Five computational developability guidelines for therapeutic antibody profiling

Five computational developability guidelines for therapeutic antibody profiling

Therapeutic mAbs must not only bind to their target but must also be free from “developability issues” such as poor stability or high levels of aggregation. While small-molecule drug discovery benefits from Lipinski’s rule of five to guide the selection of molecules with appropriate biophysical prop...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Raybould, MIJ, Marks, C, Krawczyk, K, Taddese, B, Nowak, J, Lewis, AP, Bujotzek, A, Shi, J, Deane, C
Định dạng:	Journal article
Được phát hành:	National Academy of Sciences 2019

Những quyển sách tương tự

Thera-SAbDab: the Therapeutic Structural Antibody Database
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2019)

Epitope profiling using computational structural modelling demonstrated on coronavirus-binding antibodies
Bằng: Robinson, SA, et al.
Được phát hành: (2021)

Public Baseline and shared response structures support the theory of antibody repertoire functional commonality
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2021)

Computationally profiling peptide: MHC recognition by T-cell receptors and T-cell receptor-mimetic antibodies
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2023)

Contextualising the developability risk of antibodies with lambda light chains using enhanced therapeutic antibody profiling
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2024)

CoV-AbDab: the coronavirus antibody database
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2020)

Prospects for the computational humanization of antibodies and nanobodies
Bằng: Gordon, GL, et al.
Được phát hành: (2024)

Structure-aware tools for the development of therapeutic antibodies from natural immunoglobulins
Bằng: Raybould, MIJ
Được phát hành: (2020)

Looking for therapeutic antibodies in next-generation sequencing repositories
Bằng: Krawczyk, K, et al.
Được phát hành: (2019)

Looking for therapeutic antibodies in next-generation sequencing repositories
Bằng: Konrad Krawczyk, et al.
Được phát hành: (2019-10-01)

Ab-Ligity: identifying sequence-dissimilar antibodies that bind to the same epitope
Bằng: Wong, WK, et al.
Được phát hành: (2021)

Current strategies for detecting functional convergence across B-cell receptor repertoires
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2021)

Epitope profiling using computational structural modelling demonstrated on coronavirus-binding antibodies.
Bằng: Sarah A Robinson, et al.
Được phát hành: (2021-12-01)

Contextualising the developability risk of antibodies with lambda light chains using enhanced therapeutic antibody profiling
Bằng: Matthew I. J. Raybould, et al.
Được phát hành: (2024-01-01)

The patent and literature antibody database (PLAbDab): an evolving reference set of functionally diverse, literature-annotated antibody sequences and structures
Bằng: Abanades, B, et al.
Được phát hành: (2023)

Computationally profiling peptide:MHC recognition by T-cell receptors and T-cell receptor-mimetic antibodies
Bằng: Matthew I. J. Raybould, et al.
Được phát hành: (2023-01-01)

Structural diversity of B-cell receptor repertoires along the B-cell differentiation axis in humans and mice
Bằng: Kovaltsuk, A, et al.
Được phát hành: (2020)

Prospects for the computational humanization of antibodies and nanobodies
Bằng: Gemma L. Gordon, et al.
Được phát hành: (2024-05-01)

Improved computational epitope profiling using structural models identifies a broader diversity of antibodies that bind to the same epitope
Bằng: Fabian C. Spoendlin, et al.
Được phát hành: (2023-09-01)

Antibody–antigen complex modelling in the era of immunoglobulin repertoire sequencing
Bằng: Raybould, M, et al.
Được phát hành: (2019)

Ab-Ligity: identifying sequence-dissimilar antibodies that bind to the same epitope
Bằng: Wing Ki Wong, et al.
Được phát hành: (2021-01-01)

Public Baseline and shared response structures support the theory of antibody repertoire functional commonality.
Bằng: Matthew I J Raybould, et al.
Được phát hành: (2021-03-01)

SAbPred: a structure-based antibody prediction server
Bằng: Deane, C, et al.
Được phát hành: (2016)

Antibody i-Patch prediction of the antibody binding site improves rigid local antibody-antigen docking.
Bằng: Krawczyk, K, et al.
Được phát hành: (2013)

ABlooper: fast accurate antibody CDR loop structure prediction with accuracy estimation
Bằng: Abanades, B, et al.
Được phát hành: (2022)

Antibody H3 structure prediction
Bằng: Marks, C, et al.
Được phát hành: (2017)

T-cell receptor structures and predictive models reveal comparable alpha and beta chain structural diversity despite differing genetic complexity
Bằng: Quast, NP, et al.
Được phát hành: (2025)

SCALOP: sequence-based antibody canonical loop structure annotation
Bằng: Wong, W, et al.
Được phát hành: (2018)

DLAB: deep learning methods for structure-based virtual screening of antibodies
Bằng: Schneider, C, et al.
Được phát hành: (2021)

Observed antibody space: a resource for data mining next generation sequencing of antibody repertoires
Bằng: Kovaltsuk, A, et al.
Được phát hành: (2018)

Computational antibody design
Bằng: Krawczyk, K
Được phát hành: (2013)

LAP: Liability Antibody Profiler by sequence & structural mapping of natural and therapeutic antibodies.
Bằng: Tadeusz Satława, et al.
Được phát hành: (2024-03-01)

Improving B-cell epitope prediction and its application to global antibody-antigen docking.
Bằng: Krawczyk, K, et al.
Được phát hành: (2014)

Filtering next-generation sequencing of the Ig gene repertoire data using antibody structural information
Bằng: Kovaltsuk, A, et al.
Được phát hành: (2018)

Filtering next-generation sequencing of the Ig gene repertoire data using antibody structural information
Bằng: Kovaltsuk, A, et al.
Được phát hành: (2018)

SAbDab in the age of biotherapeutics: updates including SAbDab-nano, the nanobody structure tracker
Bằng: Schneider, C, et al.
Được phát hành: (2021)

The observed T cell receptor space database enables paired-chain repertoire mining, coherence analysis and language modelling
Bằng: Raybould, MIJ, et al.
Được phát hành: (2024)

TCRBuilder: multi-state T-cell receptor structure prediction
Bằng: Wong, WK, et al.
Được phát hành: (2020)

SAbDab: the structural antibody database
Bằng: Dunbar, J, et al.
Được phát hành: (2014)

SAbDab: the structural antibody database.
Bằng: Dunbar, J, et al.
Được phát hành: (2014)