Filtered Distance Matrix For Constructing High-Throughput Multiple Sequence Alignment On Protein Data

Urutan Penjajaran Berganda (MSA) adalah satu proses yang penting dalam biologi pengkomputeran dan bioinformatik. MSA optima adalah masalah NP-keras sementara membina penjajaran optimum menggunakan pengaturcaraan dinamik merupakan masalah NP lengkap. Multiple sequence alignment (MSA) is a signi...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Mohammad Abu-Hashem, Muhannad Abdul-Qader
Format: Thesis
Language:English
Published: 2015
Subjects:
Online Access:http://eprints.usm.my/30172/1/Muhannad.pdf
Description
Summary:Urutan Penjajaran Berganda (MSA) adalah satu proses yang penting dalam biologi pengkomputeran dan bioinformatik. MSA optima adalah masalah NP-keras sementara membina penjajaran optimum menggunakan pengaturcaraan dinamik merupakan masalah NP lengkap. Multiple sequence alignment (MSA) is a significant process in computational biology and bioinformatics. Optimal MSA is an NP-hard problem, while building optimal alignment using dynamic programming is an NP complete problem. Although numerous algorithms have been proposed for MSA, producing an efficient MSA with high accuracy remains a huge challenge.