New core promoter element in RNA polymerase II-dependent transcription: sequence-specific DNA binding by transcription factor IIB.

New core promoter element in RNA polymerase II-dependent transcription: sequence-specific DNA binding by transcription factor IIB.

A sequence element located immediately upstream of the TATA element, and having the consensus sequence 5'-G/C-G/C-G/A-C-G-C-C-3', affects the ability of transcription factor IIB to enter transcription complexes and support transcription initiation. The sequence element is recognized direct...

সম্পূর্ণ বিবরণ

গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক:	Lagrange, T, Kapanidis, A, Tang, H, Reinberg, D, Ebright, R
বিন্যাস:	Journal article
ভাষা:	English
প্রকাশিত:	1998

অনুরূপ উপাদানগুলি

Initial transcription by RNA polymerase proceeds through a DNA-scrunching mechanism.
অনুযায়ী: Kapanidis, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2006)

Translocation of sigma(70) with RNA polymerase during transcription: fluorescence resonance energy transfer assay for movement relative to DNA.
অনুযায়ী: Mukhopadhyay, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2001)

RNA polymerase clamp conformational dynamics: long-lived states and modulation by crowding, cations, and nonspecific DNA binding
অনুযায়ী: Mazumder, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: Implications for transcription start-site selection
অনুযায়ী: Robb, N, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2013)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: implications for transcription start-site selection.
অনুযায়ী: Robb, N, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2013)

Transcription initiation at a consensus bacterial promoter proceeds via a 'bind-unwind-load-and-lock' mechanism
অনুযায়ী: Mazumder, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021)

Closing and opening of the RNA polymerase trigger loop
অনুযায়ী: Mazumder, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020)

Pause sequences facilitate entry into long-lived paused states by reducing RNA polymerase transcription rates
অনুযায়ী: Ronen Gabizon, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018-07-01)

RNA polymerase pausing during initial transcription
অনুযায়ী: Duchi, D, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016)

Transcription initiation at a consensus bacterial promoter proceeds via a ‘bind-unwind-load-and-lock’ mechanism
অনুযায়ী: Abhishek Mazumder, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-10-01)

Phosphorylation controls RNA binding and transcription by the influenza virus polymerase.
অনুযায়ী: Anthony R Dawson, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-09-01)

Structural organization of bacterial RNA polymerase holoenzyme and the RNA polymerase-promoter open complex.
অনুযায়ী: Mekler, V, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Rho-dependent transcription termination in bacteria recycles RNA polymerases stalled at DNA lesions
অনুযায়ী: Sriyans Jain, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-03-01)

Real-time transcription initiation by E. coli RNA polymerase in vitro and in vivo
অনুযায়ী: Plochowietz, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2015)

AT-rich sequence elements promote nascent transcript cleavage leading to RNA polymerase II termination.
অনুযায়ী: White, E, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2013)

Cooperative RNA polymerase molecules behavior on a stochastic sequence-dependent model for transcription elongation.
অনুযায়ী: Pedro Rafael Costa, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2013-01-01)

Sensitivity of mitochondrial transcription and resistance of RNA polymerase II dependent nuclear transcription to antiviral ribonucleosides.
অনুযায়ী: Jamie J Arnold, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2012-01-01)

Three-dimensional strictures of RNA polymerase holoenzyme and the RNA polymerase-promoter open complex: Systematic fluorescence resonance energy transfer and distance-constrained docking
অনুযায়ী: Mekler, V, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Transcriptional bursting is intrinsically caused by interplay between RNA polymerases on DNA
অনুযায়ী: Keisuke Fujita, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016-12-01)

Fluorescence resonance energy transfer (FRET) in analysis of transcription-complex structure and function.
অনুযায়ী: Mukhopadhyay, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

Transcription termination by RNA Polymerase II
অনুযায়ী: White, E
প্রকাশিত: (2012)

Mediator and RNA polymerase II clusters associate in transcription-dependent condensates
অনুযায়ী: Cho, Won-ki, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020)

TRE5-A retrotransposition profiling reveals putative RNA polymerase III transcription complex binding sites on the Dictyostelium extrachromosomal rDNA element.
অনুযায়ী: Thomas Spaller, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2017-01-01)

Role of the RNA/DNA kinase Grc3 in transcription termination by RNA polymerase I.
অনুযায়ী: Braglia, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010)

Transcription reinitiation by recycling RNA polymerase that diffuses on DNA after releasing terminated RNA
অনুযায়ী: Kang, W, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020)

Transcription by an immobilized RNA polymerase from bacteriophage T7 and the topology of transcription.
অনুযায়ী: Cook, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (1992)

Development of a method for evaluating the mRNA transcription activity of influenza virus RNA-dependent RNA polymerase through real-time reverse transcription polymerase chain reaction
অনুযায়ী: Yuka Horio, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-08-01)

Fixing the model for transcription: the DNA moves, not the polymerase.
অনুযায়ী: Papantonis, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

Structural transitions in transcription initiation: Kinetic and single molecule kinetic analyses
অনুযায়ী: Mukhopadhyay, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2001)

Characterizing intergenic transcription at RNA polymerase II binding sites in normal and cancer tissues
অনুযায়ী: Pierre de Langen, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-10-01)

Extragenic accumulation of RNA polymerase II enhances transcription by RNA polymerase III.
অনুযায়ী: Imke Listerman, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2007-11-01)

Role of R-loops in pause-dependent transcriptional termination of RNA polymerase II
অনুযায়ী: Skourti-Stathaki, K
প্রকাশিত: (2012)

CDK9-dependent RNA polymerase II pausing controls transcription initiation
অনুযায়ী: Saskia Gressel, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2017-10-01)

Non-programmed transcriptional frameshifting is common and highly RNA polymerase type-dependent
অনুযায়ী: Dawid Koscielniak, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018-11-01)

Exon tethering in transcription by RNA polymerase II.
অনুযায়ী: Dye, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2006)

Alternative transcription cycle for bacterial RNA polymerase
অনুযায়ী: Harden, Timothy T, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021)

Alternative transcription cycle for bacterial RNA polymerase
অনুযায়ী: Timothy T. Harden, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-01-01)

The conserved protein Seb1 drives transcription termination by binding RNA polymerase II and nascent RNA
অনুযায়ী: Wittmann, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2017)

Retention of transcription initiation factor sigma70 in transcription elongation: single-molecule analysis.
অনুযায়ী: Kapanidis, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2005)

Mapping DNA sequence to transcription factor binding energy in vivo.
অনুযায়ী: Stephanie L Barnes, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-02-01)