Lipidbook: A Public Repository for Force-Field Parameters Used in Membrane Simulations

Lipidbook: A Public Repository for Force-Field Parameters Used in Membrane Simulations

অন্যান্য সংস্করণ প্রদর্শন করুন (1)

গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক:	Domański, J, Stansfeld, P, Sansom, M, Beckstein, O
বিন্যাস:	Journal article
প্রকাশিত:	2010

অনুরূপ উপাদানগুলি

Lipidbook: a public repository for force-field parameters used in membrane simulations.
অনুযায়ী: Domański, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010)

Balancing force field protein-lipid interactions to capture transmembrane helix-helix association
অনুযায়ী: Domański, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018)

Molecular simulation approaches to membrane proteins.
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

From Coarse Grained to Atomistic: A Serial Multiscale Approach to Membrane Protein Simulations
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

Multiscale simulations of lipid interactions with integral membrane proteins: aquaporins
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

Coarse-grain simulations reveal movement of the synaptobrevin C-terminus in response to piconewton forces.
অনুযায়ী: Lindau, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2012)

Memprotmd: adding the grease to membrane protein structures
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2012)

Biomimetic design of a brush-like nanopore: simulation studies.
অনুযায়ী: Pongprayoon, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2012)

Water in transmembrane pores: Simulation studies.
অনুযায়ী: Sansom, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2001)

Multiple lipid binding sites determine the affinity of PH domains for phosphoinositide-containing membranes
অনুযায়ী: Domański, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020)

The MemProtMD database: A resource for membrane-embedded protein structures and their lipid interactions
অনুযায়ী: Newport, T, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018)

Computational studies of membrane proteins: from sequence to structure to simulation.
অনুযায়ী: Stansfeld, P
প্রকাশিত: (2017)

Simulations of anion transport through OprP reveal the molecular basis for high affinity and selectivity for phosphate.
অনুযায়ী: Pongprayoon, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2009)

Insights into membrane protein-lipid interactions from free energy calculations
অনুযায়ী: Corey, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019)

Continuum vs. particle simulations of model nano-pores
অনুযায়ী: Millar, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2007)

The influence of geometry, surface character, and flexibility on the permeation of ions and water through biological pores.
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2004)

A hydrophobic gate in an ion channel: the closed state of the nicotinic acetylcholine receptor.
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2006)

Conformational Space and Dynamics of Sodium-Coupled Symporters
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

The closed gate of the nicotinic receptor, identified by molecular dynamics free energy calculations
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2005)

The importance of surface character, geometry and flexibility in a hydrophobic gating mechanism for ion channels
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2004)

Liquid-vapor oscillations of water in hydrophobic nanopores.
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

BioSimGrid: towards a worldwide repository for biomolecular simulations.
অনুযায়ী: Tai, K, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2004)

Simulations of the BM2 proton channel transmembrane domain from influenza virus B.
অনুযায়ী: Rouse, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2009)

Atomistic mechanism of transmembrane helix association.
অনুযায়ী: Jan Domański, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-06-01)

Interactions of the EphA2 kinase domain with PIPs in membranes: implications for receptor function
অনুযায়ী: Chavent, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018)

Brownian simulation of charge transport in α-Haemolysin
অনুযায়ী: Millar, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Brownian simulation of charge transport in alpha-Haemolysin
অনুযায়ী: Millar, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

The energetics of protein-lipid interactions as viewed by molecular simulations
অনুযায়ী: Corey, RA, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019)

Energetics of protein interactions in the membrane via computer simulations
অনুযায়ী: Domanski, J
প্রকাশিত: (2017)

A hydrophobic gating mechanism for nanopores
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2001)

Lipid loving ANTs: Molecular simulations of cardiolipin interactions and the organization of the adenine nucleotide translocase in model mitochondrial membranes
অনুযায়ী: Sansom, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016)

Simulation-based prediction of phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate binding to an ion channel.
অনুযায়ী: Schmidt, MR, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2013)

A BEST example of channel structure annotation by molecular simulation
অনুযায়ী: Rao, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2017)

Library adoption in public software repositories
অনুযায়ী: Rachel Krohn, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-05-01)

PIP(2)-binding site in Kir channels: definition by multiscale biomolecular simulations.
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2009)

PIP2-binding site in Kir channels: definition by multiscale biomolecular simulations
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2009)

Dataset of AMBER force field parameters of drugs, natural products and steroids for simulations using GROMACS
অনুযায়ী: Jennifer Loschwitz, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-04-01)

Features of the strawberry field repository formation
অনুযায়ী: M. T. Upadyshev, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-10-01)

Not ions alone: barriers to ion permeation in nanopores and channels.
অনুযায়ী: Beckstein, O, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2004)

Investigating the PIP2 Binding Site in Kir Channels Via Multi-Scale Biomolecular Simulations
অনুযায়ী: Stansfeld, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010)