Accurate Computation of Likelihoods in the Coalescent with Recombination via Parsimony.

Accurate Computation of Likelihoods in the Coalescent with Recombination via Parsimony.

Understanding the variation of recombination rates across a given genome is crucial for disease gene mapping and for detecting signatures of selection, to name just a couple of applications. A widely-used method of estimating recombination rates is the maximum likelihood approach, and the problem of...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Lyngsø, R, Song, Y, Hein, J
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2008

Những quyển sách tương tự

On recombination-induced multiple and simultaneous coalescent events.
Bằng: Davies, J, et al.
Được phát hành: (2007)

Parsimonious reconstruction of sequence evolution and haplotype blocks: Finding the minimum number of recombination events
Bằng: Song, Y, et al.
Được phát hành: (2003)

Most parsimonious reconciliation in the presence of gene duplication, loss, and deep coalescence using labeled coalescent trees
Bằng: Wu, Yi-Chieh, et al.
Được phát hành: (2014)

Minimum recombination histories by branch and bound
Bằng: Lyngso, R, et al.
Được phát hành: (2005)

Approximating the coalescent with recombination.
Bằng: Mcvean, G, et al.
Được phát hành: (2005)

Importance sampling on the coalescent with recombination
Bằng: Jenkins, P, et al.
Được phát hành: (2008)

A large version of the small parsimony problem
Bằng: Fredslund, J, et al.
Được phát hành: (2003)

The coalescent with gene conversion.
Bằng: Wiuf, C, et al.
Được phát hành: (2000)

Rapid likelihood free inference of compact binary coalescences using accelerated hardware
Bằng: D Chatterjee, et al.
Được phát hành: (2024-01-01)

Recombination-aware phylogeographic inference using the structured coalescent with ancestral recombination.
Bằng: Fangfang Guo, et al.
Được phát hành: (2022-08-01)

Approximate Likelihood Estimation of Divergence Time Range Using a Coalescent-based Model
Bằng: Arindam RoyChoudhury
Được phát hành: (2013-12-01)

Approximate Likelihood Estimation of Divergence Time Range Using a Coalescent-based Model
Bằng: Arindam RoyChoudhury
Được phát hành: (2013-01-01)

A maximum pseudo-likelihood approach for estimating species trees under the coalescent model
Bằng: Edwards Scott V, et al.
Được phát hành: (2010-10-01)

On parsimony and clustering
Bằng: Oggier, Frederique, et al.
Được phát hành: (2023)

On parsimony and clustering
Bằng: Frédérique Oggier, et al.
Được phát hành: (2023-04-01)

Diagnostic Parsimony
Bằng: Bengt Autzen
Được phát hành: (2022-12-01)

Parsimonious labeling
Bằng: Dokania, P, et al.
Được phát hành: (2016)

A Desire for Parsimony
Bằng: Lawrence J. Cookson
Được phát hành: (2013-10-01)

Multiple Loci Selection with Multi-Way Epistasis in Coalescence with Recombination
Bằng: Aritra Bose, et al.
Được phát hành: (2021-04-01)

The effect of single recombination events on coalescent tree height and shape.
Bằng: Luca Ferretti, et al.
Được phát hành: (2013-01-01)

Application of coalescent methods to reveal fine-scale rate variation and recombination hotspots.
Bằng: Fearnhead, P, et al.
Được phát hành: (2004)

Recodon: Coalescent simulation of coding DNA sequences with recombination, migration and demography
Bằng: Posada David, et al.
Được phát hành: (2007-11-01)

Linkage disequilibrium mapping via coalescent modelling.
Bằng: Balding, D, et al.
Được phát hành: (2001)

Introduction: Reinventing penal parsimony
Bằng: Bosworth, M
Được phát hành: (2010)

A Puzzle About Parsimony
Bằng: Peter Finocchiaro
Được phát hành: (2022-11-01)

Parsimonious edge-coloring on surfaces
Bằng: Sarah-Marie Belcastro
Được phát hành: (2018-10-01)

Parsimony and wavelet methods for denoising
Được phát hành: (2003)

Reinventing penal parsimony: Introduction
Bằng: Bosworth, M
Được phát hành: (2010)

A coalescent-based method for detecting and estimating recombination from gene sequences.
Bằng: McVean, G, et al.
Được phát hành: (2002)

Counting all possible ancestral configurations of sample sequences in population genetics.
Bằng: Song, Y, et al.
Được phát hành: (2006)

Maximizing multi-reaction dependencies provides more accurate and precise predictions of intracellular fluxes than the principle of parsimony.
Bằng: Seirana Hashemi, et al.
Được phát hành: (2023-09-01)

Coalescence.
Bằng: Cher, Gerard Nathaniel Thien Sung.
Được phát hành: (2013)

Accurate structural correlations from maximum likelihood superpositions.
Bằng: Douglas L Theobald, et al.
Được phát hành: (2008-02-01)

Approximate likelihood methods for estimating local recombination rates
Bằng: Fearnhead, P, et al.
Được phát hành: (2002)

Hydrodynamics Of Two Phase Flow For Coalescing And Non Coalescing Systems
Bằng: Hiba M. Abdullah, et al.
Được phát hành: (2009-02-01)

Parsimonious Clone Tree Integration in cancer
Bằng: Palash Sashittal, et al.
Được phát hành: (2022-03-01)

A parsimonious description of the Hendry system
Bằng: Kalwani, Manohar U., et al.
Được phát hành: (2009)

Reasoning with parsimonious and moderately grounded expansions
Bằng: Eiter, T, et al.
Được phát hành: (1992)

Exciting black hole modes via misaligned coalescences. II. The mode content of late-time coalescence waveforms
Bằng: Lim, Halston, et al.
Được phát hành: (2021)

On coalescence time in graphs–when is coalescing as fast as meeting?
Bằng: Kanade, V, et al.
Được phát hành: (2023)