In vitro, in silico and in vivo studies of the structure and conformational dynamics of DNA Polymerase I

In vitro, in silico and in vivo studies of the structure and conformational dynamics of DNA Polymerase I

DNA polymerases are a family of molecular machines involved in high-fidelity DNA replication and repair, of which DNA polymerase I (Pol) is one the best-characterized members. Pol is a strand-displacing polymerase responsible for Okazaki fragment synthesis and base-excision repair in bacteria; it co...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Tác giả chính:	Sustarsic, M
Tác giả khác:	Kapanidis, A
Định dạng:	Luận văn
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2015
Những chủ đề:	Electroporation Biochemistry Fluorescence microscopy DNA polymerases Molecular dynamics Biophysics

Những quyển sách tương tự

Fluorescence studies of influenza RNA and RNA polymerase
Bằng: Tomescu, A
Được phát hành: (2014)

Single-molecule DNA sensors and cages for transcription factors in vitro and in vivo
Bằng: Crawford, R
Được phát hành: (2011)

Pushing the boundaries: molecular dynamics simulations of complex biological membranes
Bằng: Parton, D
Được phát hành: (2011)

Structure-function studies of the bacterial dsDNA translocase FtsK
Bằng: Graham, JE
Được phát hành: (2010)

Molecular dynamics study of water and Na⁺ ions in models of the pore region of the nicotinic acetylcholine receptor
Bằng: Smith, G, et al.
Được phát hành: (1997)

The relationship between flagellar motor dynamics and the proton motive force
Bằng: Tipping, M, et al.
Được phát hành: (2011)

Investigating the role of lipids and small-molecule ligands in hedgehog signalling using molecular dynamics simulations
Bằng: Ansell, T
Được phát hành: (2022)

Interactions of Neisseria meningitidis with the human immune system
Bằng: Harding, R
Được phát hành: (2015)

The regulation and inhibition of P-TEFb
Bằng: Hole, A
Được phát hành: (2011)

Structural studies of a membrane embedded chloride channel from E.Coli, a prokaryotic homologue of ClC channels
Bằng: Bowler, M, et al.
Được phát hành: (2001)

Kv channel gating requires a compatible S4-S5 linker and bottom part of S6, constrained by non-interacting residues
Bằng: Labro, A, et al.
Được phát hành: (2008)

Biophysical studies of membrane protein structure and function
Bằng: Dijkman, P, et al.
Được phát hành: (2014)

Radiation damage in protein crystals examined under various conditions by different methods
Bằng: Garman, E, et al.
Được phát hành: (2009)

Biophysical and magnetic resonance studies of membrane proteins
Bằng: Orwick, M, et al.
Được phát hành: (2011)

Determination of X-ray flux using silicon pin diodes
Bằng: Owen, R, et al.
Được phát hành: (2009)

Gαs slow conformational transition upon GTP binding and a novel Gαs regulator
Bằng: Donghoon Ahn, et al.
Được phát hành: (2023-05-01)

Mutational analysis of isoform selectivity and conformational equilibria in protein kinase inhibition
Bằng: Alexander, LT
Được phát hành: (2015)

Protocol for real-time imaging of membrane fission by mitofissin
Bằng: Tatsuro Maruyama, et al.
Được phát hành: (2023-12-01)

Probing GPCR-Gα interactions: a functional study by EM and SPR
Bằng: Adamson, RJ
Được phát hành: (2014)

Single-molecule visualization of fast polymerase turnover in the bacterial replisome
Bằng: Jacob S Lewis, et al.
Được phát hành: (2017-04-01)

Redox-dependent conformational switching of diphenylacetylenes
Bằng: Jones, I, et al.
Được phát hành: (2014)

The molecular basis for ER tubule formation
Bằng: Brady, J
Được phát hành: (2015)

A biophysical study of the G protein coupled receptor neurotensin receptor 1
Bằng: Harding, PJ
Được phát hành: (2007)

Control of the unidirectional motor in Rhodobacter sphaeroides
Bằng: Brown, MT
Được phát hành: (2009)

Structural characterisation of the interaction between Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1 (PfEMP1) and their human ligands in severe malaria
Bằng: Ng, HK
Được phát hành: (2012)

Structural, biochemical and computational studies of TRP channel transmembrane domain modularity
Bằng: Hanson, S
Được phát hành: (2014)

Molecular and structural characterisation of the human Fibrillin-1 N-C terminal interaction
Bằng: Yadin, D
Được phát hành: (2013)

Ion channels: structure of a molecular brake
Bằng: Sansom, M
Được phát hành: (1999)

The dielectric properties of water within model transbilayer pores
Bằng: Sansom, M, et al.
Được phát hành: (1997)

Protocol to reveal the binding partner of secreted housekeeping enzymes in Listeria monocytogenes via in silico prediction to in vivo validation
Bằng: Dongqi Liu, et al.
Được phát hành: (2024-03-01)

Protocol for analyzing DNA dynamics in the presence of crowders and confined within cell-sized droplets
Bằng: Mehdi Shafiei Aporvari, et al.
Được phát hành: (2024-09-01)

Studying marcomolecular transitions by NMR and computer simulations
Bằng: Stelzl, LS
Được phát hành: (2014)

Substrate recognition by the proteasome
Bằng: Boehringer, J
Được phát hành: (2011)

Structural studies on determinants of receptor/ligand binding in the tumour necrosis factor and T cell receptor protein families
Bằng: Marles-Wright, J
Được phát hành: (2005)

Structural studies of malaria proteins
Bằng: Mayer, C
Được phát hành: (2012)

Structural studies on determinants of receptor/ligand binding in the tumour necrosis factor and T cell receptor protein families
Bằng: Marles-Wright, J
Được phát hành: (2005)

Structural studies of cell adhesion and division
Bằng: Yates, LA
Được phát hành: (2012)

Single molecule studies of a voltage-gated potassium channel
Bằng: Angué, L
Được phát hành: (2013)

Optimising protein synthesis in cell‐free systems, a review
Bằng: Angelo C. Batista, et al.
Được phát hành: (2021-03-01)

Structure and dynamics of picornavirus capsids to inform vaccine design
Bằng: Kotecha, A
Được phát hành: (2014)