Genome-wide discovery and verification of novel structured RNAs in Plasmodium falciparum.

Genome-wide discovery and verification of novel structured RNAs in Plasmodium falciparum.

We undertook a genome-wide search for novel noncoding RNAs (ncRNA) in the malaria parasite Plasmodium falciparum. We used the RNAz program to predict structures in the noncoding regions of the P. falciparum 3D7 genome that were conserved with at least one of seven other Plasmodium spp. genome sequen...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Mourier, T, Carret, C, Kyes, S, Christodoulou, Z, Gardner, P, Jeffares, D, Pinches, R, Barrell, B, Berriman, M, Griffiths-Jones, S, Ivens, A, Newbold, C, Pain, A
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2008

Những quyển sách tương tự

Stage-specific merozoite surface protein 2 antisense transcripts in Plasmodium falciparum.
Bằng: Kyes, S, et al.
Được phát hành: (2002)

Effect of var gene disruption on switching in Plasmodium falciparum.
Bằng: Horrocks, P, et al.
Được phát hành: (2002)

Transcription of subtelomerically located var gene variant in Plasmodium falciparum appears to require the truncation of an adjacent var gene.
Bằng: Horrocks, P, et al.
Được phát hành: (2004)

The antigenic switching network of Plasmodium falciparum and its implications for the immuno-epidemiology of malaria
Bằng: Noble, R, et al.
Được phát hành: (2013)

A simple RNA analysis method shows var and rif multigene family expression patterns in Plasmodium falciparum.
Bằng: Kyes, S, et al.
Được phát hành: (2000)

Comprehensive survey of gain and loss in Plasmodium falciparum clinical isolates.
Bằng: Carret, C, et al.
Được phát hành: (2008)

Plasmodium falciparum var gene expression is developmentally controlled at the level of RNA polymerase II-mediated transcription initiation.
Bằng: Kyes, S, et al.
Được phát hành: (2007)

Genome variation and evolution of the malaria parasite Plasmodium falciparum.
Bằng: Jeffares, D, et al.
Được phát hành: (2007)

The antigenic switching network of Plasmodium falciparum and its implications for the immuno-epidemiology of malaria
Bằng: Robert Noble, et al.
Được phát hành: (2013-09-01)

Genome-wide profiling of chromosome interactions in Plasmodium falciparum characterizes nuclear architecture and reconfigurations associated with antigenic variation.
Bằng: Lemieux, J, et al.
Được phát hành: (2013)

Antigenic variation in Plasmodium falciparum malaria involves a highly structured switching pattern.
Bằng: Recker, M, et al.
Được phát hành: (2011)

A well-conserved Plasmodium falciparum var gene shows an unusual stage-specific transcript pattern.
Bằng: Kyes, SA, et al.
Được phát hành: (2003)

Variant antigens and endothelial receptor adhesion in Plasmodium falciparum.
Bằng: Gardner, J, et al.
Được phát hành: (1996)

PfEMP1 expression is reduced on the surface of knobless Plasmodium falciparum infected erythrocytes.
Bằng: Horrocks, P, et al.
Được phát hành: (2005)

Febrile temperatures induce cytoadherence of ring-stage Plasmodium falciparum-infected erythrocytes.
Bằng: Udomsangpetch, R, et al.
Được phát hành: (2002)

New insights into the blood-stage transcriptome of Plasmodium falciparum using RNA-Seq.
Bằng: Otto, T, et al.
Được phát hành: (2010)

Plasmodium falciparum variant surface antigen expression patterns during malaria
Bằng: Bull, P, et al.
Được phát hành: (2005)

Microarray-based comparative genomic analyses of the human malaria parasite Plasmodium falciparum using Affymetrix arrays.
Bằng: Carret, C, et al.
Được phát hành: (2005)

Antigenic variation in Plasmodium falciparum malaria involves a highly structured switching pattern.
Bằng: Mario Recker, et al.
Được phát hành: (2011-03-01)

Statistical estimation of cell-cycle progression and lineage commitment in Plasmodium falciparum reveals a homogeneous pattern of transcription in ex vivo culture.
Bằng: Lemieux, J, et al.
Được phát hành: (2009)

Var gene diversity in Plasmodium falciparum is generated by frequent recombination events.
Bằng: Taylor, H, et al.
Được phát hành: (2000)

Genetic restriction of Plasmodium falciparum in an area of stable transmission: an example of island evolution?
Bằng: Maitland, K, et al.
Được phát hành: (2000)

Plasmodium falciparum var gene expression patterns in children with different levels of immunity to malaria.
Bằng: Warimwe, G, et al.
Được phát hành: (2008)

Plasmodium falciparum Variant Surface Antigen Expression Patterns during Malaria
Bằng: Newbold, C, et al.
Được phát hành: (2005)

Plasmodium falciparum variant surface antigen expression patterns during malaria.
Bằng: Peter C Bull, et al.
Được phát hành: (2005-11-01)

Plasmodium falciparum: a method for the amplification of S antigens and its application to laboratory and field samples.
Bằng: Kyes, S, et al.
Được phát hành: (1993)

Stage-specific promoter activity from stably maintained episomes in Plasmodium falciparum.
Bằng: Horrocks, P, et al.
Được phát hành: (2002)

Acquisition of naturally occurring antibody responses to recombinant protein domains of Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein I
Bằng: Mackintosh, C, et al.
Được phát hành: (2008)

Acquisition of naturally occurring antibody responses to recombinant protein domains of Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1.
Bằng: Mackintosh, C, et al.
Được phát hành: (2008)

Cytoadherence, pathogenesis and the infected red cell surface in Plasmodium falciparum.
Bằng: Newbold, C, et al.
Được phát hành: (1999)

Plasmodium falciparum: Pathogenesis, polymorphism and the infected red cell surface
Bằng: Newbold, C, et al.
Được phát hành: (1999)

QUININE INHIBITS CATION-SELECTIVE MEMBRANE-TRANSPORT IN PLASMODIUM-FALCIPARUM-INFECTED HUMAN RED-CELLS
Bằng: Elford, B, et al.
Được phát hành: (1990)

Plasmodium falciparum: the human agglutinating antibody response to the infected red cell surface is predominantly variant specific.
Bằng: Newbold, C, et al.
Được phát hành: (1992)

An analysis of non-coding RNAs in Plasmodium falciparum and their potential role in antigenic variation
Bằng: Christodoulou, Z
Được phát hành: (2012)

Rifins: a second family of clonally variant proteins expressed on the surface of red cells infected with Plasmodium falciparum.
Bằng: Kyes, SA, et al.
Được phát hành: (1999)

Genomic representation of var gene sequences in Plasmodium falciparum field isolates from different geographic regions.
Bằng: Kyes, S, et al.
Được phát hành: (1997)

An approach to classifying sequence tags sampled from Plasmodium falciparum var genes.
Bằng: Bull, P, et al.
Được phát hành: (2007)

Identification of a Plasmodium falciparum intercellular adhesion molecule-1 binding domain: a parasite adhesion trait implicated in cerebral malaria.
Bằng: Smith, J, et al.
Được phát hành: (2000)

Gene copy number variation throughout the <it>Plasmodium falciparum </it>genome
Bằng: Stewart Lindsay B, et al.
Được phát hành: (2009-08-01)

Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum.
Bằng: Gardner, M, et al.
Được phát hành: (2002)