Ribosomal multilocus sequence typing: Universal characterization of bacteria from domain to strain

Ribosomal multilocus sequence typing: Universal characterization of bacteria from domain to strain

Show other versions (1)

No single genealogical reconstruction or typing method currently encompasses all levels of bacterial diversity, from domain to strain. We propose ribosomal multilocus sequence typing (rMLST), an approach which indexes variation of the 53 genes encoding the bacterial ribosome protein subunits (rps ge...

תיאור מלא

מידע ביבליוגרפי
Main Authors:	Jolley, K, Bliss, C, Bennett, J, Bratcher, H, Brehony, C, Colles, F, Wimalarathna, H, Harrison, O, Sheppard, S, Cody, A, Maiden, M
פורמט:	Journal article
יצא לאור:	Microbiology Society 2012

פריטים דומים

Ribosomal multilocus sequence typing: universal characterization of bacteria from domain to strain.
מאת: Jolley, K, et al.
יצא לאור: (2012)

Core genome multilocus sequence typing scheme for Bacillus cereus group bacteria
מאת: Tourasse, NJ, et al.
יצא לאור: (2023)

Species status of Neisseria gonorrhoeae: evolutionary and epidemiological inferences from multilocus sequence typing
מאת: Bennett, J, et al.
יצא לאור: (2007)

Population structure of the Yersinia pseudotuberculosis complex according to multilocus sequence typing.
מאת: Laukkanen-Ninios, R, et al.
יצא לאור: (2011)

Population structure of the Yersinia pseudotuberculosis complex according to multilocus sequence typing
מאת: Laukkanen-Ninios, R, et al.
יצא לאור: (2011)

Development of an unambiguous and discriminatory multilocus sequence typing scheme for the Streptococcus zooepidemicus group.
מאת: Webb, K, et al.
יצא לאור: (2008)

Multilocus sequence typing of Clostridium difficile.
מאת: Griffiths, D, et al.
יצא לאור: (2010)

Real-time genomic epidemiological evaluation of human Campylobacter isolates by use of whole-genome multilocus sequence typing.
מאת: Cody, A, et al.
יצא לאור: (2013)

The genus Neisseria
מאת: Bennett, J, et al.
יצא לאור: (2014)

The applied development of a tiered multilocus sequence typing (MLST) scheme for Dichelobacter nodosus
מאת: Blanchard, A, et al.
יצא לאור: (2018)

Attribution of Campylobacter infections in northeast Scotland to specific sources by use of multilocus sequence typing.
מאת: Strachan, N, et al.
יצא לאור: (2009)

Core-genome multilocus sequence typing for epidemiological and evolutionary analyses of phytopathogenicXanthomonas citri
מאת: Ragupathy, R, et al.
יצא לאור: (2023)

Identifying Neisseria species by use of the 50S ribosomal protein L6 (rplF) gene
מאת: Bennett, JS, et al.
יצא לאור: (2014)

Comparative analysis of the two Acinetobacter baumannii multilocus sequence typing (MLST) schemes
מאת: Gaiarsa, S, et al.
יצא לאור: (2019)

Multilocus sequence analysis of the pathogen Neisseria meningitidis
מאת: Wilson, D
יצא לאור: (2005)

Establishment of a publicly available core genome multilocus sequence typing scheme for Clostridium perfringens
מאת: Abdel-Glil, MY, et al.
יצא לאור: (2021)

Multilocus sequence typing system for group B streptococcus.
מאת: Jones, N, et al.
יצא לאור: (2003)

Defining a core genome multilocus sequence typing scheme for the global epidemiology of Vibrio parahaemolyticus
מאת: Gonzalez-Escalona, N, et al.
יצא לאור: (2017)

Novel multilocus sequence typing and global sequence clustering schemes for characterizing the population diversity of Streptococcus mitis
מאת: Kalizang’oma, A, et al.
יצא לאור: (2022)

Where does Campylobacter come from? A molecular odyssey
מאת: Cody, A, et al.
יצא לאור: (2009)

Inference of bacterial microevolution using multilocus sequence data.
מאת: Didelot, X, et al.
יצא לאור: (2007)

Core genome multilocus sequence typing scheme for improved characterization and epidemiological surveillance of pathogenic Brucella
מאת: Abdel-Glil, MY, et al.
יצא לאור: (2022)

Microbial genomic data analysis for infectious diseases
מאת: Varga, MJ, et al.
יצא לאור: (2019)

Local genes for local bacteria: Evidence of allopatry in the genomes of transatlantic Campylobacter populations
מאת: Pascoe, B, et al.
יצא לאור: (2017)

Resolution of a meningococcal disease outbreak from whole-genome sequence data with rapid Web-based analysis methods.
מאת: Jolley, K, et al.
יצא לאור: (2012)

Genetic variation analysis of Vibrio cholerae using multilocus sequencing typing and multi-virulence locus sequencing typing
מאת: Teh, C.S.J., et al.
יצא לאור: (2011)

Hash-based core genome multilocus sequencing typing for Clostridium difficile
מאת: Eyre, DW, et al.
יצא לאור: (2019)

Development of the Pneumococcal Genome Library, a core genome multilocus sequence typing scheme, and a taxonomic life identification number barcoding system to investigate and define pneumococcal population structure
מאת: Jansen van Rensburg, MJ, et al.
יצא לאור: (2023)

A longitudinal 6-year study of the molecular epidemiology of clinical campylobacter isolates in Oxfordshire, United kingdom.
מאת: Cody, A, et al.
יצא לאור: (2012)

Multilocus sequence typing for characterization of methicillin-resistant and methicillin-susceptible clones of Staphylococcus aureus.
מאת: Enright, M, et al.
יצא לאור: (2000)

Investigation of recurrent melioidosis in Lao People's Democratic Republic by multilocus sequence typing
מאת: Rachlin, A, et al.
יצא לאור: (2016)

Dataset of 16S ribosomal DNA sequences of bacteria isolated from marine red algae Kappapycus alvarezii
מאת: Rennielyn Rupert, et al.
יצא לאור: (2022)

A single multilocus sequence typing (MLST) scheme for seven pathogenic Leptospira species
מאת: Boonsilp, S, et al.
יצא לאור: (2013)

Resolution of a protracted serogroup B meningococcal outbreak with whole genome sequencing shows inter species genetic transfer.
מאת: Mulhall, R, et al.
יצא לאור: (2016)

Evolutionary and genomic insights into meningococcal biology
מאת: Bratcher, H, et al.
יצא לאור: (2012)

Multilocus sequence typing directly on DNA from clinical samples and a cultured isolate to investigate linked fatal pneumococcal disease in residents of a shelter for homeless men.
מאת: Birtles, A, et al.
יצא לאור: (2005)

A gene-by-gene population genomics platform: de novo assembly, annotation and genealogical analysis of 108 representative Neisseria meningitidis genomes.
מאת: Bratcher, H, et al.
יצא לאור: (2014)

Mass spectrometry of ribosomes and ribosomal subunits.
מאת: Benjamin, DR, et al.
יצא לאור: (1998)

Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea: Sequencing a Myriad of Type Strains
מאת: DeLong, Edward
יצא לאור: (2014)

Multilocus sequence typing of Cryptococcus neoformans var. grubii from Laos in a regional and global context
מאת: Thanh, LT, et al.
יצא לאור: (2018)