Born to sense: biophysical analyses of the oxygen sensing prolyl hydroxylase from the simplest animal Trichoplax adhaerens

Born to sense: biophysical analyses of the oxygen sensing prolyl hydroxylase from the simplest animal Trichoplax adhaerens

<p><strong>Background:</strong> In humans and other animals, the chronic hypoxic response is mediated by hypoxia inducible transcription factors (HIFs) which regulate the expression of genes that counteract the effects of limiting oxygen. Prolyl hydroxylases (PHDs) act as hypoxia s...

Ամբողջական նկարագրություն

Մատենագիտական մանրամասներ
Հիմնական հեղինակներ:	Lippl, K, Boleininger, A, McDonough, M, Abboud, M, Tarhonskaya, H, Chowdhury, R, Loenarz, C, Schofield, C
Ձևաչափ:	Journal article
Հրապարակվել է:	Dove Medical Press 2018

Նմանատիպ նյութեր

The hypoxia-inducible transcription factor pathway regulates oxygen sensing in the simplest animal, Trichoplax adhaerens
‌: Loenarz, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2010)

The hypoxia-inducible transcription factor pathway regulates oxygen sensing in the simplest animal, Trichoplax adhaerens.
‌: Loenarz, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

The hypoxia-inducible transcription factor pathway regulates oxygen sensing in the simplest animal, Trichoplax adhaerens
‌: Loenarz, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Exploring the substrate selectivity of oxygen sensing prolyl hydroxylases
‌: Lippl, K, և այլն
Հրապարակվել է: (2015)

Biochemical and biophysical analyses of hypoxia sensing prolyl hydroxylases from Dictyostelium discoideum and Toxoplasma gondii
‌: Liu, T, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Evolution of PHDs as oxygen sensors: mechanistic and structural studies of the PHD of Trichoplax adhaerens, the simplest animal, and mechanistic studies of a PHD-like enzyme of the protist Monosiga brevicollis
‌: Boleininger, A
Հրապարակվել է: (2012)

Structural basis for binding of hypoxia-inducible factor to the oxygen-sensing prolyl hydroxylases.
‌: Chowdhury, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2009)

Studies on the substrate selectivity of the hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylase 2 catalytic domain
‌: Abboud, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Differentiation of Crystal Cells, Gravity-Sensing Cells in the Placozoan <i>Trichoplax adhaerens</i>
‌: Tatiana D. Mayorova
Հրապարակվել է: (2021-11-01)

Studies on spiro[4.5]decanone prolyl hydroxylase domain inhibitors
‌: Holt-Martyn, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Mass spectrometric studies on an oxygen sensing prolyl hydroxylase
‌: Mecinovic, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2007)

Substrate selectivity of prolyl hydroxylases
‌: McDonough, M
Հրապարակվել է: (2018)

2-Oxoglutarate analogue inhibitors of prolyl hydroxylase domain 2.
‌: Mecinović, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2009)

Inhibition of a viral prolyl hydroxylase
‌: Langley, G, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Structure of the ribosomal oxygenase OGFOD1 provides insights into the regio- and stereoselectivity of prolyl hydroxylases
‌: Horita, S, և այլն
Հրապարակվել է: (2015)

Structure–activity relationship and crystallographic studies on 4-hydroxypyrimidine HIF prolyl hydroxylase domain inhibitors
‌: Holt-Martyn, JP, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Structural basis of prolyl hydroxylase domain inhibition by Molidustat
‌: Figg, WD, և այլն
Հրապարակվել է: (2021)

Cellular oxygen sensing: Crystal structure of hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylase (PHD2).
‌: McDonough, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2006)

Kinetic rationale for selectivity toward N- and C-terminal oxygen-dependent degradation domain substrates mediated by a loop region of hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylases.
‌: Flashman, E, և այլն
Հրապարակվել է: (2008)

Cells containing aragonite crystals mediate responses to gravity in Trichoplax adhaerens (Placozoa), an animal lacking neurons and synapses.
‌: Tatiana D Mayorova, և այլն
Հրապարակվել է: (2018-01-01)

2-oxoglutarate regulates binding of hydroxylated hypoxia-inducible factor to prolyl hydroxylase domain 2
‌: Abboud, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Selective inhibitors of a human prolyl hydroxylase (OGFOD1) involved in ribosomal decoding
‌: Thinnes, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2018)

Mechanism of molecular oxygen diffusion in a hypoxia-sensing prolyl hydroxylase using multiscale simulation
‌: Domene, C, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Structural, biochemical and inhibition studies on hypoxia-inducible factor (HIF) prolyl hydroxylases
‌: Lippl, K
Հրապարակվել է: (2018)

Bioeffects of Prunus spinosa L. fruit ethanol extract on reproduction and phenotypic plasticity of Trichoplax adhaerens Schulze, 1883 (Placozoa)
‌: Maria Cristina Albertini, և այլն
Հրապարակվել է: (2019-04-01)

Trichoplax adhaerens reveals a network of nuclear receptors sensitive to 9-cis-retinoic acid at the base of metazoan evolution
‌: Jan Philipp Novotný, և այլն
Հրապարակվել է: (2017-09-01)

Lack of activity of recombinant HIF prolyl hydroxylases (PHDs) on reported non-HIF substrates
‌: Cockman, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2019)

Molecular and Cellular Mechanisms of HIF Prolyl Hydroxylase inhibitors in Clinical Trials
‌: Yeh, TL, և այլն
Հրապարակվել է: (2017)

A small-molecule probe for monitoring binding to prolyl hydroxylase domain 2 by fluorescence polarisation
‌: Li, Z, և այլն
Հրապարակվել է: (2020)

Tuning the transcriptional response to hypoxia by inhibiting HIF prolyl- and asparaginyl-hydroxylases
‌: Chan, M, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

Structural basis for binding of the renal carcinoma target hypoxia-inducible factor 2α to prolyl hydroxylase domain 2
‌: Figg, WD, և այլն
Հրապարակվել է: (2023)

Studies on the reaction of nitric oxide with the hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylase domain 2 (EGLN1)
‌: Chowdhury, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Studies on the reaction of nitric oxide with the hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylase domain 2 (EGLN1).
‌: Chowdhury, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2011)

Investigating the contribution of the active site environment to the slow reaction of hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylase domain 2 with oxygen.
‌: Tarhonskaya, H, և այլն
Հրապարակվել է: (2014)

Structural basis for oxygen degradation domain selectivity of the HIF prolyl hydroxylases
‌: Chowdhury, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2016)

BIOL 56-ESI-MS studies on prolyl hydroxylase domain 2
‌: Mecinovic, J, և այլն
Հրապարակվել է: (2008)

Structural and mechanistic studies on prolyl hydroxylases
‌: Chowdhury, R
Հրապարակվել է: (2008)

Mutation Analysis of HIF-prolyl hydroxylases (PHD/EGLN) in Inherited Phaeochromocytoma and Renal Cell Carcinoma
‌: Astuti, D, և այլն
Հրապարակվել է: (2010)

Lack of activity of recombinant HIF prolyl hydroxylases (PHDs) on reported non-HIF substrates
‌: Matthew E Cockman, և այլն
Հրապարակվել է: (2019-09-01)

Selective small molecule probes for the hypoxia inducible factor (HIF) prolyl hydroxylases.
‌: Chowdhury, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2013)