Genome-Wide Association Analysis of Imputed Rare Variants: Application to Seven Common Complex Diseases

Genome-Wide Association Analysis of Imputed Rare Variants: Application to Seven Common Complex Diseases

Показати інші версії (1)

Genome-wide association studies have been successful in identifying loci contributing effects to a range of complex human traits. The majority of reproducible associations within these loci are with common variants, each of modest effect, which together explain only a small proportion of heritabilit...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Mägi, R, Asimit, J, Day-Williams, A, Zeggini, E, Morris, A
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	2012

Схожі ресурси

Genome-wide association analysis of imputed rare variants: application to seven common complex diseases.
за авторством: Mägi, R, та інші
Опубліковано: (2012)

ARIEL and AMELIA: testing for an accumulation of rare variants using next-generation sequencing data.
за авторством: Asimit, J, та інші
Опубліковано: (2012)

Genome-wide association analysis of rare variants with type 2 diabetes
за авторством: Maegi, R, та інші
Опубліковано: (2011)

The effect of genome-wide association scan quality control on imputation outcome for common variants.
за авторством: Southam, L, та інші
Опубліковано: (2011)

The effect of genome-wide association scan quality control on imputation outcome for common variants.
за авторством: Southam, L, та інші
Опубліковано: (2011)

Genome-Wide Association Analysis Of Rare Variants With Crohn's Disease
за авторством: Magi, R, та інші
Опубліковано: (2012)

GRANVIL: Rare Variant Analysis of Genome-Wide Association Studies
за авторством: Magi, R, та інші
Опубліковано: (2010)

Genome-wide association analysis of rare variants identifies potential novel susceptibility genes for type 1 diabetes and coronary artery disease
за авторством: Magi, R, та інші
Опубліковано: (2012)

Genome-wide Association Analysis of Rare Variants Identifies Potential Novel Susceptibility Genes for Type 1 Diabetes and Coronary Artery Disease
за авторством: Morris, A, та інші
Опубліковано: (2012)

Improved imputation accuracy of rare and low-frequency variants using population-specific high-coverage WGS-based imputation reference panel
за авторством: Mitt, Mario, та інші
Опубліковано: (2018)

Analyzing the Korean reference genome with meta-imputation increased the imputation accuracy and spectrum of rare variants in the Korean population
за авторством: Mi Yeong Hwang, та інші
Опубліковано: (2022-11-01)

Comparison of methods for transcriptome imputation through application to two common complex diseases
за авторством: Fryett, J, та інші
Опубліковано: (2018)

Performance of genotype imputation for low frequency and rare variants from the 1000 genomes.
за авторством: Hou-Feng Zheng, та інші
Опубліковано: (2015-01-01)

SEAD reference panel with 22,134 haplotypes boosts rare variant imputation and genome-wide association analysis in Asian populations
за авторством: Meng-Yuan Yang, та інші
Опубліковано: (2024-12-01)

An evaluation of statistical approaches to rare variant analysis in genetic association studies.
за авторством: Morris, A, та інші
Опубліковано: (2010)

CCRaVAT and QuTie-enabling analysis of rare variants in large-scale case control and quantitative trait association studies.
за авторством: Lawrence, R, та інші
Опубліковано: (2010)

Genotype imputation for genome-wide association studies.
за авторством: Marchini, J, та інші
Опубліковано: (2010)

Exploring Impact of Rare Variation in Systemic Lupus Erythematosus by a Genome Wide Imputation Approach
за авторством: Manuel Martínez-Bueno, та інші
Опубліковано: (2019-02-01)

Genome-Wide Identification of Rare and Common Variants Driving Triglyceride Levels in a Nevada Population
за авторством: Robert W. Read, та інші
Опубліковано: (2021-03-01)

Common or rare variants for complex traits?
за авторством: Munafò, MR, та інші
Опубліковано: (2014)

Application Of A Novel Method For Testing Gene-Gene Interactions To Genome-Wide Association Studies Of Seven Complex Human Diseases
за авторством: Bhattacharya, K, та інші
Опубліковано: (2012)

Investigating the Effect of Imputed Structural Variants from Whole-Genome Sequence on Genome-Wide Association and Genomic Prediction in Dairy Cattle
за авторством: Long Chen, та інші
Опубліковано: (2021-02-01)

Using imputation to investigate association of low-frequency variants with adiposity in the 1966 Northern Finnish birth cohort
за авторством: O'Connell, J, та інші
Опубліковано: (2010)

Evaluating the effects of imputation on the power, coverage, and cost efficiency of genome-wide SNP platforms.
за авторством: Anderson, C, та інші
Опубліковано: (2008)

Imputation Performance in Latin American Populations: Improving Rare Variants Representation With the Inclusion of Native American Genomes
за авторством: Andrés Jiménez-Kaufmann, та інші
Опубліковано: (2022-01-01)

GWAMA: software for genome-wide association meta-analysis
за авторством: Mägi, R, та інші
Опубліковано: (2010)

Imputation performance in Latin American populations: improving rare variants representation with the inclusion of native American genomes
за авторством: Jiménez-Kaufmann, Andrés, та інші
Опубліковано: (2022)

Extended analysis of genome-wide scans provides clues about novel common and rare susceptibility loci for type 2 diabetes
за авторством: Zeggini, E, та інші
Опубліковано: (2008)

Identification of novel putative rheumatoid arthritis susceptibility genes via analysis of rare variants
за авторством: Morris, A, та інші
Опубліковано: (2009)

Genome wide association study of nonsynonymous Single Nucleotide Polymorphisms for seven common diseases
за авторством: Stanton Alice, та інші
Опубліковано: (2010-12-01)

The impact of imputation on meta-analysis of genome-wide association studies.
за авторством: Jian Li, та інші
Опубліковано: (2012-01-01)

CCRaVAT and QuTie - enabling analysis of rare variants in large-scale case control and quantitative trait association studies
за авторством: Elliott Katherine S, та інші
Опубліковано: (2010-10-01)

Rare variants create synthetic genome-wide associations.
за авторством: Samuel P Dickson, та інші
Опубліковано: (2010-01-01)

Associations of single nucleotide polymorphisms with mucinous colorectal cancer: genome-wide common variant and gene-based rare variant analyses
за авторством: Michelle E. Penney, та інші
Опубліковано: (2018-06-01)

Imputation of sequence variants for identification of genetic risks for Parkinson's disease: a meta-analysis of genome-wide association studies
за авторством: Nalls, M, та інші
Опубліковано: (2011)

Assessing the impact of missing genotype data in rare variant association analysis.
за авторством: Mägi, R, та інші
Опубліковано: (2011)

Large-scale genome-wide association meta-analysis of the 1000 genomes project imputed data identifies 19 novel lipid loci and new variants in previously known loci
за авторством: Prokopenko, I, та інші
Опубліковано: (2013)

ProbABEL package for genome-wide association analysis of imputed data
за авторством: Struchalin Maksim V, та інші
Опубліковано: (2010-03-01)

Meta-analysis of sex-specific genome-wide association studies.
за авторством: Magi, R, та інші
Опубліковано: (2010)

GWAMA: software for genome-wide association meta-analysis
за авторством: Mägi Reedik, та інші
Опубліковано: (2010-05-01)