The evolution of contact prediction: Evidence that contact selection in statistical contact prediction is changing

The evolution of contact prediction: Evidence that contact selection in statistical contact prediction is changing

Motivation Over the last few years, the field of protein structure prediction has been transformed by increasingly accurate contact prediction software. These methods are based on the detection of coevolutionary relationships between residues from multiple sequence alignments (MSAs). However, despit...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Chonofsky, M, de Oliveira, S, Krawczyk, K, Deane, C
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	Oxford University Press 2019

Những quyển sách tương tự

Indirect contact predicts direct contact: Longitudinal evidence and the mediating role of intergroup anxiety
Bằng: Wölfer, R, et al.
Được phát hành: (2018)

Contact prediction is hardest for the most informative contacts, but improves with the incorporation of contact potentials.
Bằng: Jack Holland, et al.
Được phát hành: (2018-01-01)

ContactPFP: Protein Function Prediction Using Predicted Contact Information
Bằng: Yuki Kagaya, et al.
Được phát hành: (2022-06-01)

Mutual information and variants for protein domain-domain contact prediction.
Bằng: Gomes, M, et al.
Được phát hành: (2012)

Mutual information and variants for protein domain-domain contact prediction
Bằng: Gomes Mireille, et al.
Được phát hành: (2012-08-01)

Improved contact predictions using the recognition of protein like contact patterns.
Bằng: Marcin J Skwark, et al.
Được phát hành: (2014-11-01)

i-Patch: interprotein contact prediction using local network information.
Bằng: Hamer, R, et al.
Được phát hành: (2010)

The evolution of logic circuits for the purpose of protein contact map prediction
Bằng: Samuel D. Chapman, et al.
Được phát hành: (2017-04-01)

Predicting epidemic evolution on contact networks from partial observations.
Bằng: Jacopo Bindi, et al.
Được phát hành: (2017-01-01)

Prediction of contact resistance of electrical contact wear using different machine learning algorithms
Bằng: Zhen-bing Cai, et al.
Được phát hành: (2024-01-01)

Causality and prediction: differences and points of contact
Bằng: Luis Carlos Silva Ayçaguer, PhD
Được phát hành: (2014-09-01)

Contact fatigue : life prediction and palliatives
Bằng: Conner, Brett P. (Brett Page), 1975-
Được phát hành: (2005)

Individual-level patterns of resource selection do not predict hotspots of contact
Bằng: Anni Yang, et al.
Được phát hành: (2023-11-01)

Formation and Evolution of Contact Binaries
Bằng: Peter P. Eggleton
Được phát hành: (2012-06-01)

EnContact: predicting enhancer-enhancer contacts using sequence-based deep learning model
Bằng: Mingxin Gan, et al.
Được phát hành: (2019-09-01)

Contact graphs of boxes with unidirectional contacts
Bằng: Daniel Gonçalves, et al.
Được phát hành: (2024-05-01)

Contacting Stability of Sliding Electrical Contacts
Bằng: Plokhov Igor, et al.
Được phát hành: (2021-01-01)

Probabilistic prediction of contacts in protein-ligand complexes.
Bằng: Riku Hakulinen, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

Evaluation Of The Masonry Concrete Arch Structural Response And Prediction Of Crack Using Non-Contact And Contact Technique
Bằng: Salleh, Nadia Syahiera
Được phát hành: (2022)

A Fractal Prediction Method for Contact Stiffness of Helical Gear Considering Asperity Lateral Contact and Interaction
Bằng: Xiangyang Xu, et al.
Được phát hành: (2023-11-01)

Effect of Contact Geometry on the Contact Stresses in a Flat with Round Edge Contact
Bằng: Pankaj Dhaka, et al.
Được phát hành: (2019-03-01)

Effect of contact geometry on the contact stresses in a flat with rounded edge contact
Bằng: Pankaj Dhaka, et al.
Được phát hành: (2019-04-01)

ESTIMATION METHODOLOGY OF HEATING THE CONTACT PLACE OF CONTACT WIRE WITH CONTACT STRIP OF PANTOGRAPH
Bằng: А. М. Mukha, et al.
Được phát hành: (2020-08-01)

Predictability modulates neural response to eye contact in ASD
Bằng: Adam J. Naples, et al.
Được phát hành: (2022-10-01)

Optimal contact definition for reconstruction of Contact Maps
Bằng: Stehr Henning, et al.
Được phát hành: (2010-05-01)

INTERGROUP CONTACT AND STEREOTYPE CHANGE
Bằng: Brown, R, et al.
Được phát hành: (1992)

Role of mutual information for predicting contact residues in proteins
Bằng: Gomes, M
Được phát hành: (2012)

Contact
Được phát hành: (1989)

Contact
Được phát hành: ([19-)

Work Hardening and Change in Contact Condition of Rolling Contact Surface with Plastic Deformation
Bằng: Takeshi Yoshimi, et al.
Được phát hành: (2009-01-01)

Further Validation of a Simple Mathematical Description of Wear and Contact Pressure Evolution in Sliding Contacts
Bằng: Francesca Di Puccio, et al.
Được phát hành: (2023-05-01)

Use of temporal contact graphs to understand the evolution of COVID-19 through contact tracing data
Bằng: Mincheng Wu, et al.
Được phát hành: (2022-11-01)

An analysis of contact stiffness and frictional receding contacts
Bằng: Parel, KS
Được phát hành: (2017)

The role of ingroup contact in intergroup contact theory
Bằng: Bracegirdle, CA
Được phát hành: (2020)

Contact and Non-contact Measurements of Grinding Pins
Bằng: Magdziak Marek, et al.
Được phát hành: (2015-01-01)

The role of contact richness in mediated intergroup contact: a test of the contact space framework
Bằng: Kim, Nuri, et al.
Được phát hành: (2022)

Membrane protein contact and structure prediction using co-evolution in conjunction with machine learning.
Bằng: Pedro L Teixeira, et al.
Được phát hành: (2017-01-01)

Elastic and Elastoplastic Contact Mechanics of Concentrated Coated Contacts
Bằng: Patricia M. Johns-Rahnejat, et al.
Được phát hành: (2024-05-01)

Prediction of long-range contacts in protein tertiary structures
Bằng: Soh, Lam Soon.
Được phát hành: (2009)

Contact network modelling for the infectious disease spread predictions
Bằng: Liu, Wanrui
Được phát hành: (2022)