Molecular dynamics simulation of the M2 helices within the nicotinic acetylcholine receptor transmembrane domain: structure and collective motions

Molecular dynamics simulation of the M2 helices within the nicotinic acetylcholine receptor transmembrane domain: structure and collective motions

Multiple nanosecond duration molecular dynamics (MD) simulations were performed on the transmembrane region of the Torpedo nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) embedded within a bilayer mimetic octane slab. The M2 helices and M2-M3 loop regions were free to move whilst the outer (M1, M3,...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Định dạng:	Journal article
Được phát hành:	Biophysical Society 2005
Những chủ đề:	Life Sciences Chemistry & allied sciences Biochemistry

Những quyển sách tương tự

Molecular dynamics simulation of the M2 helices within the nicotinic acetylcholine receptor transmembrane domain: structure and collective motions.
Bằng: Hung, A, et al.
Được phát hành: (2005)

Residual dipolar couplings: are multiple independent alignments always possible?
Bằng: Higman, V, et al.
Được phát hành: (2011)

Probing the urea dependence of residual structure in denatured human α-lactalbumin
Bằng: Higman, V, et al.
Được phát hành: (2009)

A Web/Grid portal implementation of BioSimGrid: A biomolecular simulation database
Bằng: Wu, B, et al.
Được phát hành: (2004)

A novel form of the membrane protein CD147 that contains an extra Ig-like domain and interacts homophilically
Bằng: Hanna, S, et al.
Được phát hành: (2003)

A Web / Grid Portal Implementation of BioSimGrid: A Biomolecular Simulation Database
Được phát hành: (2004)

Grid Computing and Biomolecular Simulation
Được phát hành: (2005)

Droplet networks with incorporated protein diodes show collective properties
Bằng: Maglia, G, et al.
Được phát hành: (2009)

Coordination and binding geometry of methyl-coenzyme M in the red1m state of methyl-coenzyme M reductase
Bằng: Hinderberger, D, et al.
Được phát hành: (2008)

Redox-dependent conformational switching of diphenylacetylenes
Bằng: Jones, I, et al.
Được phát hành: (2014)

Principles of hydrogen catalysis in the presence of oxygen by a [NiFe] hydrogenase from E. coli
Bằng: Wulff, P
Được phát hành: (2014)

Preparative and N.M.R. studies of polyphosphorus ligands and their complexes
Bằng: Singh Nandha, Balbir
Được phát hành: (1992)

Molecular dynamics study of water and Na⁺ ions in models of the pore region of the nicotinic acetylcholine receptor
Bằng: Smith, G, et al.
Được phát hành: (1997)

Peptide targeting by spontaneous isopeptide bond formation
Bằng: Zakeri, B, et al.
Được phát hành: (2011)

Electrochemical characterisation and application of multi microelectrode array devices to biological electrochemistry
Bằng: Kudera, M, et al.
Được phát hành: (2001)

Ab initio folding of extended α-helix : a theoretical study about the role of electrostatic polarization in the folding of helical structures
Bằng: Lazim, Raudah, et al.
Được phát hành: (2013)

Cholesterol modulates the organization of the gammaM4 transmembrane domain of the muscle nicotinic acetylcholine receptor.
Bằng: de Almeida, R, et al.
Được phát hành: (2004)

Ionization of hydrogen Rydberg molecules at a metal surface
Bằng: Lloyd, G, et al.
Được phát hành: (2005)

Cold reactive collisions between laser-cooled ions and velocity-selected neutral molecules
Bằng: Willitsch, S, et al.
Được phát hành: (2008)

Synthesis and phytotoxic activity of new pyridones derived from 4-hydroxy-6-methylpyridin-2(1H)-one
Bằng: Demuner, A, et al.
Được phát hành: (2009)

Single and double stereoselective fluorination of (E)-allylsilanes
Bằng: Sawicki, M, et al.
Được phát hành: (2007)

Competition between initial-and final-state effects in valence- and core-level x-ray photoemission of Sb-doped SnO2
Bằng: Egdell, R, et al.
Được phát hành: (1999)

Applications of infrared laser spectroscopy to breath analysis
Bằng: Cummings, B
Được phát hành: (2011)

Nucleation and growth of oriented layered hydroxides on polymer resin beads
Bằng: Du, Y, et al.
Được phát hành: (2009)

Photocatalytic hydrogen production over layered materials
Bằng: Jia, T
Được phát hành: (2014)

Ultracold molecules and ultracold chemistry
Bằng: Bell, M, et al.
Được phát hành: (2009)

Sugar synthesis in a protocellular model leads to a cell signalling response in bacteria
Bằng: Gardner, P, et al.
Được phát hành: (2009)

Arylsilane oxidation - new routes to hydroxyated aromatics
Bằng: Bracegirdle, S, et al.
Được phát hành: (2010)

The Stark effect in the predissociating Rydberg states of NO
Bằng: Clarson, B, et al.
Được phát hành: (2008)

Electrochemical deposition of Pt-Ru on diamond electrodes for the electrooxidation of methanol
Bằng: Lu, X, et al.
Được phát hành: (2011)

Recent advances in the use of temporary silicon tethers in metal-mediated reactions
Bằng: Bracegirdle, S, et al.
Được phát hành: (2010)

A thermodynamically stable layered double hydroxide heterostructure
Bằng: Ragavan, A, et al.
Được phát hành: (2009)

Alkyl dehydrogenation in iridium tri-cyclopentyl phosphines
Bằng: Moret, S, et al.
Được phát hành: (2010)

Continuous base identification for single-molecule nanopore DNA sequencing
Bằng: Clarke, J, et al.
Được phát hành: (2009)

Oxygen reduction on platinum
Bằng: Gara, M
Được phát hành: (2013)

Quantitative voltammetry of the reduction of methyl benzoate in THF reveals strong ion pairing of the radical anion with tetra-n-butyl cations
Bằng: Baron, R, et al.
Được phát hành: (2009)

Synthesis and use of new chiral DABCO derivatives for asymmetric fluorination
Bằng: Ilupeju, JO
Được phát hành: (2012)

An Investigation of isotropic and anisotropic magnetic field effects in fluorescent systems
Bằng: Ferguson, K
Được phát hành: (2014)

Anion and neutral molecule recognition by electron deficient boranes
Bằng: Tirfoin, R
Được phát hành: (2015)

On the estimation of the diffuse double layer of carbon nanotubes using classical theory: curvature effects on the Gouy-Chapman limit
Bằng: Henstridge, M, et al.
Được phát hành: (2010)