Multiple sequence analysis in the presence of alignment uncertainty

Multiple sequence analysis in the presence of alignment uncertainty

<p>Sequence alignment is one of the most intensely studied problems in bioinformatics, and is an important step in a wide range of analyses. An issue that has gained much attention in recent years is the fact that downstream analyses are often highly sensitive to the specific choice of alignme...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Herman, J, Joseph Herman
Tác giả khác:	Hein, J
Định dạng:	Luận văn
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2014
Những chủ đề:	Probability Bioinformatics (life sciences) Stochastic processes Structural genomics Mathematical genetics and bioinformatics (statistics)

Những quyển sách tương tự

Evolution of highly fecund organisms
Bằng: Miller, L
Được phát hành: (2015)

Selection in a spatially structured population
Bằng: Straulino, D
Được phát hành: (2014)

Partly exchangeable fragmentations
Bằng: Chen, B
Được phát hành: (2009)

Bayesian methods for estimating human ancestry using whole genome SNP data
Bằng: Churchhouse, C
Được phát hành: (2012)

Importance sampling on the coalescent with recombination
Bằng: Jenkins, P, et al.
Được phát hành: (2008)

Statistical challenges in the detection of mutation and variation using high throughput sequencing
Bằng: Pfeifer, S
Được phát hành: (2012)

Simultaneous estimation of population size changes and splits times using importance sampling
Bằng: Forest, M
Được phát hành: (2014)

Lambda-Fleming-Viot processes and their spatial extensions
Bằng: Saadi, H
Được phát hành: (2011)

Fold recognition and alignment in the ‘twilight zone’
Bằng: Hill, J, et al.
Được phát hành: (2013)

An integrated genomic approach for the identification and analysis of single nucleotide polymorphisms that affect cancer in humans
Bằng: Repapi, E
Được phát hành: (2013)

Application of the Neutral Indel Model to genome sequences for diverse metazoans
Bằng: Meader, S
Được phát hành: (2010)

The estimation of recombination rates from population genetic data
Bằng: Auton, A
Được phát hành: (2007)

Design and analysis of genome-wide association studies
Bằng: Barrett, J
Được phát hành: (2008)

Large-scale genetic analysis of quantitative traits
Bằng: Randall, J, et al.
Được phát hành: (2012)

Protein fold evolution on completed genomes: distinguishing between young and old folds
Bằng: Abeln, S, et al.
Được phát hành: (2007)

Gene x gene interactions in genome wide association studies
Bằng: Bhattacharya, K
Được phát hành: (2014)

A method for the identification of biological pathways
Bằng: Honti, F
Được phát hành: (2014)

LD-based SNP and genotype calling from next-generation sequencing reads.
Bằng: Menelaou, A
Được phát hành: (2012)

On genetic variants underlying common disease
Bằng: Hechter, E
Được phát hành: (2011)

Multilocus sequence analysis of the pathogen Neisseria meningitidis
Bằng: Wilson, D
Được phát hành: (2005)

Exploring the fold space preferences of ancient and newborn protein superfamilies
Bằng: Edwards, H, et al.
Được phát hành: (2014)

Inferring the fine-scale structure and evolution of recombination from high-throughput genome sequencing
Bằng: Venn, O
Được phát hành: (2013)

NucleoFinder: a statistical approach for the detection of nucleosome positions
Bằng: Becker, J, et al.
Được phát hành: (2013)

Considerations for clinical read alignment and mutational profiling using next-generation sequencing
Bằng: Gavin R Oliver
Được phát hành: (2012-07-01)

Viewing multiple sequence alignments with the JavaScript Sequence Alignment Viewer (JSAV) [v1; ref status: indexed, http://f1000r.es/4io]
Bằng: Andrew C. R. Martin
Được phát hành: (2014-10-01)

Statistical HLA type imputation from large and heterogeneous datasets
Bằng: Dilthey, A
Được phát hành: (2012)

Statistical methods for the analysis of genetic association studies
Bằng: Su, Z
Được phát hành: (2008)

Genome annotation and selectional analysis of viral evolution
Bằng: de Groot, S
Được phát hành: (2008)

Comparative analysis of derived mutations across human populations.
Bằng: Feder, A, et al.
Được phát hành: (2013)

Imputation aided analysis of the association between autoimmune diseases and the MHC
Bằng: Moutsianas, L
Được phát hành: (2011)

Statistical methods for mapping complex traits
Bằng: Allchin, L
Được phát hành: (2014)

Statistical methods for genotype microarray data on large cohorts of individuals
Bằng: O'Connell, JM
Được phát hành: (2014)

The detection, structure and uses of extended haplotype identity in population genetic data
Bằng: Xifara, DK
Được phát hành: (2014)

Bayesian methods for fine mapping in genetic association studies
Bằng: Frangou, E
Được phát hành: (2013)

Probabilistic models of RNA secondary structure
Bằng: Anderson, JWJ
Được phát hành: (2013)

Bayesian and frequentist methods and analyses of genome-wide association studies
Bằng: Vukcevic, D
Được phát hành: (2009)

Considerations for clinical read alignment and mutational profiling using next-generation sequencing [v2; ref status: indexed, http://f1000r.es/NMpsFc]
Bằng: Gavin R Oliver
Được phát hành: (2012-09-01)

Comparison and evaluation of multiple sequence alignment tools in bininformatics
Bằng: Sedaghatinia, Asieh, et al.
Được phát hành: (2009)

Statistics for Bioinformatics : Methods for Multiple Sequence Alignment /
Bằng: Julie, Thompson
Được phát hành: (2016)

On linear dimension reduction based on diagonalization of scatter matrices for bioinformatics downstream analyses
Bằng: Daniel Fischer, et al.
Được phát hành: (2020-12-01)