Kepelbagaian molekul beberapa varieti padi yang mempunyai reaksi berbeza terhadap penyakit karah

Penanda Random amplified polymorphic DNA (RAPD) telah digunakan dalam penandaan gen yang berpotensi rintang terhadap penyakit karah pada padi. Objektif kajian adalah untuk mengkaji kepelbagaian genetik beberapa varieti padi tempatan Sabah menggunakan penanda RAPD dan mengenalpasti penanda RAPD ya...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Noor Hydayaty Md Yusuf
Format: Academic Exercise
Language:English
Published: 2008
Subjects:
Online Access:https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/20169/1/Kepelbagaian%20molekul%20beberapa%20varieti%20padi%20.pdf
Description
Summary:Penanda Random amplified polymorphic DNA (RAPD) telah digunakan dalam penandaan gen yang berpotensi rintang terhadap penyakit karah pada padi. Objektif kajian adalah untuk mengkaji kepelbagaian genetik beberapa varieti padi tempatan Sabah menggunakan penanda RAPD dan mengenalpasti penanda RAPD yang berpotensi terangkai dengan gen yang rintang kepada penyakit karah padi yang terdapat pada varieti padi tempatan di Sabah. Sembilan penanda RAPD iaitu OPA5, OPF6, OPF9, OPF17, OPF19, OPGI8, OPB7, OPK9 dan OPH19 menunjukkan polimorfisma yang jelas pada varieti tempatan yang rintang dan tidak rintang. Sebanyak 70 jalur dihasilkan dan 63 adalah polimorfik. Padi traditional mempunyai kadar kepelbagaian terhadap kerintangan kepada penyakit karah yang tinggi dengan memberikan 90 % kadar polimorfisma. Setiap primer menghasilkan 3 hingga 13 jalur dengan saiz molekul 290 bp hingga 1300 bp. Frekuensi jalur tertinggi adalah 83.33 % dan frekuensi terendah adalah 16.67 %. Indeks jarak genetik antara populasi rintang dan tidak rintang adalah 0.2645 manakala indeks kesamaan genetik adalah 0.7676. Dendogram UPGMA telah membahagikan enam varieti padi kepada dua kelompok utama mengikut reaksi ke atas penyakit karah. Kelompok pertama terdiri daripada kesemua varieti tidak rintang kepada penyakit karah iaitu Batangan, Azucena, Bataris, dan Tadong serta satu verieti rintang Batikan. Kelompok kedua terdiri daripada satu varieti rintang iaitu Ambas. Penanda OPG 18 bersaiz 850 bp hanya dijumpai pada varieti rintang dan berpotensi sebagai penanda bagi membezakan varieti rintang dan tidak rintang.