Continuum vs. particle simulations of model nano-pores

Continuum vs. particle simulations of model nano-pores

The class of biological macromolecules known as ion channels are becoming of great interest to physical scientists and engineers, as well as biophysicists and pharmacologists. The long term stability and wide range of properties displayed by this large group of proteins makes them one of the most po...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Millar, C, Roy, S, Beckstein, O, Sansom, M, Asenov, A
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2007

Những quyển sách tương tự

Brownian simulation of charge transport in alpha-Haemolysin
Bằng: Millar, C, et al.
Được phát hành: (2008)

Brownian simulation of charge transport in α-Haemolysin
Bằng: Millar, C, et al.
Được phát hành: (2008)

Water in transmembrane pores: Simulation studies.
Bằng: Sansom, M, et al.
Được phát hành: (2001)

The influence of geometry, surface character, and flexibility on the permeation of ions and water through biological pores.
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2004)

Water in ion channels and pores--simulation studies.
Bằng: Sansom, MS, et al.
Được phát hành: (2002)

OmpA: a pore or not a pore? Simulation and modeling studies.
Bằng: Bond, P, et al.
Được phát hành: (2002)

Biomimetic design of a brush-like nanopore: simulation studies.
Bằng: Pongprayoon, P, et al.
Được phát hành: (2012)

Equivalent Circuit and Continuum Modeling of the Impedance of Electrolyte-Filled Pores
Bằng: Christian Pedersen, et al.
Được phát hành: (2023-10-01)

Preparation of Nano Pore ZSM-5 Membranes: Experimental, Modeling and Simulation
Bằng: Mansoor Kazemimoghadam, et al.
Được phát hành: (2018-01-01)

Lipidbook: A Public Repository for Force-Field Parameters Used in Membrane Simulations
Bằng: Domański, J, et al.
Được phát hành: (2010)

The pore domain of the nicotinic acetylcholine receptor: molecular modeling, pore dimensions, and electrostatics
Bằng: Sankararamakrishnan, R, et al.
Được phát hành: (1996)

Simulations of anion transport through OprP reveal the molecular basis for high affinity and selectivity for phosphate.
Bằng: Pongprayoon, P, et al.
Được phát hành: (2009)

Improved Volume-Of-Solid Formulations for Micro-Continuum Simulation of Mineral Dissolution at the Pore-Scale
Bằng: Julien Maes, et al.
Được phát hành: (2022-07-01)

Transbilayer pores formed by β-barrels: molecular modeling of pore structures and properties
Bằng: Sansom, M, et al.
Được phát hành: (1995)

Conformational Space and Dynamics of Sodium-Coupled Symporters
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2011)

The closed gate of the nicotinic receptor, identified by molecular dynamics free energy calculations
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2005)

The importance of surface character, geometry and flexibility in a hydrophobic gating mechanism for ion channels
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2004)

Lipidbook: a public repository for force-field parameters used in membrane simulations.
Bằng: Domański, J, et al.
Được phát hành: (2010)

Simulations of a protein translocation pore: SecY.
Bằng: Haider, S, et al.
Được phát hành: (2006)

Continuum modeling of particle suspension conductivity
Bằng: Olsen, Tyler J. (Tyler John)
Được phát hành: (2016)

A hydrophobic gate in an ion channel: the closed state of the nicotinic acetylcholine receptor.
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2006)

Liquid-vapor oscillations of water in hydrophobic nanopores.
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2003)

Coarse-grain simulations reveal movement of the synaptobrevin C-terminus in response to piconewton forces.
Bằng: Lindau, M, et al.
Được phát hành: (2012)

Simulation experiment and mathematical model analysis for shale gas diffusion in nano-scale pores
Bằng: Yu ZOU, et al.
Được phát hành: (2021-09-01)

Fluid‐Driven Transport of Round Sediment Particles: From Discrete Simulations to Continuum Modeling
Bằng: Zhang, Qiong, et al.
Được phát hành: (2022)

Simulation of diffusiophoresis force and the confinement effect of Janus particles with the continuum method
Bằng: Meiling Wu, et al.
Được phát hành: (2014-03-01)

Continuum modeling of dislocation starvation and subsequent nucleation in nano-pillar compressions
Bằng: Jérusalem, A, et al.
Được phát hành: (2012)

Simulation and Modeling of Novel Electronic Device Architectures with NESS (Nano-Electronic Simulation Software): A Modular Nano TCAD Simulation Framework
Bằng: Cristina Medina-Bailon, et al.
Được phát hành: (2021-06-01)

Atomistic and Continuum Simulations on Tensile Property of a Single Crystal Metal with Nano-holes
Bằng: Mehdi Rezaei Farimani, et al.
Được phát hành: (2007-12-01)

Electrostatics studies and molecular dynamics simulations of a homology model of the Shaker K+ channel pore.
Bằng: Ranatunga, K, et al.
Được phát hành: (2001)

A hydrophobic gating mechanism for nanopores
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2001)

Pore-Scale Simulation of Particle Flooding for Enhancing Oil Recovery
Bằng: Xiangbin Liu, et al.
Được phát hành: (2021-04-01)

The dielectric properties of water within model transbilayer pores
Bằng: Sansom, M, et al.
Được phát hành: (1997)

Radio continuum surveys and galaxy evolution: modelling and simulations
Bằng: Slyz, A, et al.
Được phát hành: (2016)

Pore-Scale Modeling of Methane Hydrate Dissociation Using a Multiphase Micro-Continuum Framework
Bằng: Zhiying Liu, et al.
Được phát hành: (2023-11-01)

Dielectric Properties of Aqueous Electrolyte Solutions Confined in Silica Nanopore: Molecular Simulation vs. Continuum-Based Models
Bằng: Haochen Zhu, et al.
Được phát hành: (2022-02-01)

Structure and dynamics of K channel pore-lining helices: a comparative simulation study.
Bằng: Shrivastava, I, et al.
Được phát hành: (2000)

Inflammation and the continuum model: time to acknowledge the molecular era of tendinopathy.
Bằng: Millar, N, et al.
Được phát hành: (2016)

Not ions alone: barriers to ion permeation in nanopores and channels.
Bằng: Beckstein, O, et al.
Được phát hành: (2004)

Induction of nano pore in Agrobacterial hemoglobin
Bằng: Mojtaba Tousheh, et al.
Được phát hành: (2014-01-01)