A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies

A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies

Показати інші версії (1)

Genotype imputation methods are now being widely used in the analysis of genome-wide association studies. Most imputation analyses to date have used the HapMap as a reference dataset, but new reference panels (such as controls genotyped on multiple SNP chips and densely typed samples from the 1,000...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Howie, B, Donnelly, P, Marchini, J
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	Public Library of Science 2009
Предмети:	Statistics (see also social sciences) Genetics (medical sciences)

Схожі ресурси

A robust clustering algorithm for identifying problematic samples in genome-wide association studies
за авторством: Bellenguez, C, та інші
Опубліковано: (2012)

HLA*IMP - an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes
за авторством: Dilthey, A, та інші
Опубліковано: (2011)

Quantifying the underestimation of relative risks from genome-wide association studies
за авторством: Spencer, C, та інші
Опубліковано: (2011)

Using phylogeny to improve genome-wide distant homology recognition
за авторством: Abeln, S, та інші
Опубліковано: (2007)

Extensions of the case-control design in genome-wide association studies
за авторством: Loizides, C
Опубліковано: (2012)

QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data
за авторством: Colella, S, та інші
Опубліковано: (2007)

Disease model distortion in association studies
за авторством: Vukcevic, D, та інші
Опубліковано: (2011)

Synonymous codon usage influences the local protein structure observed
за авторством: Saunders, R, та інші
Опубліковано: (2010)

Markov fields and log-linear interaction models for contingency tables
за авторством: Darroch, J, та інші
Опубліковано: (1980)

Models and software for improving the profitability of pharmaceutical research
за авторством: Qu, S
Опубліковано: (2011)

Hyper Markov laws in the statistical analysis of decomposable graphical models
за авторством: Dawid, A, та інші
Опубліковано: (1993)

Graphical models for associations between variables, some of which are quantitative and some qualitative
за авторством: Lauritzen, S, та інші
Опубліковано: (1989)

Graphical models for genetic analyses
за авторством: Lauritzen, S, та інші
Опубліковано: (2003)

Some problems in the theory & application of graphical models
за авторством: Roddam, A
Опубліковано: (1999)

A coalescent dual process in a Moran model with genic selection, and the lambda coalescent limit
за авторством: Etheridge, A, та інші
Опубліковано: (2010)

How threshold behaviour affects the use of subgraphs for network comparison
за авторством: Rito, T, та інші
Опубліковано: (2010)

Some aspects of complex statistical dependencies
за авторством: Kartsonaki, C
Опубліковано: (2014)

An approximate sampling formula under genetic hitchhiking
за авторством: Etheridge, A, та інші
Опубліковано: (2006)

A Bayesian cost-benefit approach to sample size determination and evaluation in clinical trials
за авторством: Kikuchi, T
Опубліковано: (2011)

Statistical HLA type imputation from large and heterogeneous datasets
за авторством: Dilthey, A
Опубліковано: (2012)

Protein protein interactions, evolutionary rate, abundance and age
за авторством: Saeed, R, та інші
Опубліковано: (2006)

Cotranslational protein folding - fact or fiction?
за авторством: Deane, C, та інші
Опубліковано: (2007)

Modelling sequential protein folding under kinetic control
за авторством: Huard, F, та інші
Опубліковано: (2006)

A statistical approach using network structure in the prediction of protein characteristics
за авторством: Chen, P, та інші
Опубліковано: (2007)

Multilocus approaches to the detection of disease susceptibility regions: methods and applications
за авторством: Ciampa, J
Опубліковано: (2012)

Bayesian methods for multivariate phenotype analysis in genome-wide association studies
за авторством: Iotchkova, V
Опубліковано: (2013)

Bayesian analysis in expert systems
за авторством: Spiegelhalter, D, та інші
Опубліковано: (1993)

On the moments and the interface of the symbiotic branching model
за авторством: Blath, J, та інші
Опубліковано: (2011)

The relation between multilocus population genetics and social evolution theory
за авторством: Gardner, A, та інші
Опубліковано: (2007)

A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies.
за авторством: Howie, B, та інші
Опубліковано: (2009)

Reporting of prognostic studies of tumour markers: a review of published articles in relation to REMARK guidelines
за авторством: Mallett, S, та інші
Опубліковано: (2010)

A Bayesian approach to the evolution of metabolic networks on a phylogeny
за авторством: Mithani, A, та інші
Опубліковано: (2010)

A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies.
за авторством: Bryan N Howie, та інші
Опубліковано: (2009-06-01)

Rahnuma: hypergraph-based tool for metabolic pathway prediction and network comparison
за авторством: Mithani, A, та інші
Опубліковано: (2009)

Reweighting methods in high dimensional regression
за авторством: Fang, Z
Опубліковано: (2012)

Why are some more peer than others? Evidence from a longitudinal study of social networks and individual academic performance
за авторством: Lomi, A, та інші
Опубліковано: (2011)

School-aged children: a reservoir for continued circulation of Haemophilus influenzae Type b in the United Kingdom
за авторством: Oh, S, та інші
Опубліковано: (2008)

Serogroup c meningococcal glycoconjugate vaccine in adolescents: persistence of bactericidal antibodies and kinetics of the immune response to a booster vaccine more than 3 years after immunization
за авторством: Snape, M, та інші
Опубліковано: (2006)

On auxiliary variables and many-core architectures in computational statistics
за авторством: Lee, A
Опубліковано: (2011)

Linear programming algorithms for detecting separated data in binary logistic regression models
за авторством: Konis, K
Опубліковано: (2007)