Estimating recombination rates from population genetic data.

Estimating recombination rates from population genetic data.

We introduce a new method for estimating recombination rates from population genetic data. The method uses a computationally intensive statistical procedure (importance sampling) to calculate the likelihood under a coalescent-based model. Detailed comparisons of the new algorithm with two existing m...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Fearnhead, P, Donnelly, P
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2001

Những quyển sách tương tự

Approximate likelihood methods for estimating local recombination rates
Bằng: Fearnhead, P, et al.
Được phát hành: (2002)

The estimation of recombination rates from population genetic data
Bằng: Auton, A
Được phát hành: (2007)

Estimating recombination rates from population-genetic data.
Bằng: Stumpf, M, et al.
Được phát hành: (2003)

Application of coalescent methods to reveal fine-scale rate variation and recombination hotspots.
Bằng: Fearnhead, P, et al.
Được phát hành: (2004)

Estimating recombination rates from genetic variation in humans.
Bằng: Auton, A, et al.
Được phát hành: (2012)

A coalescent-based method for detecting and estimating recombination from gene sequences.
Bằng: McVean, G, et al.
Được phát hành: (2002)

Estimating meiotic gene conversion rates from population genetic data.
Bằng: Gay, J, et al.
Được phát hành: (2007)

High recombination rate in herpes simplex virus type 1 natural populations suggests significant co-infection.
Bằng: Bowden, R, et al.
Được phát hành: (2004)

Recombination rate estimation in the presence of hotspots.
Bằng: Auton, A, et al.
Được phát hành: (2007)

The influence of recombination on human genetic diversity.
Bằng: Spencer, C, et al.
Được phát hành: (2006)

The influence of recombination on human genetic diversity.
Bằng: Spencer, C, et al.
Được phát hành: (2006)

DUAL PROCESSES IN POPULATION-GENETICS
Bằng: Donnelly, P
Được phát hành: (1986)

The fine-scale structure of recombination rate variation in the human genome.
Bằng: Mcvean, G, et al.
Được phát hành: (2004)

A GENEALOGICAL APPROACH TO VARIABLE-POPULATION-SIZE MODELS IN POPULATION-GENETICS
Bằng: Donnelly, P
Được phát hành: (1986)

Inference in molecular population genetics
Bằng: Stephens, M, et al.
Được phát hành: (2000)

THE TRANSIENT-BEHAVIOR OF THE MORAN MODEL IN POPULATION-GENETICS
Bằng: Donnelly, P
Được phát hành: (1984)

Recombination and population structure in Salmonella enterica.
Bằng: Didelot, X, et al.
Được phát hành: (2011)

SelSim: a program to simulate population genetic data with natural selection and recombination.
Bằng: Spencer, C, et al.
Được phát hành: (2004)

A fine-scale map of recombination rates and hotspots across the human genome.
Bằng: Myers, S, et al.
Được phát hành: (2005)

Dual processes and an invariance result for exchangeable models in population genetics.
Bằng: Donnelly, P
Được phát hành: (1985)

Ancestral inference in population genetics models with selection
Bằng: Stephens, M, et al.
Được phát hành: (2003)

High recombination rates and hotspots in a Plasmodium falciparum genetic cross.
Bằng: Jiang, H, et al.
Được phát hành: (2011)

The asymptotic behavior of an urn model arising in population genetics
Bằng: Donnelly, P, et al.
Được phát hành: (1996)

Comparison of fine-scale recombination rates in humans and chimpanzees.
Bằng: Winckler, W, et al.
Được phát hành: (2005)

Estimation of Genetic Parameters for Milk Production Rate and Its Stability in Holstein Population
Bằng: Hailiang Zhang, et al.
Được phát hành: (2024-09-01)

WEAK-CONVERGENCE TO A MARKOV-CHAIN WITH AN ENTRANCE BOUNDARY - ANCESTRAL PROCESSES IN POPULATION-GENETICS
Bằng: Donnelly, P
Được phát hành: (1991)

Genealogical processes for Fleming-Viot models with selection and recombination
Bằng: Donnelly, P, et al.
Được phát hành: (1999)

Recombination Rates, their local variation and the estimated number of hotspots in the human genome.
Bằng: Stumpf, M, et al.
Được phát hành: (2003)

The influence of mutation, recombination, population history, and selection on patterns of genetic diversity in Neisseria meningitidis.
Bằng: Jolley, K, et al.
Được phát hành: (2005)

A comparison of bayesian methods for haplotype reconstruction from population genotype data.
Bằng: Stephens, M, et al.
Được phát hành: (2003)

Likelihoods and simulation methods for a class of nonneutral population genetics models.
Bằng: Donnelly, P, et al.
Được phát hành: (2001)

Recombination and Genetic Diversity
Bằng: Thamara Carvalho Coutinho, et al.
Được phát hành: (2012-12-01)

Molecular genetics of recombination/
Bằng: Aguilera, Andres, et al.
Được phát hành: (2007)

Replicated high-density genetic maps of two great tit populations reveal fine-scale genomic departures from sex-equal recombination rates.
Bằng: van Oers, K, et al.
Được phát hành: (2014)

A new statistical method for haplotype reconstruction from population data.
Bằng: Stephens, M, et al.
Được phát hành: (2001)

Rapid evolution and the importance of recombination to the gastroenteric pathogen Campylobacter jejuni.
Bằng: Wilson, D, et al.
Được phát hành: (2009)

The effects of human population structure on large genetic association studies.
Bằng: Marchini, J, et al.
Được phát hành: (2004)

Genetic Engineering by DNA Recombineering
Bằng: Papa, Louis John, et al.
Được phát hành: (2021)

Genetic recombination in bacteriophage lambda
Bằng: Hillyar, C
Được phát hành: (2012)

Genetic recombination in bacteriophage lambda
Bằng: Hillyar, C
Được phát hành: (2012)