Model decomposition and reduction tools for large-scale networks in systems biology.

Model decomposition and reduction tools for large-scale networks in systems biology.

Biological system models are routinely developed in modern systems biology research following appropriate modelling/experiment design cycles. Frequently these take the form of high-dimensional nonlinear Ordinary Differential Equations that integrate information from several sources; they usually con...

תיאור מלא

מידע ביבליוגרפי
Main Authors:	Anderson, J, Chang, Y, Papachristodoulou, A
פורמט:	Journal article
שפה:	English
יצא לאור:	2011

פריטים דומים

Large-scale layered systems and synthetic biology: model reduction and decomposition
מאת: Prescott, T, et al.
יצא לאור: (2014)

A structured model reduction method for large scale networks.
מאת: Chu, B, et al.
יצא לאור: (2011)

Structured model reduction for dynamical networked systems.
מאת: Papachristodoulou, A, et al.
יצא לאור: (2010)

Layered decomposition for the model order reduction of timescale separated biochemical reaction networks.
מאת: Prescott, T, et al.
יצא לאור: (2014)

Dynamical system decomposition for efficient, sparse analysis.
מאת: Anderson, J, et al.
יצא לאור: (2010)

Stability analysis of power systems using network decomposition and local gain analysis
מאת: Anghel, M, et al.
יצא לאור: (2013)

A Decomposition Technique for Nonlinear Dynamical System Analysis.
מאת: Anderson, J, et al.
יצא לאור: (2012)

A Network Decomposition Approach for Efficient Sum of Squares Programming Based Analysis
מאת: Anderson, J, et al.
יצא לאור: (2010)

Dynamical system decomposition using dissipation inequalities.
מאת: Anderson, J, et al.
יצא לאור: (2011)

Methodological frameworks for large-scale network analysis and design.
מאת: Papachristodoulou, A, et al.
יצא לאור: (2004)

On validation and invalidation of biological models
מאת: Anderson, J, et al.
יצא לאור: (2009)

Nonlinear Control of Large Scale complex Systems using Convex Control Design tools
מאת: Kosmatopoulos, E, et al.
יצא לאור: (2011)

A decomposition/synchronization scheme for formulating and solving optimization problems
מאת: Anderson, J, et al.
יצא לאור: (2009)

Nonlinear control of large scale complex systems using convex optimization tools and self-adaptation.
מאת: Baldi, S, et al.
יצא לאור: (2011)

Optimal network decomposition and load flow analyses for large scale power systems /
מאת: 434883 Lee, Jang G., et al.

sbml-diff: A tool for visually comparing SBML models in synthetic biology.
מאת: Scott-Brown, J, et al.
יצא לאור: (2016)

From Domain Decomposition to Model Reduction for Large Nonlinear Structures
מאת: Leturcq, Bertrand, et al.
יצא לאור: (2023-05-01)

On validation and invalidation of biological models
מאת: Anderson James, et al.
יצא לאור: (2009-05-01)

SOS for Nonlinear Delayed Models in Biology and Networking
מאת: Papachristodoulou, A, et al.
יצא לאור: (2009)

Analysis of nonlinear time-delay systems using the sum of squares decomposition
מאת: Papachristodoulou, A
יצא לאור: (2004)

Analysis of non-polynomial systems using the sum of squares decomposition
מאת: Papachristodoulou, A, et al.
יצא לאור: (2005)

Analysis of nonlinear time-delay systems using the sum of squares decomposition
מאת: Papachristodoulou, A, et al.
יצא לאור: (2004)

Thevenin decomposition and large-scale optimization
יצא לאור: (2003)

Decomposition of large-scale problems : proceedings/
מאת: NATO Institute on Decomposition (1972 : Cambridge, England), et al.
יצא לאור: (1973)

Decomposition and completion of sum-of-squares matrices
מאת: Zheng, Y, et al.
יצא לאור: (2018)

The Sum of the Parts: Large-Scale Modeling in Systems Biology
מאת: Fridolin Gross, et al.
יצא לאור: (2017-01-01)

Large-Scale Evolutionary Optimization Approach Based on Decision Space Decomposition
מאת: Jia Ma, et al.
יצא לאור: (2022-06-01)

Removal of Large-Scale Stripes Via Unidirectional Multiscale Decomposition
מאת: Luxiao He, et al.
יצא לאור: (2019-10-01)

Delay-dependent rendezvous and flocking of large scale multi-agent systems with communication delays.
מאת: Münz, U, et al.
יצא לאור: (2008)

Analysis of Polynomial Systems With Time Delays via the Sum of Squares Decomposition.
מאת: Papachristodoulou, A, et al.
יצא לאור: (2009)

Structural identifiability of dynamic systems biology models
מאת: Villaverde, A, et al.
יצא לאור: (2016)

Guaranteed error bounds for structured complexity reduction of biochemical networks.
מאת: Prescott, T, et al.
יצא לאור: (2012)

Web tools for large-scale 3D biological images and atlases
מאת: Husz Zsolt L, et al.
יצא לאור: (2012-06-01)

Efficient, sparse biological network determination
מאת: August, E, et al.
יצא לאור: (2009)

Scalable design of structured controllers using chordal decomposition
מאת: Zheng, Y, et al.
יצא לאור: (2017)

Model-constrained optimization methods for reduction of parameterized large-scale systems
מאת: Bui-Thanh, Tan
יצא לאור: (2008)

Model-Constrained Optimization Methods for Reduction of Parameterized Large-Scale Systems
מאת: Tan, Bui-Thanh
יצא לאור: (2010)

Chordal and factor-width decompositions for scalable semidefinite and polynomial optimization
מאת: Zheng, Y, et al.
יצא לאור: (2021)

Tucker Decomposition-Based Network Compression for Anomaly Detection With Large-Scale Hyperspectral Images
מאת: Yulei Wang, et al.
יצא לאור: (2024-01-01)

Decomposition techniques for large-scale optimization in the supply chain
מאת: Sanneman, Lindsay (Lindsay Michelle)
יצא לאור: (2018)