Genetics of gene expression in primary immune cells identifies cell type-specific master regulators and roles of HLA alleles

Genetics of gene expression in primary immune cells identifies cell type-specific master regulators and roles of HLA alleles

Показати інші версії (1)

Trans-acting genetic variants have a substantial, albeit poorly characterized, role in the heritable determination of gene expression. Using paired purified primary monocytes and B cells, we identify new predominantly cell type-specific cis and trans expression quantitative trait loci (eQTLs), inclu...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Fairfax, B, Makino, S, Radhakrishnan, J, Plant, K, Leslie, S, Dilthey, A, Ellis, P, Langford, C, Vannberg, F, Knight, J
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	2012

Схожі ресурси

Genetics of gene expression in primary immune cells identifies cell type-specific master regulators and roles of HLA alleles.
за авторством: Fairfax, B, та інші
Опубліковано: (2012)

HLA*IMP - an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes
за авторством: Dilthey, A, та інші
Опубліковано: (2011)

HLA*IMP--an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes.
за авторством: Dilthey, A, та інші
Опубліковано: (2011)

HLA-A locus alleles identified by sequence specific PCR.
за авторством: Krausa, P, та інші
Опубліковано: (1993)

Associations of HLA alleles with specific language impairment.
за авторством: Nudel, R, та інші
Опубліковано: (2014)

Fine mapping genetic determinants of the highly variably expressed MHC gene ZFP57
за авторством: Plant, K, та інші
Опубліковано: (2014)

Fine mapping genetic determinants of the highly variably expressed MHC gene ZFP57.
за авторством: Plant, K, та інші
Опубліковано: (2014)

A common haplotype of the TNF receptor 2 gene modulates endotoxin tolerance.
за авторством: Fairfax, B, та інші
Опубліковано: (2011)

HLA-B*57 Micropolymorphism shapes HLA allele-specific epitope immunogenicity, selection pressure, and HIV immune control.
за авторством: Kloverpris, H, та інші
Опубліковано: (2012)

Additive contribution of HLA class I alleles in the immune control of HIV-1 infection.
за авторством: Leslie, A, та інші
Опубліковано: (2010)

HLA allele-specific expression: Methods, disease associations, and relevance in hematopoietic stem cell transplantation
за авторством: Tiira Johansson, та інші
Опубліковано: (2022-09-01)

Comparison of Tagging and Imputation for HLA Allele Prediction and Association Testing
за авторством: Shen, J, та інші
Опубліковано: (2010)

An integrated expression phenotype mapping approach defines common variants in LEP, ALOX15 and CAPNS1 associated with induction of IL-6.
за авторством: Fairfax, B, та інші
Опубліковано: (2010)

HLA RNA Sequencing With Unique Molecular Identifiers Reveals High Allele-Specific Variability in mRNA Expression
за авторством: Tiira Johansson, та інші
Опубліковано: (2021-02-01)

Interrogating genetic variation in the HLA using high throughput technologies
за авторством: McVean, G, та інші
Опубліковано: (2012)

Association of HLA alleles with autism
за авторством: Sayad A, та інші
Опубліковано: (2018-11-01)

Detection of HLA-specific IGG antibodies using single recombinant HLA alleles: the MonoLISA assay.
за авторством: Barnardo, M, та інші
Опубліковано: (2000)

Allele-specific repression of lymphotoxin-alpha by activated B cell factor-1.
за авторством: Knight, J, та інші
Опубліковано: (2004)

Analysis of allele-specific gene expression.
за авторством: Knight, J
Опубліковано: (2006)

Allele-specific gene expression uncovered.
за авторством: Knight, J
Опубліковано: (2004)

HLA autoimmune risk alleles restrict the hypervariable region of T cell receptors
за авторством: Ishigaki, K, та інші
Опубліковано: (2022)

HLA allele and haplotype frequencies of registered stem cell donors in Chile
за авторством: Ute V. Solloch, та інші
Опубліковано: (2023-05-01)

Pervasiveness of HLA allele-specific expression loss across tumor types
за авторством: Ioan Filip, та інші
Опубліковано: (2023-02-01)

Association of specific HLA alleles and haplotypes with pemphigus vulgaris in the Bulgarian population
за авторством: Kossara Drenovska, та інші
Опубліковано: (2022-08-01)

Memory B Cells, the HLA-B*57 Allele and Natural Control of HIV Infection
за авторством: Rob J. Center
Опубліковано: (2017-07-01)

Statistical HLA type imputation from large and heterogeneous datasets
за авторством: Dilthey, A
Опубліковано: (2012)

CLASSICAL HLA TYPE IMPUTATION FOR MULTI-POPULATION STUDIES
за авторством: Dilthey, A, та інші
Опубліковано: (2012)

Allele specific gene expression in the major histocompatibility complex
за авторством: Plant, K
Опубліковано: (2012)

HLA Alleles Associate with Insulin Autoimmune Syndrome
за авторством: Yao D, та інші
Опубліковано: (2024-09-01)

Comparison of HLA allelic imputation programs.
за авторством: Jason H Karnes, та інші
Опубліковано: (2017-01-01)

HLA-A LOCUS SPECIFICITIES IDENTIFIED BY SEQUENCE SPECIFIC PCR
за авторством: Krausa, P, та інші
Опубліковано: (1993)

Multi-population classical HLA type imputation
за авторством: Dilthey, A, та інші
Опубліковано: (2013)

HIV specific T cell responses and response patterns associated with viral control independent of classical non-progessor HLA class I alleles
за авторством: Zuniga, R, та інші
Опубліковано: (2009)

HLA typing in a Kenyan cohort identifies novel class I alleles that restrict cytotoxic T-cell responses to local HIV-1 clades.
за авторством: Bird, T, та інші
Опубліковано: (2002)

Analysis of HLA allele-specific antibodies and Eplets in patients with platelet transfusion refractoriness
за авторством: Bing ZHANG, та інші
Опубліковано: (2022-09-01)

P09-03. HLA class I alleles impact on HIV-1 disease progression by interacting with immunoregulatory HLA receptors on dendritic cells
за авторством: Huang J
Опубліковано: (2009-10-01)

HLA class I alleles tag HLA-DRB1*1501 haplotypes for differential risk in multiple sclerosis susceptibility.
за авторством: Chao, M, та інші
Опубліковано: (2008)

Association of HLA-A and Non-Classical HLA Class I Alleles.
за авторством: Federico Carlini, та інші
Опубліковано: (2016-01-01)

A statistical method for predicting classical HLA alleles from SNP data.
за авторством: Leslie, S, та інші
Опубліковано: (2008)

World distribution of HLA alleles and implications for disease - Discussion
за авторством: Kidd, K, та інші
Опубліковано: (1996)