Joint genotype calling with array and sequence data.

Joint genotype calling with array and sequence data.

Toon andere (1) versies

Analysis of rare variants is currently a major focus of genetic studies of human disease. Single-nucleotide polymorphism (SNP) genotypes can be assayed using microarray genotyping or by sequencing, but neither technology produces perfect genotype calls, especially at rare SNPs. Studies that collect...

Volledige beschrijving

Bibliografische gegevens
Hoofdauteurs:	O'Connell, J, Marchini, J
Formaat:	Journal article
Taal:	English
Gepubliceerd in:	2012

Gelijkaardige items

Joint Genotype Calling With Array and Sequence Data
door: O'Connell, J, et al.
Gepubliceerd in: (2012)

Genotype calling and phasing using next-generation sequencing reads and a haplotype scaffold.
door: Menelaou, A, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

Statistical methods for genotype microarray data on large cohorts of individuals
door: O'Connell, JM
Gepubliceerd in: (2014)

A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.
door: Teo, Y, et al.
Gepubliceerd in: (2007)

A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.
door: Teo, Y, et al.
Gepubliceerd in: (2007)

Integrating sequence and array data to create an improved 1000 Genomes Project haplotype reference panel.
door: Delaneau, O, et al.
Gepubliceerd in: (2014)

Genotype Imputation
door: Marchini, J
Gepubliceerd in: (2011)

LD-based SNP and genotype calling from next-generation sequencing reads.
door: Menelaou, A
Gepubliceerd in: (2012)

Joint base-calling of Two DNA Sequences with Factor Graphs
door: Shi, Xiaomeng, et al.
Gepubliceerd in: (2011)

Joint base-calling of two DNA sequences with factor graphs
door: Shi, Xiaomeng, Ph. D. Massachusetts Institute of Technology
Gepubliceerd in: (2009)

BeadArray-based genotyping.
door: Butler, H, et al.
Gepubliceerd in: (2008)

Comparing algorithms for genotype imputation.
door: Marchini, J, et al.
Gepubliceerd in: (2008)

Genotype imputation with thousands of genomes.
door: Howie, B, et al.
Gepubliceerd in: (2011)

Genotype imputation for genome-wide association studies.
door: Marchini, J, et al.
Gepubliceerd in: (2010)

CNV discovery using SNP genotyping arrays.
door: Yau, C, et al.
Gepubliceerd in: (2008)

Sequence covering arrays
door: Colbourn, Charles J., et al.
Gepubliceerd in: (2014)

Haplotype estimation for biobank-scale data sets
door: O'Connell, J, et al.
Gepubliceerd in: (2016)

Genotyping, sequencing and analysis of 140,000 adults from Mexico City
door: Ziyatdinov, A, et al.
Gepubliceerd in: (2023)

THE LIMITATIONS OF VARIANT CALLING ALGORITHMS FOR CLASSICAL HLA GENES FROM WHOLE GENOME SEQUENCE DATA
door: Cox, C, et al.
Gepubliceerd in: (2012)

Senate Roll Call Data
door: Stewart, Charles
Gepubliceerd in: (2005)

House Roll Call Data
door: Stewart, Charles
Gepubliceerd in: (2005)

Rapid genotype imputation from sequence without reference panels
door: Myers, S, et al.
Gepubliceerd in: (2016)

A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies.
door: Howie, B, et al.
Gepubliceerd in: (2009)

A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies
door: Howie, B, et al.
Gepubliceerd in: (2009)

Seasonal childhood anaemia in West Africa is associated with the haptoglobin 2-2 genotype
door: Atkinson, S, et al.
Gepubliceerd in: (2006)

Analysis of genomic-length HBV sequences to determine genotype and subgenotype reference sequences
door: McNaughton, A, et al.
Gepubliceerd in: (2020)

Real sequencing datasets for evaluating bacterial SNP calling pipelines
door: Bush, S
Gepubliceerd in: (2019)

Rapid genotype imputation from sequence with reference panels
door: Davies, RW, et al.
Gepubliceerd in: (2021)

Choice and change : an introduction to the psychology of growth/
door: O'Connell, Vincent, et al.
Gepubliceerd in: (1974)

Choice and change : the psychology of personal growth and interpersonal relationships /
door: O'Connell, April, et al.
Gepubliceerd in: (2001)

Robust and Data-Driven Approaches to Call Centers
door: Bertsimas, Dimitris J., et al.
Gepubliceerd in: (2012)

CALL in use : use of CALL : evaluating CALL software /
door: 374203 Legenhausen, Lienhard, et al.

Targeting 160 candidate genes for blood pressure regulation with a genome-wide genotyping array.
door: Sober, S, et al.
Gepubliceerd in: (2009)

A two sample size estimator for large data sets
door: O'Connell, M, et al.
Gepubliceerd in: (2025)

A two sample size estimator for large data sets
door: O’Connell, M, et al.
Gepubliceerd in: (2023)

Haplotype estimation using sequencing reads.
door: Delaneau, O, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

A new multipoint method for genome-wide association studies by imputation of genotypes.
door: Marchini, J, et al.
Gepubliceerd in: (2007)

Designing genome-wide association studies: sample size, power, imputation, and the choice of genotyping chip.
door: Spencer, C, et al.
Gepubliceerd in: (2009)

Aid and fiscal instability
door: O'Connell, S
Gepubliceerd in: (2008)

ARIBA: rapid antimicrobial resistance genotyping directly from sequencing reads
door: Hunt, M, et al.
Gepubliceerd in: (2017)