Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
Kitin merupakan polisakarida struktur yang dapat dicurai oleh enzim kitinolisis kepada pelbagai terbitan yang boleh digunakan dalam bidang perubatan, pertanian dan rawatan air. Pengenalpastian dan pencirian gen-gen Trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea tela...
| Main Authors: | , , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Published: |
2013
|
| Subjects: |
| _version_ | 1796857976063000576 |
|---|---|
| author | Abdul Murad, Abdul Munir Badrun, Rafidah Shahabudin, Sakina Kamaruddin, Shazilah Ahmad Zairun, Madihah Khairuddin, Farahayu Mahadi, Nor Muhammad Md. Illias, Rosli Zainal, Zamri Abu, Farah Diba |
| author_facet | Abdul Murad, Abdul Munir Badrun, Rafidah Shahabudin, Sakina Kamaruddin, Shazilah Ahmad Zairun, Madihah Khairuddin, Farahayu Mahadi, Nor Muhammad Md. Illias, Rosli Zainal, Zamri Abu, Farah Diba |
| author_sort | Abdul Murad, Abdul Munir |
| collection | ePrints |
| description | Kitin merupakan polisakarida struktur yang dapat dicurai oleh enzim kitinolisis kepada pelbagai terbitan yang boleh digunakan dalam bidang perubatan, pertanian dan rawatan air. Pengenalpastian dan pencirian gen-gen Trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) dan analisis pengekspresan gen menggunakan mikroatur DNA. Sebanyak tiga perpustakaan cDNA T. virens UKM1 yang masing-masing diaruh oleh kitin, glukosamina dan kitosan telah dibina. Sejumlah 1536 klon cDNA telah dijujuk dan sebanyak 1033 ESTs berkualiti telah dijana. Seterusnya, perbezaan pengekspresan gen apabila pertumbuhan kulat diaruh dengan kehadiran kitin krustasea dan tanpa kitin pada hari ketiga dan kelima telah ditentukan. Sebanyak 1824 klon cDNA telah dititik ke atas slaid kaca dan dihibrid bersama dengan cDNA terlabel Cy3 atau Cy5 yang disintesis daripada mRNA yang dipencil daripada kulat yang ditumbuhkan dalam medium mengandungi kitin krustasea atau glukosa (kawalan). Sebanyak 91 dan 61 gen, masing-masing bagi hari ketiga dan kelima didapati terekspres melebihi dua gandaan apabila kulat menggunakan kitin krustasea sebagai sumber karbon. Beberapa gen mengekod kitinase seperti ech1 dan cht3 (endokitinase), nag1 (eksokitinase) dan nagB (glukosamina 6-P-deaminase) didapati terekspres dengan tinggi pada kedua-dua hari. Selain daripada itu, gen mengekod protein hidrofobin, protease serina dan beberapa protein hipotetik juga terekspres dengan tinggi dengan kehadiran kitin krustasea. Protein-protein ini dijangka memainkan peranan penting dalam membantu pencuraian kitin krustasea. |
| first_indexed | 2024-03-05T19:05:49Z |
| format | Article |
| id | utm.eprints-40977 |
| institution | Universiti Teknologi Malaysia - ePrints |
| last_indexed | 2024-03-05T19:05:49Z |
| publishDate | 2013 |
| record_format | dspace |
| spelling | utm.eprints-409772017-08-23T06:37:28Z http://eprints.utm.my/40977/ Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea Abdul Murad, Abdul Munir Badrun, Rafidah Shahabudin, Sakina Kamaruddin, Shazilah Ahmad Zairun, Madihah Khairuddin, Farahayu Mahadi, Nor Muhammad Md. Illias, Rosli Zainal, Zamri Abu, Farah Diba QD Chemistry Kitin merupakan polisakarida struktur yang dapat dicurai oleh enzim kitinolisis kepada pelbagai terbitan yang boleh digunakan dalam bidang perubatan, pertanian dan rawatan air. Pengenalpastian dan pencirian gen-gen Trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) dan analisis pengekspresan gen menggunakan mikroatur DNA. Sebanyak tiga perpustakaan cDNA T. virens UKM1 yang masing-masing diaruh oleh kitin, glukosamina dan kitosan telah dibina. Sejumlah 1536 klon cDNA telah dijujuk dan sebanyak 1033 ESTs berkualiti telah dijana. Seterusnya, perbezaan pengekspresan gen apabila pertumbuhan kulat diaruh dengan kehadiran kitin krustasea dan tanpa kitin pada hari ketiga dan kelima telah ditentukan. Sebanyak 1824 klon cDNA telah dititik ke atas slaid kaca dan dihibrid bersama dengan cDNA terlabel Cy3 atau Cy5 yang disintesis daripada mRNA yang dipencil daripada kulat yang ditumbuhkan dalam medium mengandungi kitin krustasea atau glukosa (kawalan). Sebanyak 91 dan 61 gen, masing-masing bagi hari ketiga dan kelima didapati terekspres melebihi dua gandaan apabila kulat menggunakan kitin krustasea sebagai sumber karbon. Beberapa gen mengekod kitinase seperti ech1 dan cht3 (endokitinase), nag1 (eksokitinase) dan nagB (glukosamina 6-P-deaminase) didapati terekspres dengan tinggi pada kedua-dua hari. Selain daripada itu, gen mengekod protein hidrofobin, protease serina dan beberapa protein hipotetik juga terekspres dengan tinggi dengan kehadiran kitin krustasea. Protein-protein ini dijangka memainkan peranan penting dalam membantu pencuraian kitin krustasea. 2013 Article PeerReviewed Abdul Murad, Abdul Munir and Badrun, Rafidah and Shahabudin, Sakina and Kamaruddin, Shazilah and Ahmad Zairun, Madihah and Khairuddin, Farahayu and Mahadi, Nor Muhammad and Md. Illias, Rosli and Zainal, Zamri and Abu, Farah Diba (2013) Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea. Sains Malaysiana, 42 (6). pp. 715-724. ISSN 0126-6039 |
| spellingShingle | QD Chemistry Abdul Murad, Abdul Munir Badrun, Rafidah Shahabudin, Sakina Kamaruddin, Shazilah Ahmad Zairun, Madihah Khairuddin, Farahayu Mahadi, Nor Muhammad Md. Illias, Rosli Zainal, Zamri Abu, Farah Diba Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| title | Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| title_full | Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| title_fullStr | Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| title_full_unstemmed | Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| title_short | Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| title_sort | pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens ukm1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea |
| topic | QD Chemistry |
| work_keys_str_mv | AT abdulmuradabdulmunir pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT badrunrafidah pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT shahabudinsakina pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT kamaruddinshazilah pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT ahmadzairunmadihah pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT khairuddinfarahayu pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT mahadinormuhammad pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT mdilliasrosli pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT zainalzamri pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea AT abufarahdiba pengenalpastiandanpenciriangentrichodermavirensukm1mengekodenzimterlibatdalampencuraiankitinkrustasea |