A multi-scale method for the calculation of charge transfer rates through the Pi-stack of DNA: application to DNA dynamics.

A multi-scale method for the calculation of charge transfer rates through the Pi-stack of DNA: application to DNA dynamics.

We describe an ultra-fast, multi-scale method for calculating charge transfer rates through the pi-stack of DNA using a simple charge hopping model in conjunction with the Marcus equation. The calculation of the parameters required as input to the Marcus equation, such as the electronic coupling and...

תיאור מלא

מידע ביבליוגרפי
Main Authors:	Reha, D, Barford, W, Harris, S
פורמט:	Journal article
שפה:	English
יצא לאור:	2008

פריטים דומים

Stacking Effects on Anthraquinone/DNA Charge-Transfer Electronically Excited States
מאת: Gustavo Cárdenas, et al.
יצא לאור: (2020-12-01)

Programing the formation of DNA and PNA quadruplexes by pi-pi-stacking interactions.
מאת: Saha, S, et al.
יצא לאור: (2010)

Controllable charge transfer via DNA molecules
מאת: Liu, Yuanjun
יצא לאור: (2015)

Charge transfer in DNA : from mechanism to application /
מאת: Wagenknecht, Hans-Achim
יצא לאור: (2005)

Energy Transfer in Single-Stranded DNA-Templated Stacks of Naphthalene Chromophores
מאת: Stevens, A, et al.
יצא לאור: (2011)

DNA-Mediated Stack Formation of Nanodiscs
מאת: Madhumalar Subramanian, et al.
יצא לאור: (2021-03-01)

Enhanced H-bonding and pi-stacking in DNA: a potent duplex-stabilizing and mismatch sensing nucleobase analogue
מאת: Lou, C, et al.
יצא לאור: (2014)

Realistic model of charge mobility in pi-conjugated polymer systems
מאת: Berencei, L, et al.
יצא לאור: (2019)

The role of loop stacking in the dynamics of DNA hairpin formation.
מאת: Mosayebi, M, et al.
יצא לאור: (2014)

Electronic Circular Dichroism Spectra of DNA Quadruple Helices Studied by Molecular Dynamics Simulations and Excitonic Calculations including Charge Transfer States
מאת: Haritha Asha, et al.
יצא לאור: (2021-08-01)

Match probability calculations for multi-locus DNA profiles.
מאת: Donnelly, P
יצא לאור: (1995)

Quantum Well Model for Charge Transfer in Aperiodic DNA and Superlattice Sequences
מאת: Alan Tai
יצא לאור: (2024-08-01)

Symmetry Breaking Charge Transfer in DNA-Templated Perylene Dimer Aggregates
מאת: Katelyn M. Duncan, et al.
יצא לאור: (2022-10-01)

Mixed algorithm for modeling of charge transfer in DNA on long time intervals
מאת: Nadejda S. Fialko
יצא לאור: (2010-03-01)

StackDPP: a stacking ensemble based DNA-binding protein prediction model
מאת: Sheikh Hasib Ahmed, et al.
יצא לאור: (2024-03-01)

Insights into the control of optoelectronic properties in mixed-stacking charge-transfer complexes
מאת: Wang, Zongrui, et al.
יצא לאור: (2021)

A model for sample stacking in microcapillary DNA electrophoresis
מאת: Srivastava, Alok Kumar, 1967-
יצא לאור: (2006)

Unraveling the charge transfer variation of tetrathiafulvalene-based organic crystals through fragment charge difference calculation
מאת: Yakui Mu, et al.
יצא לאור: (2023-03-01)

The 2Ih and <sup>OXO</sup>G Proximity Consequences on Charge Transfer through <i>ds</i>-DNA: Theoretical Studies of Clustered DNA Damage
מאת: Boleslaw T. Karwowski
יצא לאור: (2023-02-01)

An accurate and linear-scaling method for calculating charge-transfer excitation energies and diabatic couplings
מאת: Pavanello, Michele, et al.
יצא לאור: (2013)

A Variational Estimate of the Binding Energy of Charge-Transfer Excitons in the Cuprate Superconductors.
מאת: Vermeulen, C, et al.
יצא לאור: (1995)

The Dynamics of Hole Transfer in DNA
מאת: Andrea Peluso, et al.
יצא לאור: (2019-11-01)

Synthesis, spectroscopic characterization, DNA binding and DFT/PCM calculations of new Hydrogen-bonded charge transfer complex between 4-dimethylaminopyridine and Chloranilic acid
מאת: Vudutha Sundarpal, et al.
יצא לאור: (2023-01-01)

Activating charge-transfer state formation in strongly-coupled dimers using DNA scaffolds
מאת: Hart, Stephanie M, et al.
יצא לאור: (2023)

The AT Interstrand Cross-Link: Structure, Electronic Properties, and Influence on Charge Transfer in dsDNA
מאת: Boleslaw T. Karwowski
יצא לאור: (2018-12-01)

Model for Rating a Vanadium Redox Flow Battery Stack through Constant Power Charge–Discharge Characterization
מאת: Pavan Kumar Vudisi, et al.
יצא לאור: (2022-08-01)

Short-Range Charge Transfer in DNA Base Triplets: Real-Time Tracking of Coherent Fluctuation Electron Transfer
מאת: Lixia Zhu, et al.
יצא לאור: (2023-09-01)

Approaches to formation and calculation of airport charges’ rates
מאת: V. A. Gubenk, et al.
יצא לאור: (2017-08-01)

The wireless DNA transfer /
מאת: Kumara Velu, 1961-
יצא לאור: (c201)

Low bias charge transport in DNA
מאת: Maciej Wiesner, et al.
יצא לאור: (2024-09-01)

Unraveling the Effect of Stacking Configurations on Charge Transfer in WS2 and Organic Semiconductor Heterojunctions
מאת: Shuchen Zhang, et al.
יצא לאור: (2023-06-01)

Charge Transfer Excitons and Possible Exitonic Pairing in the Extended Three Band Hubbard Model
מאת: Vermeulen, C, et al.
יצא לאור: (1995)

Robustness of DNA repair through collective rate control.
מאת: Paul Verbruggen, et al.
יצא לאור: (2014-01-01)

6mA-StackingCV: an improved stacking ensemble model for predicting DNA N6-methyladenine site
מאת: Guohua Huang, et al.
יצא לאור: (2023-11-01)

Rate constant calculations on the N(S-4)+OH((2)Pi) reaction
מאת: Edvardsson, D, et al.
יצא לאור: (2006)

Origin of the intermolecular forces that produce donor–acceptor stacks in π-conjugated charge-transfer complexes
מאת: Seiji Tsuzuki, et al.
יצא לאור: (2024-11-01)

Electric Field of DNA in Solution: Who Is in Charge?
מאת: Jonathan G. Hedley, et al.
יצא לאור: (2024-09-01)

Organellar electrophysiology: DNA nanodevices charging at the unmeasured
מאת: Senthil Arumugam
יצא לאור: (2024-01-01)

Charge transfer through single molecule contacts: How reliable are rate descriptions?
מאת: Denis Kast, et al.
יצא לאור: (2011-08-01)

Modeling Charge Transfer Reactions by Hopping between Electronic Ground State Minima: Application to Hole Transfer between DNA Bases
מאת: Alessandro Nicola Nardi, et al.
יצא לאור: (2022-11-01)