Accurate Computation of Likelihoods in the Coalescent with Recombination via Parsimony.

Accurate Computation of Likelihoods in the Coalescent with Recombination via Parsimony.

Understanding the variation of recombination rates across a given genome is crucial for disease gene mapping and for detecting signatures of selection, to name just a couple of applications. A widely-used method of estimating recombination rates is the maximum likelihood approach, and the problem of...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Lyngsø, R, Song, Y, Hein, J
Materyal Türü:	Journal article
Dil:	English
Baskı/Yayın Bilgisi:	2008

Benzer Materyaller

On recombination-induced multiple and simultaneous coalescent events.
Yazar:: Davies, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007)

Parsimonious reconstruction of sequence evolution and haplotype blocks: Finding the minimum number of recombination events
Yazar:: Song, Y, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2003)

Most parsimonious reconciliation in the presence of gene duplication, loss, and deep coalescence using labeled coalescent trees
Yazar:: Wu, Yi-Chieh, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

Minimum recombination histories by branch and bound
Yazar:: Lyngso, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2005)

Approximating the coalescent with recombination.
Yazar:: Mcvean, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2005)

Importance sampling on the coalescent with recombination
Yazar:: Jenkins, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

A large version of the small parsimony problem
Yazar:: Fredslund, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2003)

Rapid likelihood free inference of compact binary coalescences using accelerated hardware
Yazar:: D Chatterjee, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024-01-01)

The coalescent with gene conversion.
Yazar:: Wiuf, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2000)

Recombination-aware phylogeographic inference using the structured coalescent with ancestral recombination.
Yazar:: Fangfang Guo, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-08-01)

Approximate Likelihood Estimation of Divergence Time Range Using a Coalescent-based Model
Yazar:: Arindam RoyChoudhury
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013-12-01)

Approximate Likelihood Estimation of Divergence Time Range Using a Coalescent-based Model
Yazar:: Arindam RoyChoudhury
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013-01-01)

A maximum pseudo-likelihood approach for estimating species trees under the coalescent model
Yazar:: Edwards Scott V, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010-10-01)

On parsimony and clustering
Yazar:: Oggier, Frederique, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023)

On parsimony and clustering
Yazar:: Frédérique Oggier, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-04-01)

Diagnostic Parsimony
Yazar:: Bengt Autzen
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-12-01)

Parsimonious Methodology
Yazar:: Kees Aarts
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007-04-01)

Parsimonious labeling
Yazar:: Dokania, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

A Desire for Parsimony
Yazar:: Lawrence J. Cookson
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013-10-01)

Bayesian analysis using a simple likelihood model outperforms parsimony for estimation of phylogeny from discrete morphological data.
Yazar:: April M Wright, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-01-01)

Multiple Loci Selection with Multi-Way Epistasis in Coalescence with Recombination
Yazar:: Aritra Bose, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-04-01)

The effect of single recombination events on coalescent tree height and shape.
Yazar:: Luca Ferretti, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013-01-01)

Rec-DCM-Eigen: reconstructing a less parsimonious but more accurate tree in shorter time.
Yazar:: Seunghwa Kang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011-01-01)

Application of coalescent methods to reveal fine-scale rate variation and recombination hotspots.
Yazar:: Fearnhead, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2004)

Recodon: Coalescent simulation of coding DNA sequences with recombination, migration and demography
Yazar:: Posada David, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007-11-01)

Hadronization via coalescence at RHIC and LHC
Yazar:: Minissale V., ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016-01-01)

Linkage disequilibrium mapping via coalescent modelling.
Yazar:: Balding, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2001)

Genetic crossovers are predicted accurately by the computed human recombination map.
Yazar:: Pavel P Khil, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010-01-01)

Introduction: Reinventing penal parsimony
Yazar:: Bosworth, M
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

A Puzzle About Parsimony
Yazar:: Peter Finocchiaro
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-11-01)

Parsimonious edge-coloring on surfaces
Yazar:: Sarah-Marie Belcastro
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-10-01)

Parsimonious reconstruction of network evolution
Yazar:: Patro Rob, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012-09-01)

Maximum Parsimony on Phylogenetic networks
Yazar:: Kannan Lavanya, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012-05-01)

Parsimony and wavelet methods for denoising
Baskı/Yayın Bilgisi: (2003)

Reinventing penal parsimony: Introduction
Yazar:: Bosworth, M
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

A coalescent-based method for detecting and estimating recombination from gene sequences.
Yazar:: McVean, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2002)

Counting all possible ancestral configurations of sample sequences in population genetics.
Yazar:: Song, Y, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

Maximizing multi-reaction dependencies provides more accurate and precise predictions of intracellular fluxes than the principle of parsimony.
Yazar:: Seirana Hashemi, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-09-01)

Accurate structural correlations from maximum likelihood superpositions.
Yazar:: Douglas L Theobald, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008-02-01)

Coalescence.
Yazar:: Cher, Gerard Nathaniel Thien Sung.
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)