Structurally mapping antibody repertoires

Structurally mapping antibody repertoires

Every human possesses millions of distinct antibodies. It is now possible to analyze this diversity via next-generation sequencing of immunoglobulin genes (Ig-seq). This technique produces large volume sequence snapshots of B-cell receptors that are indicative of the antibody repertoire. In this pap...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Krawczyk, K, Kelm, S, Kovaltsuk, A, Snowden, J, Wright, M, Starkie, L, Scott-Tucker, A, Shi, J, Wong, W, Leem, J, Nowak, J, Regep, C, Deane, C, Truck, J, Kelly, D, Galson, J
Формат:	Journal article
Опубліковано:	Frontiers Media 2018

Схожі ресурси

Structurally Mapping Antibody Repertoires
за авторством: Konrad Krawczyk, та інші
Опубліковано: (2018-07-01)

Observed antibody space: a resource for data mining next generation sequencing of antibody repertoires
за авторством: Kovaltsuk, A, та інші
Опубліковано: (2018)

How B cell receptor repertoire sequencing can be enriched with structural antibody data
за авторством: Kovaltsuk, A, та інші
Опубліковано: (2017)

Filtering next-generation sequencing of the Ig gene repertoire data using antibody structural information
за авторством: Kovaltsuk, A, та інші
Опубліковано: (2018)

Filtering next-generation sequencing of the Ig gene repertoire data using antibody structural information
за авторством: Kovaltsuk, A, та інші
Опубліковано: (2018)

Structural diversity of B-cell receptor repertoires along the B-cell differentiation axis in humans and mice
за авторством: Kovaltsuk, A, та інші
Опубліковано: (2020)

Studying the antibody repertoire after vaccination: practical applications.
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2014)

Studying the antibody repertoire after vaccination: Practical applications
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2014)

Different B cell subpopulations show distinct patterns in their IgH repertoire metrics
за авторством: Ghraichy, M, та інші
Опубліковано: (2021)

SAbPred: a structure-based antibody prediction server
за авторством: Deane, C, та інші
Опубліковано: (2016)

Structural diversity of B-cell receptor repertoires along the B-cell differentiation axis in humans and mice.
за авторством: Aleksandr Kovaltsuk, та інші
Опубліковано: (2020-02-01)

Maturation of the human immunoglobulin heavy chain repertoire with age
за авторством: Ghraichy, M, та інші
Опубліковано: (2020)

Identification of antigen-specific B-cell receptor sequences from the total B-cell repertoire
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2016)

Different B cell subpopulations show distinct patterns in their IgH repertoire metrics
за авторством: Marie Ghraichy, та інші
Опубліковано: (2021-10-01)

Public Baseline and shared response structures support the theory of antibody repertoire functional commonality
за авторством: Raybould, MIJ, та інші
Опубліковано: (2021)

Maturation of the Human Immunoglobulin Heavy Chain Repertoire With Age
за авторством: Marie Ghraichy, та інші
Опубліковано: (2020-08-01)

Characterisation of the immune repertoire of a humanised transgenic mouse through immunophenotyping and high-throughput sequencing
за авторством: Eve Richardson, та інші
Опубліковано: (2023-03-01)

Identification of antigen-specific B cell receptor sequences using public repertoire analysis.
за авторством: Trück, J, та інші
Опубліковано: (2015)

Analysis of B cell repertoire dynamics following hepatitis B vaccination in humans, and enrichment of vaccine-specific antibody sequences
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2015)

In-depth assessment of within-individual and inter-individual variation in the B cell receptor repertoire
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2015)

Public Baseline and shared response structures support the theory of antibody repertoire functional commonality.
за авторством: Matthew I J Raybould, та інші
Опубліковано: (2021-03-01)

Looking for therapeutic antibodies in next-generation sequencing repositories
за авторством: Krawczyk, K, та інші
Опубліковано: (2019)

B cell repertoire dynamics after sequential Hepatitis B vaccination, and evidence for cross-reactive B cell activation
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2016)

Analysis of the human B cell repertoire following vaccination
за авторством: Galson, J
Опубліковано: (2016)

Looking for therapeutic antibodies in next-generation sequencing repositories
за авторством: Konrad Krawczyk, та інші
Опубліковано: (2019-10-01)

In-depth assessment of within-individual and inter-individual variation in the B cell receptor repertoire
за авторством: Jacob Daniel Galson, та інші
Опубліковано: (2015-10-01)

BCR repertoire sequencing: different patterns of B cell activation after two Meningococcal vaccines.
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2015)

BCR repertoire sequencing: Different patterns of B-cell activation after two Meningococcal vaccines
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2015)

Antibody–antigen complex modelling in the era of immunoglobulin repertoire sequencing
за авторством: Raybould, M, та інші
Опубліковано: (2019)

SCALOP: sequence-based antibody canonical loop structure annotation
за авторством: Wong, W, та інші
Опубліковано: (2018)

SAbDab: the structural antibody database
за авторством: Dunbar, J, та інші
Опубліковано: (2014)

SAbDab: the structural antibody database.
за авторством: Dunbar, J, та інші
Опубліковано: (2014)

Analysis of B Cell Repertoire Dynamics Following Hepatitis B Vaccination in Humans, and Enrichment of Vaccine-specific Antibody Sequences
за авторством: Jacob D. Galson, та інші
Опубліковано: (2015-12-01)

The H3 loop of antibodies shows unique structural characteristics
за авторством: Regep, C, та інші
Опубліковано: (2017)

A computational method for immune repertoire mining that identifies novel binders from different clonotypes, demonstrated by identifying anti-pertussis toxoid antibodies.
за авторством: Richardson, E, та інші
Опубліковано: (2021)

CoV-AbDab: the coronavirus antibody database
за авторством: Raybould, MIJ, та інші
Опубліковано: (2020)

Antibody side chain conformations are position-dependent
за авторством: Leem, J, та інші
Опубліковано: (2018)

Length-independent structural similarities enrich the antibody CDR canonical class model
за авторством: Nowak, J, та інші
Опубліковано: (2016)

Plasma cell antibody repertoire analysis following administration of meningococcal polysaccharide and protein-polysaccharide conjugate vaccines: evidence of distinct patterns of B cell activation
за авторством: Galson, J, та інші
Опубліковано: (2014)

Antibody i-Patch prediction of the antibody binding site improves rigid local antibody-antigen docking.
за авторством: Krawczyk, K, та інші
Опубліковано: (2013)