Recognizing the fold of a protein structure.

Recognizing the fold of a protein structure.

This paper reports a graph-theoretic program, GRATH, that rapidly, and accurately, matches a novel structure against a library of domain structures to find the most similar ones. GRATH generates distributions of scores by comparing the novel domain against the different types of folds that have been...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Harrison, A, Pearl, F, Sillitoe, I, Slidel, T, Mott, R, Thornton, J, Orengo, C
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2003

Những quyển sách tương tự

Quantifying the similarities within fold space.
Bằng: Harrison, A, et al.
Được phát hành: (2002)

CATHEDRAL: a fast and effective algorithm to predict folds and domain boundaries from multidomain protein structures.
Bằng: Oliver C Redfern, et al.
Được phát hành: (2007-11-01)

A folding pathway-dependent score to recognize membrane proteins.
Bằng: Hamid Hadi-Alijanvand, et al.
Được phát hành: (2011-01-01)

Heme proteins--diversity in structural characteristics, function, and folding.
Bằng: Smith, L, et al.
Được phát hành: (2010)

AlphaFold2 reveals commonalities and novelties in protein structure space for 21 model organisms
Bằng: Nicola Bordin, et al.
Được phát hành: (2023-02-01)

Structural motifs recurring in different folds recognize the same ligand fragments
Bằng: Incani Ottaviano, et al.
Được phát hành: (2009-06-01)

Friends in need: How chaperonins recognize and remodel proteins that require folding assistance
Bằng: George Stan, et al.
Được phát hành: (2022-11-01)

Exploring the evolution of novel enzyme functions within structurally defined protein superfamilies.
Bằng: Nicholas Furnham, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

FLORA: a novel method to predict protein function from structure in diverse superfamilies.
Bằng: Oliver C Redfern, et al.
Được phát hành: (2009-08-01)

Dissecting peripheral protein-membrane interfaces.
Bằng: Thibault Tubiana, et al.
Được phát hành: (2022-12-01)

Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction /
Bằng: Roterman-Konieczna, Irena
Được phát hành: (2012)

Protein Folding Structures: Formation of Folding Structures Based on Probability Theory
Bằng: Mitsuaki Narita, et al.
Được phát hành: (2016-12-01)

FtsH degrades dihydrofolate reductase by recognizing a partially folded species
Bằng: Morehouse, Juhee P., et al.
Được phát hành: (2022)

Identification of Protein Folding Cores Using Charge Center Model of Protein Structure
Bằng: Ivan Y. Torshin, et al.
Được phát hành: (2002-01-01)

Protein folding
Bằng: Cohen, F
Được phát hành: (1980)

Protein folding /
Bằng: Walters, Eric C.
Được phát hành: (c201)

Structural characteristics of novel protein folds.
Bằng: Narcis Fernandez-Fuentes, et al.
Được phát hành: (2010-04-01)

Protein structural analysis, folding, and design/
Bằng: Hatano, M. (Masahiro)
Được phát hành: (1990)

Fold usage on genomes and protein fold evolution.
Bằng: Abeln, S, et al.
Được phát hành: (2005)

Directionality in protein fold prediction
Bằng: Ellis, J, et al.
Được phát hành: (2010)

Protein Folding: Search for Basic Physical Models
Bằng: Ivan Y. Torshin, et al.
Được phát hành: (2003-01-01)

Minds at Play: Using an Online Protein Folding Game, FoldIt, To Support Student Learning about Protein Folding, Structure, and the Scientific Process
Bằng: Rebecca Rashid Achterman
Được phát hành: (2019-01-01)

Protein fold recognition by mapping predicted secondary structures.
Bằng: Russell, R, et al.
Được phát hành: (1996)

Current structure predictors are not learning the physics of protein folding
Bằng: Outeiral, C, et al.
Được phát hành: (2022)

Current structure predictors are not learning the physics of protein folding
Bằng: Outeiral, C, et al.
Được phát hành: (2022)

Protein structure generation via folding diffusion
Bằng: Kevin E. Wu, et al.
Được phát hành: (2024-02-01)

The protein folding problem and tertiary structure prediction /
Bằng: Merz, Kenneth M., et al.
Được phát hành: (1994)

Improved photo-CIDNP methods for studying protein structure and folding.
Bằng: Maeda, K, et al.
Được phát hành: (2000)

Protein folding /
Bằng: Creighton, Thomas E.
Được phát hành: (1992)

Bioinformatics : genes, proteins and computers /
Bằng: Orengo, Christine A, et al.
Được phát hành: (2003)

Recognizing public value /
Bằng: Moore, Mark Harrison.
Được phát hành: (2013)

Sampling of structure and sequence space of small protein folds
Bằng: Thomas W. Linsky, et al.
Được phát hành: (2022-11-01)

A structural basis for cellular uptake of GST-fold proteins.
Bằng: Melanie J Morris, et al.
Được phát hành: (2011-01-01)

THERMAL AND ORGANIC MATTER MODELING IN THE FAULT BEND FOLD AND FAULT PROPAGATION FOLD STRUCTURAL MODELS
Bằng: L. F SARMIENTO R, et al.
Được phát hành: (1997-01-01)

Directionality in protein fold prediction
Bằng: Srivastava Sheenal, et al.
Được phát hành: (2010-04-01)

Glycoprotein folding and quality-control mechanisms in protein-folding diseases
Bằng: Sean P. Ferris, et al.
Được phát hành: (2014-03-01)

Photo-CIDNP and protein folding
Bằng: Lyon, C
Được phát hành: (1999)

Protein folding and structure prediction: biological and physical perspectives
Bằng: Chonofsky, MA
Được phát hành: (2020)

AlphaFold prediction of structural ensembles of disordered proteins
Bằng: Z. Faidon Brotzakis, et al.
Được phát hành: (2025-02-01)

Viral capsid proteins are segregated in structural fold space.
Bằng: Shanshan Cheng, et al.
Được phát hành: (2013-01-01)