RNA pseudoknots and the regulation of protein synthesis.

RNA pseudoknots and the regulation of protein synthesis.

Näytä muut versiot (1)

RNA pseudoknots are structural elements found in almost all classes of RNA. Pseudoknots form when a single-stranded region in the loop of a hairpin base-pairs with a stretch of complementary nucleotides elsewhere in the RNA chain. This simple folding strategy is capable of generating a large number...

Bibliografiset tiedot
Päätekijät:	Brierley, I, Gilbert, R, Pennell, S
Aineistotyyppi:	Journal article
Kieli:	English
Julkaistu:	2008

Samankaltaisia teoksia

RNA pseudoknots and the regulation of protein synthesis
Tekijä: Brierley, I, et al.
Julkaistu: (2008)

Viral RNA pseudoknots: Versatile motifs in gene expression and replication
Tekijä: Brierley, I, et al.
Julkaistu: (2007)

Viral RNA pseudoknots: versatile motifs in gene expression and replication.
Tekijä: Brierley, I, et al.
Julkaistu: (2007)

A mechanical explanation of RNA pseudoknot function in programmed ribosomal frameshifting.
Tekijä: Namy, O, et al.
Julkaistu: (2006)

An algebraic language for RNA pseudoknots comparison
Tekijä: Michela Quadrini, et al.
Julkaistu: (2019-04-01)

Sequence-structure relations of pseudoknot RNA
Tekijä: Li Linda YM, et al.
Julkaistu: (2009-01-01)

Inverse folding of RNA pseudoknot structures
Tekijä: Li Linda YM, et al.
Julkaistu: (2010-06-01)

RNA pseudoknot prediction in energy-based models.
Tekijä: Lyngsø, R, et al.
Julkaistu: (2000)

Sparsification of RNA structure prediction including pseudoknots
Tekijä: Mohl, Mathias, et al.
Julkaistu: (2011)

Sparsification of RNA structure prediction including pseudoknots
Tekijä: Backofen Rolf, et al.
Julkaistu: (2010-12-01)

Efficient known ncRNA search including pseudoknots
Tekijä: Yuan Cheng, et al.
Julkaistu: (2013-01-01)

New models and algorithms for RNA pseudoknot order assignment
Tekijä: Zok Tomasz, et al.
Julkaistu: (2020-06-01)

Automated design of dynamic programming schemes for RNA folding with pseudoknots
Tekijä: Bertrand Marchand, et al.
Julkaistu: (2023-12-01)

Syntactic Pattern Recognition for the Prediction of L-Type Pseudoknots in RNA
Tekijä: Christos Koroulis, et al.
Julkaistu: (2023-04-01)

Multi-objective genetic algorithm for pseudoknotted RNA sequence design
Tekijä: Akito eTaneda
Julkaistu: (2012-04-01)

Salt-Dependent RNA Pseudoknot Stability: Effect of Spatial Confinement
Tekijä: Chenjie Feng, et al.
Julkaistu: (2021-04-01)

Prediction of RNA secondary structure with pseudoknots using integer programming
Tekijä: Akutsu Tatsuya, et al.
Julkaistu: (2009-01-01)

Complexity of pseudoknot prediction in simple models
Tekijä: Lyngsø, R
Julkaistu: (2004)

Targeting simian retrovirus type 1 RNA pseudoknot with small molecules
Tekijä: Lau, Qing Yi
Julkaistu: (2019)

TransUFold: Unlocking the structural complexity of short and long RNA with pseudoknots
Tekijä: Yunxiang Wang, et al.
Julkaistu: (2023-10-01)

Prediction of RNA pseudoknots using heuristic modeling with mapping and sequential folding.
Tekijä: Wayne K Dawson, et al.
Julkaistu: (2007-09-01)

ATTfold: RNA Secondary Structure Prediction With Pseudoknots Based on Attention Mechanism
Tekijä: Yili Wang, et al.
Julkaistu: (2020-12-01)

Classifying Conserved RNA Secondary Structures With Pseudoknots by Vector-Edit Distance
Tekijä: Liyu Huang, et al.
Julkaistu: (2021-01-01)

Bi-objective integer programming for RNA secondary structure prediction with pseudoknots
Tekijä: Audrey Legendre, et al.
Julkaistu: (2018-01-01)

Automatic generation of pseudoknotted RNAs taxonomy
Tekijä: Michela Quadrini, et al.
Julkaistu: (2023-06-01)

Monovalent ions modulate the flux through multiple folding pathways of an RNA pseudoknot
Tekijä: Roca, Jorjethe, et al.
Julkaistu: (2019)

An adaptive defect weighted sampling algorithm to design pseudoknotted RNA secondary structures
Tekijä: Kasra Zandi, et al.
Julkaistu: (2016-07-01)

Free energy landscape and multiple folding pathways of an H-type RNA pseudoknot.
Tekijä: Yunqiang Bian, et al.
Julkaistu: (2015-01-01)

A three-stemmed mRNA pseudoknot in the SARS coronavirus frameshift signal.
Tekijä: Ewan P Plant, et al.
Julkaistu: (2005-06-01)

New Frameshifting Pseudoknot Found in SARS Virus.
Julkaistu: (2005-06-01)

Molecular dynamics simulation of stretching-force-induced H-type RNA pseudoknot unfolding
Tekijä: Seah, Yi Ling
Julkaistu: (2016)

Predicting 3D structure and stability of RNA pseudoknots in monovalent and divalent ion solutions.
Tekijä: Ya-Zhou Shi, et al.
Julkaistu: (2018-06-01)

SparseRNAfolD: optimized sparse RNA pseudoknot-free folding with dangle consideration
Tekijä: Mateo Gray, et al.
Julkaistu: (2024-03-01)

Knotify: An Efficient Parallel Platform for RNA Pseudoknot Prediction Using Syntactic Pattern Recognition
Tekijä: Christos Andrikos, et al.
Julkaistu: (2022-02-01)

Knotify+: Toward the Prediction of RNA H-Type Pseudoknots, Including Bulges and Internal Loops
Tekijä: Evangelos Makris, et al.
Julkaistu: (2023-02-01)

aRNAque: an evolutionary algorithm for inverse pseudoknotted RNA folding inspired by Lévy flights
Tekijä: Nono S. C. Merleau, et al.
Julkaistu: (2022-08-01)

Crystal structure and functional studies of a viral RNA pseudoknot involved in ribosomal frameshifting
Tekijä: Su, Li, 1971-
Julkaistu: (2014)

Possible involvement of three-stemmed pseudoknots in regulating translational initiation in human mRNAs.
Tekijä: Xiaolan Huang, et al.
Julkaistu: (2024-01-01)

Crumple: a method for complete enumeration of all possible pseudoknot-free RNA secondary structures.
Tekijä: Samuel Bleckley, et al.
Julkaistu: (2012-01-01)

Insights into factorless translational initiation by the tRNA-like pseudoknot domain of a viral IRES.
Tekijä: Hilda H T Au, et al.
Julkaistu: (2012-01-01)