Pores formed by the nicotinic receptor m2delta Peptide: a molecular dynamics simulation study.

Pores formed by the nicotinic receptor m2delta Peptide: a molecular dynamics simulation study.

The M2delta peptide self-assembles to form a pentameric bundle of transmembrane alpha-helices that is a model of the pore-lining region of the nicotinic acetylcholine receptor. Long (>15 ns) molecular dynamics simulations of a model of the M2delta(5) bundle in a POPC bilayer have been used to...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Law, R, Tieleman, D, Sansom, MS
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	2003

Схожі ресурси

Structure and dynamics of the pore-lining helix of the nicotinic receptor: MD simulations in water, lipid bilayers, and transbilayer bundles.
за авторством: Law, R, та інші
Опубліковано: (2000)

The pore domain of the nicotinic acetylcholine receptor: molecular modeling, pore dimensions, and electrostatics
за авторством: Sankararamakrishnan, R, та інші
Опубліковано: (1996)

Molecular dynamics study of water and Na⁺ ions in models of the pore region of the nicotinic acetylcholine receptor
за авторством: Smith, G, та інші
Опубліковано: (1997)

Molecular dynamics simulations of antimicrobial peptides: From membrane binding to trans-membrane channels
за авторством: Tieleman, D, та інші
Опубліковано: (2001)

Molecular dynamics simulation of the M2 helices within the nicotinic acetylcholine receptor transmembrane domain: structure and collective motions.
за авторством: Hung, A, та інші
Опубліковано: (2005)

Electrostatics studies and molecular dynamics simulations of a homology model of the Shaker K+ channel pore.
за авторством: Ranatunga, K, та інші
Опубліковано: (2001)

Water in ion channels and pores--simulation studies.
за авторством: Sansom, MS, та інші
Опубліковано: (2002)

Water in transmembrane pores: Simulation studies.
за авторством: Sansom, M, та інші
Опубліковано: (2001)

Water-mediated conformational transitions in nicotinic receptor M2 helix bundles: a molecular dynamics study
за авторством: Sankararamakrishnan, R, та інші
Опубліковано: (1995)

The closed gate of the nicotinic receptor, identified by molecular dynamics free energy calculations
за авторством: Beckstein, O, та інші
Опубліковано: (2005)

The nicotinic acetylcholine receptor: from molecular model to single-channel conductance.
за авторством: Adcock, C, та інші
Опубліковано: (2000)

Simulation studies of the interaction of antimicrobial peptides and lipid bilayers.
за авторством: La Rocca, P, та інші
Опубліковано: (1999)

Transbilayer pores formed by β-barrels: molecular modeling of pore structures and properties
за авторством: Sansom, M, та інші
Опубліковано: (1995)

The alpha7 nicotinic acetylcholine receptor: molecular modelling, electrostatics, and energetics.
за авторством: Amiri, S, та інші
Опубліковано: (2005)

Peptide nanopores and lipid bilayers: interactions by coarse-grained molecular-dynamics simulations.
за авторством: Klingelhoefer, J, та інші
Опубліковано: (2009)

Coarse-grained molecular dynamics simulations of membrane proteins and peptides.
за авторством: Bond, P, та інші
Опубліковано: (2007)

Homology modelling and molecular dynamics simulations: comparative studies of human aquaporin-1.
за авторством: Law, R, та інші
Опубліковано: (2004)

Molecular dynamics studies of AChBP with nicotine and carbamylcholine: the role of water in the binding pocket.
за авторством: Amiri, S, та інші
Опубліковано: (2007)

OmpA: a pore or not a pore? Simulation and modeling studies.
за авторством: Bond, P, та інші
Опубліковано: (2002)

Molecular dynamics simulations of the ligand-binding domain of an N-methyl-D-aspartate receptor.
за авторством: Kaye, S, та інші
Опубліковано: (2006)

Molecular dynamics simulation of the M2 helices within the nicotinic acetylcholine receptor transmembrane domain: structure and collective motions
Опубліковано: (2005)

A hydrophobic gate in an ion channel: the closed state of the nicotinic acetylcholine receptor.
за авторством: Beckstein, O, та інші
Опубліковано: (2006)

Conformation and environment of channel-forming peptides: a simulation study.
за авторством: Johnston, J, та інші
Опубліковано: (2006)

Molecular Modulation of Human α7 Nicotinic Receptor by Amyloid-β Peptides
за авторством: Matías Lasala, та інші
Опубліковано: (2019-02-01)

Voltage-dependent interactions between the anti-microbial peptide alamethicin and model membranes.
за авторством: Tieleman, D, та інші
Опубліковано: (2001)

Analysis and evaluation of channel models: simulations of alamethicin.
за авторством: Tieleman, D, та інші
Опубліковано: (2002)

Exploring models of the influenza A M2 channel: MD simulations in a phospholipid bilayer.
за авторством: Forrest, L, та інші
Опубліковано: (2000)

Simulations of a protein translocation pore: SecY.
за авторством: Haider, S, та інші
Опубліковано: (2006)

Membrane proteins: molecular dynamics simulations.
за авторством: Lindahl, E, та інші
Опубліковано: (2008)

Molecular dynamics simulations of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor GluR2.
за авторством: Arinaminpathy, Y, та інші
Опубліковано: (2002)

Structure and dynamics of K channel pore-lining helices: a comparative simulation study.
за авторством: Shrivastava, I, та інші
Опубліковано: (2000)

Modelling packing interactions in parallel helix bundles: pentameric bundles of nicotinic receptor M2 helices
за авторством: Sankararamakrishnan, R, та інші
Опубліковано: (1995)

A prokaryotic glutamate receptor: homology modelling and molecular dynamics simulations of GluR0.
за авторством: Arinaminpathy, Y, та інші
Опубліковано: (2003)

Water nanoconfined in a hydrophobic pore: molecular dynamics simulations of transmembrane protein 175 and the influence of water models
за авторством: Lynch, CI, та інші
Опубліковано: (2021)

Water nanoconfined in a hydrophobic pore: molecular dynamics simulations of transmembrane protein 175 and the influence of water models
за авторством: Lynch, CI, та інші
Опубліковано: (2021)

Molecular dynamics simulations and membrane protein structure quality.
за авторством: Ivetac, A, та інші
Опубліковано: (2008)

OmpT: molecular dynamics simulations of an outer membrane enzyme.
за авторством: Baaden, M, та інші
Опубліковано: (2004)

Molecular dynamics simulations and KcsA channel gating.
за авторством: Shrivastava, I, та інші
Опубліковано: (2002)

OmpA: gating and dynamics via molecular dynamics simulations.
за авторством: Khalid, S, та інші
Опубліковано: (2008)

Simulation approaches to ion channel structure-function relationships.
за авторством: Tieleman, D, та інші
Опубліковано: (2001)