Annotation of selection strengths in viral genomes.

Annotation of selection strengths in viral genomes.

MOTIVATION: Viral genomes tend to code in overlapping reading frames to maximize informational content. This may result in atypical codon bias and particular evolutionary constraints. Due to the fast mutation rate of viruses, there is additional strong evidence for varying selection between intra-...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	McCauley, S, de Groot, S, Mailund, T, Hein, J
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2007

Những quyển sách tương tự

Comparative annotation of viral genomes with non-conserved gene structure.
Bằng: de Groot, S, et al.
Được phát hành: (2007)

Using hidden Markov models and observed evolution to annotate viral genomes
Bằng: McCauley, S, et al.
Được phát hành: (2006)

Using hidden Markov models and observed evolution to annotate viral genomes.
Bằng: McCauley, S, et al.
Được phát hành: (2006)

Genome annotation and selectional analysis of viral evolution
Bằng: de Groot, S
Được phát hành: (2008)

Investigating selection on viruses: a statistical alignment approach.
Bằng: de Groot, S, et al.
Được phát hành: (2008)

Investigating selection on viruses: a statistical alignment approach
Bằng: Lunter Gerton, et al.
Được phát hành: (2008-07-01)

Vgas: A Viral Genome Annotation System
Bằng: Kai-Yue Zhang, et al.
Được phát hành: (2019-02-01)

VIGOR, an annotation program for small viral genomes
Bằng: Wang Shiliang, et al.
Được phát hành: (2010-09-01)

Genome annotation for clinical genomic diagnostics: strengths and weaknesses
Bằng: Charles A. Steward, et al.
Được phát hành: (2017-05-01)

Towards Viral Genome Annotation Standards, Report from the 2010 NCBI Annotation Workshop
Bằng: Qiandong Zeng, et al.
Được phát hành: (2010-10-01)

Genome Annotation Transfer Utility (GATU): rapid annotation of viral genomes using a closely related reference genome
Bằng: Upton Chris, et al.
Được phát hành: (2006-06-01)

FLAVi: An Enhanced Annotator for Viral Genomes of <i>Flaviviridae</i>
Bằng: Adriano de Bernadi Schneider, et al.
Được phát hành: (2020-08-01)

Manual Annotation Studio (MAS): a collaborative platform for manual functional annotation of viral and microbial genomes
Bằng: Matthew R. Lueder, et al.
Được phát hành: (2021-10-01)

Using biological networks to search for interacting loci in genome-wide association studies.
Bằng: Emily, M, et al.
Được phát hành: (2009)

Improving viral annotation with artificial intelligence
Bằng: Zachary N. Flamholz, et al.
Được phát hành: (2024-10-01)

Genome annotation /
Bằng: Soh, Jung, et al.
Được phát hành: (2013)

Annotated Bioinformatic Pipelines for Genome Assembly and Annotation of Mitochondrial Genomes
Bằng: Jessica Winn, et al.
Được phát hành: (2025-03-01)

CAULIFINDER: a pipeline for the automated detection and annotation of caulimovirid endogenous viral elements in plant genomes
Bằng: Héléna Vassilieff, et al.
Được phát hành: (2022-12-01)

Functional annotation of the animal genomes: An integrated annotation resource for the horse.
Bằng: Sichong Peng, et al.
Được phát hành: (2023-03-01)

Atrial Cardiomyopathy: An Unexplored Limb of Virchow's Triad for AF Stroke Prophylaxis
Bằng: Ashley Darlington, et al.
Được phát hành: (2020-02-01)

Survival of the fittest: leadership, organisational design, and outcomes of intrastate war
Bằng: McCauley, A
Được phát hành: (2021)

Box making methods and costs: Comparison of labor and equipment costs with various methods of making pear, apple, and grape boxes
Bằng: B McCauley
Được phát hành: (1954-02-01)

Countering Extremist Violence (CEV)
Bằng: Clark McCauley
Được phát hành: (2021-03-01)

The Europeanisation of Domestic Opportunities for Movements:The Influence of NATURA 2000 on Anti-incinerator Campaigns in France
Bằng: Darren McCauley
Được phát hành: (2010-08-01)

Beyond the Classroom: The Intergenerational Effect of Incarceration on Children’s Academic and Nonacademic School-Related Outcomes in High School
Bằng: Erin McCauley
Được phát hành: (2020-04-01)

Frights : stories of suspense and supernatural terror /
Bằng: McCauley, Kirby
Được phát hành: (1976)

Research Note: The role of ideas in radicalization to terrorism: Ideology and narrative vs. diagnostic, prognostic, and motivational action frames
Bằng: Clark McCauley
Được phát hành: (2024-03-01)

How women's experiences and perceptions of care influence uptake of postnatal care across sub-Saharan Africa: a qualitative systematic review
Bằng: Caitlin Lythgoe, et al.
Được phát hành: (2021-07-01)

The COVID-19 pandemic behind bars: Experimental evidence showing higher support for decarceration when framed as risk to correctional staff
Bằng: Erin J. McCauley
Được phát hành: (2022-09-01)

gb4gv: a genome browser for geminivirus
Bằng: Eric S. Ho, et al.
Được phát hành: (2017-04-01)

Re-annotated genome of Nicotiana benthamiana
Bằng: Kourelis, J
Được phát hành: (2018)

Annotating the Insect Regulatory Genome
Bằng: Hasiba Asma, et al.
Được phát hành: (2021-06-01)

Apollo: Democratizing genome annotation.
Bằng: Nathan A Dunn, et al.
Được phát hành: (2019-02-01)

Functional Annotation Analytics of Genomes
Bằng: Shaneka S. Simmons, et al.
Được phát hành: (2011-01-01)

Genome annotation [electronic resource] /
Bằng: Soh, Jung, et al.
Được phát hành: (2013)

VIBRANT: automated recovery, annotation and curation of microbial viruses, and evaluation of viral community function from genomic sequences
Bằng: Kristopher Kieft, et al.
Được phát hành: (2020-06-01)

Computational genomics : mapping, comparison, and annotation of genomes
Bằng: Batzoglou, Serafim
Được phát hành: (2005)

Radio and television : a selected annotated bibliography /
Bằng: McCavitt, William E., 1932-
Được phát hành: (1978)

Twenty-five years in: Landmark empirical findings in the cognitive science of religion
Bằng: Robert N. McCauley
Được phát hành: (2018-12-01)

The new science of complexity
Bằng: Joseph L. McCauley
Được phát hành: (1997-01-01)