A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.

A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.

Zobrazit další vydání (1)

MOTIVATION: Large-scale genotyping relies on the use of unsupervised automated calling algorithms to assign genotypes to hybridization data. A number of such calling algorithms have been recently established for the Affymetrix GeneChip genotyping technology. Here, we present a fast and accurate geno...

Podrobná bibliografie
Hlavní autoři:	Teo, Y, Inouye, M, Small, K, Gwilliam, R, Deloukas, P, Kwiatkowski, D, Clark, T
Médium:	Journal article
Jazyk:	English
Vydáno:	2007

Podobné jednotky

A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.
Autor: Teo, Y, a další
Vydáno: (2007)

BeadArray-based genotyping.
Autor: Butler, H, a další
Vydáno: (2008)

Population genetic analysis of Plasmodium falciparum parasites using a customized Illumina GoldenGate genotyping assay.
Autor: Campino, S, a další
Vydáno: (2011)

Algorithm implementation for CNV discovery using Affymetrix and Illumina SNP array data.
Autor: Winchester, L, a další
Vydáno: (2012)

Joint Genotype Calling With Array and Sequence Data
Autor: O'Connell, J, a další
Vydáno: (2012)

Joint genotype calling with array and sequence data.
Autor: O'Connell, J, a další
Vydáno: (2012)

Perturbation analysis: a simple method for filtering SNPs with erroneous genotyping in genome-wide association studies.
Autor: Teo, Y, a další
Vydáno: (2008)

Effects of different scan factors in genome analyser (illumina) platform on gene expression profiling
Autor: Kwok, Wee Chiew.
Vydáno: (2009)

Stampy: a statistical algorithm for sensitive and fast mapping of Illumina sequence reads.
Autor: Lunter, G, a další
Vydáno: (2011)

Optimizing Illumina next-generation sequencing library preparation for extremely AT-biased genomes.
Autor: Oyola, S, a další
Vydáno: (2012)

Detecting mixtures of different tuberculosis lineages using Illumina sequencing
Autor: Wyllie, D
Vydáno: (2018)

Whole genome sequencing of hepatitis B virus using tiled amplicon (HEPTILE) and probe based enrichment on Illumina and Nanopore platforms
Autor: Lumley, SF, a další
Vydáno: (2025)

Linking genotype to phenotype on beads: high throughput selection of peptides with biological function
Autor: Huang, L, a další
Vydáno: (2013)

Optimization of illumina TruSeq Targeted RNA expression (TREx) library quality
Autor: Abu, Nadiah, a další
Vydáno: (2018)

Illumina and Nanopore methods for whole genome sequencing of hepatitis B virus (HBV)
Autor: McNaughton, AL, a další
Vydáno: (2019)

Cross-site comparison of ribosomal depletion kits for Illumina RNAseq library construction
Autor: Herbert, Zachary T, a další
Vydáno: (2018)

CNV discovery using SNP genotyping arrays.
Autor: Yau, C, a další
Vydáno: (2008)

LD-based SNP and genotype calling from next-generation sequencing reads.
Autor: Menelaou, A
Vydáno: (2012)

Whole genome-amplified DNA: insights and imputation.
Autor: Teo, Y, a další
Vydáno: (2008)

De novo assembly of transcriptomes, mining, and development of novel EST-SSR markers in Curcuma alismatifolia (Zingiberaceae family) through Illumina sequencing
Autor: Taheri, Sima, a další
Vydáno: (2019)

Comparing algorithms for genotype imputation.
Autor: Marchini, J, a další
Vydáno: (2008)

Genotype calling and phasing using next-generation sequencing reads and a haplotype scaffold.
Autor: Menelaou, A, a další
Vydáno: (2013)

Comparative protein profiling of serum and plasma using an antibody suspension bead array approach.
Autor: Schwenk, J, a další
Vydáno: (2010)

The venerable beads /
Autor: 187045 Osamu Katayama

Methodological challenges of genome-wide association analysis in Africa.
Autor: Teo, Y, a další
Vydáno: (2010)

The metabochip, a custom genotyping array for genetic studies of metabolic, cardiovascular, and anthropometric traits
Autor: Voight, B, a další
Vydáno: (2012)

Multiplex PCR method for MinION and Illumina sequencing of Zika and other virus genomes directly from clinical samples
Autor: Quick, J, a další
Vydáno: (2017)

Power consequences of linkage disequilibrium variation between populations.
Autor: Teo, Y, a další
Vydáno: (2009)

CALL in use : use of CALL : evaluating CALL software /
Autor: 374203 Legenhausen, Lienhard, a další

Bead-sort algorithm for load shuffling in miniload AS/RS with an open-rack structure
Autor: Vasili, Mohammadreza, a další
Vydáno: (2009)

A Code Generation Framework for Targeting Optimized Library Calls for Multiple Platforms
Autor: Tan, Wen Jun, a další
Vydáno: (2015)

Genome-wide comparisons of variation in linkage disequilibrium.
Autor: Teo, Y, a další
Vydáno: (2009)

Algorithm deployment platform
Autor: Hess, Tylor (Tylor Joseph)
Vydáno: (2016)

SEAD : prayer beads revolutionized
Autor: Tay, Yang Heng
Vydáno: (2016)

Synthesis of superporous hydrogel beads
Autor: Ho, Eunice Pei Shi.
Vydáno: (2012)

Beaded desiccant silica gel
Autor: 8096 British Standards Institution
Vydáno: (1992)

Clinical viability of magnetic bead implants in muscle
Autor: Taylor, Cameron R., a další
Vydáno: (2022)

A Comparison of Bioinformatics Pipelines for Enrichment Illumina Next Generation Sequencing Systems in Detecting SARS-CoV-2 Virus Strains
Autor: AFIAHAYATI, AFIAHAYATI, a další
Vydáno: (2022)

Call /
Autor: 290608 Hardisty, David, a další
Vydáno: (1989)

The calling /
Autor: 461929 Tiernan, Cate
Vydáno: (2001)