліковано: (2017-12-01)

Prevalence of <it>Plasmodium falciparum </it>infection in asymptomatic rural Gabonese populations
за авторством: Gonzalez Jean-Paul, та інші
Опубліковано: (2011-02-01)

ONT sequencing identifies a high prevalence of crt sensitive, triple mutant dhfr and single mutant dhps parasites within an ANC population in Nigeria
за авторством: Adebanjo Jonathan Adegbola, та інші
Опубліковано: (2024-10-01)

Few Plasmodium falciparum merozoite ligand and erythrocyte receptor pairs show evidence of balancing selection
за авторством: Ochola-Oyier, L, та інші
Опубліковано: (2019)

Asymptomatic infection with Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax in the Brazilian Amazon Basin: to treat or not to treat?
за авторством: Mauro Shugiro Tada, та інші
Опубліковано: (2012-08-01)

Marked Rise in the Prevalence of Asymptomatic Plasmodium falciparum Infection in Rural Gabon.
за авторством: Irène Pegha Moukandja, та інші
Опубліковано: (2016-01-01)

Characterization of T cell activation and regulation in children with asymptomatic Plasmodium falciparum infection
за авторством: Augustina Frimpong, та інші
Опубліковано: (2018-07-01)

Detection of low frequency artemisinin resistance mutations, C469Y, P553L and A675V, and fixed antifolate resistance mutations in asymptomatic primary school children in Kenya
за авторством: Victor Osoti, та інші
Опубліковано: (2025-01-01)

Distinct transcriptomic signatures define febrile malaria depending on initial infective states, asymptomatic or uninfected
за авторством: Kelvin M. Kimenyi, та інші
Опубліковано: (2024-01-01)

Genotyping Plasmodium falciparum gametocytes using amplicon deep sequencing
за авторством: Jimmy Vareta, та інші
Опубліковано: (2024-04-01)

Clustering of asymptomatic Plasmodium falciparum infection and the effectiveness of targeted malaria control measures
за авторством: Jeffrey G. Shaffer, та інші
Опубліковано: (2020-01-01)

Plasmodium falciparum genetic diversity and multiplicity of infection among asymptomatic and symptomatic malaria-infected individuals in Uganda
за авторством: Alex Mwesigwa, та інші
Опубліковано: (2024-11-01)

Dynamics in multiplicity of Plasmodium falciparum infection among children with asymptomatic malaria in central Ghana
за авторством: Akua Kyerewaa Botwe, та інші
Опубліковано: (2017-07-01)

Trends in multiplicity of <it>Plasmodium falciparum</it> infections among asymptomatic residents in the middle belt of Ghana
за авторством: Agyeman-Budu Akua, та інші
Опубліковано: (2013-01-01)

Genotyping cognate Plasmodium falciparum in humans and mosquitoes to estimate onward transmission of asymptomatic infections
за авторством: Kelsey M. Sumner, та інші
Опубліковано: (2021-02-01)

Asymptomatic low-density Plasmodium falciparum infections: A challenge in malaria elimination in India
за авторством: Akansha Singh, та інші
Опубліковано: (2021-11-01)

Haplotype specific-sequencing reveals <it>MBL2 </it>association with asymptomatic <it>Plasmodium falciparum </it>infection
за авторством: Pedroso Maria, та інші
Опубліковано: (2009-05-01)

Gametocyte carriage after seasonal malaria chemoprevention in Plasmodium falciparum infected asymptomatic children
за авторством: Abdullahi Ahmad, та інші
Опубліковано: (2021-03-01)

Molecular epidemiology of Plasmodium falciparum by multiplexed amplicon deep sequencing in Senegal
за авторством: Tolla Ndiaye, та інші
Опубліковано: (2020-11-01)

Characterization of blood dendritic and regulatory T cells in asymptomatic adults with sub-microscopic Plasmodium falciparum or Plasmodium vivax infection.
за авторством: Kho, S, та інші
Опубліковано: (2016)