A statistical method for predicting classical HLA alleles from SNP data.

A statistical method for predicting classical HLA alleles from SNP data.

Genetic variation at classical HLA alleles is a crucial determinant of transplant success and susceptibility to a large number of infectious and autoimmune diseases. However, large-scale studies involving classical type I and type II HLA alleles might be limited by the cost of allele-typing technolo...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Leslie, S, Donnelly, P, McVean, G
Materyal Türü:	Journal article
Dil:	English
Baskı/Yayın Bilgisi:	2008

Benzer Materyaller

HLA*IMP - an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes
Yazar:: Dilthey, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

HLA*IMP--an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes.
Yazar:: Dilthey, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

Comparison of Tagging and Imputation for HLA Allele Prediction and Association Testing
Yazar:: Shen, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

CLASSICAL HLA TYPE IMPUTATION FOR MULTI-POPULATION STUDIES
Yazar:: Dilthey, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Multi-population classical HLA type imputation
Yazar:: Dilthey, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Multi-population classical HLA type imputation.
Yazar:: Alexander Dilthey, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013-01-01)

THE LIMITATIONS OF VARIANT CALLING ALGORITHMS FOR CLASSICAL HLA GENES FROM WHOLE GENOME SEQUENCE DATA
Yazar:: Cox, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Classical HLA alleles tag SNP in families from Antioquia with type 1 diabetes mellitus
Yazar:: Diana Clobeth Sarrazola, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-09-01)

SNP SCREENING FOR HLA HAPLOTYPES RELEVANT IN ESTABLISHING A HUMAN PLURIPOTENT STEM CELL DERIVED CELL BANK
Yazar:: Robertson, V, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Estimating Selection Coefficients in Spatially Structured Populations from Time Series Data of Allele Frequencies
Yazar:: Mathieson, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Estimating selection coefficients in spatially structured populations from time series data of allele frequencies.
Yazar:: Mathieson, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Interrogating genetic variation in the HLA using high throughput technologies
Yazar:: McVean, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Association of HLA-A and Non-Classical HLA Class I Alleles.
Yazar:: Federico Carlini, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016-01-01)

Imputation of KIR Types from SNP Variation Data.
Yazar:: Vukcevic, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Classical and Non-Classical HLA Alleles as Supplementary Markers in Indirect Kinship Parentage Testing
Yazar:: Diamanto Kouniaki, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-08-01)

High-accuracy HLA type inference from whole-genome sequencing data using population reference graphs
Yazar:: Dilthey, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

Reconstructing SNP allele and genotype frequencies from GWAS summary statistics
Yazar:: Zhiyu Yang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-05-01)

A review of HLA allele and SNP associations with highly prevalent infectious diseases in human populations
Yazar:: Alicia Sanchez-Mazas
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020-04-01)

Linkage disequilibrium and age of HLA region SNPs in relation to classic HLA gene alleles within Europe.
Yazar:: Evseeva, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

HLA*LA—HLA typing from linearly projected graph alignments
Yazar:: Dilthey, AT, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

A high-resolution HLA and SNP haplotype map for disease association studies in the extended human MHC.
Yazar:: de Bakker, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

A new multipoint method for genome-wide association studies by imputation of genotypes.
Yazar:: Marchini, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007)

Estimating recombination rates from population-genetic data.
Yazar:: Stumpf, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2003)

Estimating meiotic gene conversion rates from population genetic data.
Yazar:: Gay, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007)

Determining SNP Allele Frequencies in DNA Pools
Yazar:: G. Breen, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2000-03-01)

High Resolution Haplotype Analyses of Classical HLA Genes in Families With Multiple Sclerosis Highlights the Role of HLA-DP Alleles in Disease Susceptibility
Yazar:: Kazutoyo Osoegawa, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-05-01)

Association of HLA alleles with autism
Yazar:: Sayad A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-11-01)

A coalescent-based method for detecting and estimating recombination from gene sequences.
Yazar:: McVean, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2002)

A model-based approach to capture genetic variation for future association studies.
Yazar:: Eyheramendy, S, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007)

ANALYSIS OF SUSCEPTIBILITY LOCI FOR JUVENILE IDIOPATHIC ARTHRITIS IN THE EXTENDED MHC REGION USING HIGH RESOLUTION SNP AND HLA ALLELE TYPING
Yazar:: JACEK BIESIADA, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-10-01)

Linkage Disequilibrium, Recombination and Selection
Yazar:: McVean, G
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

A SNP approach to HLA typing analysis
Yazar:: Evseeva, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2005)

The structure of linkage disequilibrium around a selective sweep.
Yazar:: McVean, G
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007)

Evolutionary genetics: what is driving male mutation?
Yazar:: McVean, G
Baskı/Yayın Bilgisi: (2000)

What drives recombination hotspots to repeat DNA in humans?
Yazar:: McVean, G
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

A genealogical interpretation of principal components analysis.
Yazar:: McVean, G
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009)

SNP allele calling of Illumina Infinium Omni5-4 data using the butterfly method
Yazar:: Mikkel Meyer Andersen, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-10-01)

Human Leukocyte Antigen (HLA) and Immune Regulation: How Do Classical and Non-Classical HLA Alleles Modulate Immune Response to Human Immunodeficiency Virus and Hepatitis C Virus Infections?
Yazar:: Nicole B. Crux, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2017-07-01)

HLA-A*02:07 is a protective allele for EBV negative and a susceptibility allele for EBV positive classical Hodgkin lymphoma in China.
Yazar:: Xin Huang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012-01-01)

Associations of HLA alleles with specific language impairment.
Yazar:: Nudel, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)