The free-energy landscape of a mechanically bistable DNA origami

The free-energy landscape of a mechanically bistable DNA origami

Molecular simulations using coarse-grained models allow the structure, dynamics and mechanics of DNA origamis to be comprehensively characterized. Here, we focus on the free-energy landscape of a jointed DNA origami that has been designed to exhibit two mechanically stable states and for which a bis...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Wong, CK, Doye, JPK
Materyal Türü:	Journal article
Dil:	English
Baskı/Yayın Bilgisi:	MDPI 2022

Benzer Materyaller

Characterizing the free-energy landscapes of DNA origamis
Yazar:: Wong, CK, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

The Free-Energy Landscape of a Mechanically Bistable DNA Origami
Yazar:: Chak Kui Wong, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-06-01)

Simulation data for "The Free-Energy Landscape of a Mechanically Bistable DNA Origami"
Yazar:: Wong, C K, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Self-limiting polymerization of DNA origami subunits with strain accumulation
Yazar:: Berengut, JF, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Final configuration files for umbrella sampling in "Characterizing the free-energy landscapes of DNA origamis"
Yazar:: Doye, J
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Understanding the free energy landscapes and self-limiting assembly of DNA origamis using coarse-grained modelling
Yazar:: Wong, CK
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Chiral shape fluctuations and the origin of chirality in cholesteric phases of DNA origamis
Yazar:: Tortora, MMC, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Direct simulation of the self-assembly of a small DNA origami
Yazar:: Snodin, BEK, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

Untethered bistable origami crawler for confined applications
Yazar:: Catherine Jiayi Cai, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024-10-01)

Free energy landscapes of DNA and its assemblies: perspectives from coarse-grained modelling
Yazar:: Doye, JPK, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Input files for example oxDNA simulations of DNA origami
Yazar:: Doye, J
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Bistable Helical Origami Gripper for Sensor Placement on Branches
Yazar:: Christian Geckeler, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-10-01)

TacoxDNA: A user-friendly web server for simulations of complex DNA structures, from single strands to origami
Yazar:: Suma, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

Direct origami assembly oxDNA kymograph data
Yazar:: Snodin, B, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Reconfigurable T‐junction DNA origami
Yazar:: Young, K, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
Yazar:: Luu, MT, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024)

Force-induced unravelling of DNA origami
Yazar:: Engel, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018)

Coarse-grained modelling of the structural properties of DNA origami
Yazar:: Snodin, B, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

Elucidating the Mechanical Energy for Cyclization of a DNA Origami Tile
Yazar:: Ruixin Li, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-03-01)

Elucidating the Mechanical Energy for Cyclization of a DNA Origami Tile
Yazar:: Li, Ruixin, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

The effect of topology on the structure and free energy landscape of DNA kissing complexes.
Yazar:: Romano, F, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Planar 2D wireframe DNA origami
Yazar:: Wang, Xiao, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023)

A Flytrap‐Inspired Bistable Origami‐Based Gripper for Rapid Active Debris Removal
Yazar:: Yongchang Zhang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-07-01)

How to design an icosahedral quasicrystal through directional bonding
Yazar:: Noya, EG, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Mechanical Design of DNA Origami in the Classroom
Yazar:: Yuchen Wang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-03-01)

Invariant and smooth limit of discrete geometry folded from bistable origami leading to multistable metasurfaces
Yazar:: Ke Liu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-09-01)

Measuring internal forces in single-stranded DNA: application to a DNA force clamp
Yazar:: Engel, MC, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Energy landscapes, scale-free networks and Apollonian packings
Yazar:: Doye, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

Autonomously designed free-form 2D DNA origami
Yazar:: Zhang, Fei, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

DNA origami assembly
Yazar:: Dunn, K, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

Network topology of a potential energy landscape: a static scale-free network.
Yazar:: Doye, J
Baskı/Yayın Bilgisi: (2002)

The interplay of supercoiling and thymine dimers in DNA
Yazar:: Lim, W, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Competitive annealing of multiple DNA origami: formation of chimeric origami
Yazar:: Jacob M Majikes, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016-01-01)

Mechanism of DNA origami folding elucidated by mesoscopic simulations
Yazar:: Marcello DeLuca, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024-04-01)

Free energy landscapes for homogeneous nucleation of ice for a monatomic water model.
Yazar:: Reinhardt, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Force-induced rupture of a DNA duplex: from fundamentals to force sensors
Yazar:: Mosayebi, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Simulation of reversible molecular mechanical logic gates and circuits
Yazar:: Seet, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023)

Computing the elastic mechanical properties of rodlike DNA nanostructures
Yazar:: Chhabra, H, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

The structural properties of DNA origami
Yazar:: Fowler, H
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

DNA Origami-Enabled Biosensors
Yazar:: Shuang Wang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020-12-01)