treespace: Statistical exploration of landscapes of phylogenetic trees.

treespace: Statistical exploration of landscapes of phylogenetic trees.

The increasing availability of large genomic data sets as well as the advent of Bayesian phylogenetics facilitates the investigation of phylogenetic incongruence, which can result in the impossibility of representing phylogenetic relationships using a single tree. While sometimes considered as a nui...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Jombart, T, Kendall, M, Almagro-Garcia, J, Colijn, C
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	Wiley 2017

Những quyển sách tương tự

Mapping phylogenetic trees to reveal distinct patterns of evolution
Bằng: Kendall, M, et al.
Được phát hành: (2016)

Statistical phylogenetic tree analysis using differences of means
Bằng: Elissaveta Arnaoudova, et al.
Được phát hành: (2010-08-01)

An efficient algorithm for statistical multiple alignment on arbitrary phylogenetic trees.
Bằng: Lunter, G, et al.
Được phát hành: (2003)

Integrative Phylogenetics: Tools for Palaeontologists to Explore the Tree of Life
Bằng: Raquel López-Antoñanzas, et al.
Được phát hành: (2022-08-01)

Simultaneous inference of phylogenetic and transmission trees in infectious disease outbreaks.
Bằng: Don Klinkenberg, et al.
Được phát hành: (2017-05-01)

Estimating transmission from genetic and epidemiological data: a metric to compare transmission trees
Bằng: Kendall, M, et al.
Được phát hành: (2018)

Employing phylogenetic tree shape statistics to resolve the underlying host population structure
Bằng: Hassan W. Kayondo, et al.
Được phát hành: (2021-11-01)

PhyloExplorer: a web server to validate, explore and query phylogenetic trees
Bằng: Auberval Nicolas, et al.
Được phát hành: (2009-05-01)

Network science inspires novel tree shape statistics.
Bằng: Leonid Chindelevitch, et al.
Được phát hành: (2021-01-01)

Spectral cluster supertree: fast and statistically robust merging of rooted phylogenetic trees
Bằng: Robert N. McArthur, et al.
Được phát hành: (2024-10-01)

Trees on networks: resolving statistical patterns of phylogenetic similarities among interacting proteins
Bằng: Kelly William P, et al.
Được phát hành: (2010-09-01)

Evaluation of phylogenetic reconstruction methods using bacterial whole genomes: a simulation based study
Bằng: Lees, JA, et al.
Được phát hành: (2018)

Taxonium, a web-based tool for exploring large phylogenetic trees
Bằng: Theo Sanderson
Được phát hành: (2022-11-01)

Operads and phylogenetic trees
Bằng: Baez, JC, et al.
Được phát hành: (2017)

Imputing Phylogenetic Trees Using Tropical Polytopes over the Space of Phylogenetic Trees
Bằng: Ruriko Yoshida
Được phát hành: (2023-08-01)

An exploration of the impact of phylogenetic tree structure on NTI and βNTI estimates of community assembly
Bằng: Madeleine J.S. Gundersen, et al.
Được phát hành: (2024-10-01)

Phylogenetics—A Web of Trees
Bằng: Tim Littlejohn
Được phát hành: (2000-09-01)

Geodesics to characterize the phylogenetic landscape.
Bằng: Marzieh Khodaei, et al.
Được phát hành: (2023-01-01)

TreeSnatcher plus: capturing phylogenetic trees from images
Bằng: Laubach Thomas, et al.
Được phát hành: (2012-05-01)

TreeVector: scalable, interactive, phylogenetic trees for the web.
Bằng: Ralph Pethica, et al.
Được phát hành: (2010-01-01)

The use of statistical phylogenetics in virology
Bằng: Yu. A. Vakulenko, et al.
Được phát hành: (2021-02-01)

Visual Browse and Exploration in Motion Capture Data with Phylogenetic Tree of Context-Aware Poses
Bằng: Songle Chen, et al.
Được phát hành: (2020-09-01)

Incongruencies in Vaccinia Virus Phylogenetic Trees
Bằng: Chad Smithson, et al.
Được phát hành: (2014-10-01)

Trees for landscaping /
Bằng: 340947 Mathur, L. M., et al.
Được phát hành: (1968)

Leaping through tree space: continuous phylogenetic inference for rooted and unrooted trees
Bằng: Penn, MJ, et al.
Được phát hành: (2023)

An exploration of how to define and measure the evolution of behavior, learning, memory and mind across the full phylogenetic tree of life
Bằng: E. M. Eisenstein, et al.
Được phát hành: (2016-05-01)

Phylogenetic trees: Grammar versus vocabulary
Bằng: Vladimir N. Polyakov, et al.
Được phát hành: (2022-03-01)

Erratum to “On the matrix condition of phylogenetic tree”
Được phát hành: (2021-09-01)

Pareto-optimal phylogenetic tree reconciliation
Bằng: Libeskind-Hadas, Ran, et al.
Được phát hành: (2015)

Phylogenetic trees and the future of mammalian biodiversity
Bằng: Grenyer, R
Được phát hành: (2008)

TreeCluster: Clustering biological sequences using phylogenetic trees.
Bằng: Metin Balaban, et al.
Được phát hành: (2019-01-01)

Random Tree Optimization for the Construction of the Most Parsimonious Phylogenetic Trees
Bằng: Li, Fulu, et al.
Được phát hành: (2010)

An efficient and extensible approach for compressing phylogenetic trees
Bằng: Williams Tiffani L, et al.
Được phát hành: (2011-10-01)

Dendroscope: An interactive viewer for large phylogenetic trees
Bằng: Franz Markus, et al.
Được phát hành: (2007-11-01)

A preliminary exploration of the cooling effect of tree shade in urban landscapes
Bằng: Qiuyan Yu, et al.
Được phát hành: (2020-10-01)

Iroki: automatic customization and visualization of phylogenetic trees
Bằng: Ryan M. Moore, et al.
Được phát hành: (2020-02-01)

Statistical Methods in Phylogenetic and Evolutionary Inferences
Bằng: Luigi Bertolotti, et al.
Được phát hành: (2013-05-01)

Exploring the multifunctional landscapes model in areas dominated by non-native tree plantations
Bằng: Andrea Monica D. Ortiz, et al.
Được phát hành: (2024-09-01)

TreeViewer: Flexible, modular software to visualise and manipulate phylogenetic trees
Bằng: Giorgio Bianchini, et al.
Được phát hành: (2024-02-01)

Minimum variance rooting of phylogenetic trees and implications for species tree reconstruction.
Bằng: Uyen Mai, et al.
Được phát hành: (2017-01-01)