Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima
Genetska testiranja kod pacijenata s neurorazvojnim poremećajima vrlo su važna za postavljanje konačne dijagnoze. Prema trenutnim smjernicama prve metode izbora uključuju komparativnu genomsku hibridizaciju na mikropostroju te genetsko testiranje fragilnog X sindroma. Cjeloeksomsko sekvenciranje koj...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Hrvatski liječnički zbor
2023-01-01
|
| Series: | Liječnički vjesnik |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://hrcak.srce.hr/file/434062 |
| _version_ | 1797206492349202432 |
|---|---|
| author | Feodora Stipoljev Maja Oroz Ana Vičić |
| author_facet | Feodora Stipoljev Maja Oroz Ana Vičić |
| author_sort | Feodora Stipoljev |
| collection | DOAJ |
| description | Genetska testiranja kod pacijenata s neurorazvojnim poremećajima vrlo su važna za postavljanje konačne dijagnoze. Prema trenutnim smjernicama prve metode izbora uključuju komparativnu genomsku hibridizaciju na mikropostroju te genetsko testiranje fragilnog X sindroma. Cjeloeksomsko sekvenciranje koje omogućuje detekciju jednonukleotidnih varijanti u kodirajućim regijama gena predstavlja sljedeći dijagnostički korak. Dijagnostički prinos komparativne genomske hibridizacije na mikropostroju raste do 15%, a cjeloeksomskog
sekvenciranja čak do 40%. Međutim, kod velikog broja pacijenata (čak do 50%) etiologija neurorazvojnih poremećaja ostaje nerazjašnjena. Danas su poznati mnogi genetski mehanizmi koje nije moguće ustanoviti rutinskim dijagnostičkim metodama, a uključuju varijante broja kopija u nekodirajućim regulacijskim DNA regijama, varijante broja kopija koje utječu na strukturu i funkciju topoloških domena, duboke intronske varijante u kodirajućim genima kao i metilacijske obrasce u genomu. Navedene genske promjene moguće je detektirati novijim tehnologijama kao što je cjelogenomsko sekvenciranje i mapiranje topoloških domena (Hi-C sekvenciranje). Cjelogenomskim sekvenciranjem moguće je odrediti i precizne točke loma u naoko balansiranim kromosomskim razmještanjima.
Uvođenje cjelogenomskog sekvenciranja u rutinsku dijagnostiku genetskih bolesti svakako bi povećalo dijagnostički prinos i omogućilo postavljanje dijagnoze za velik broj pacijenata s neurorazvojnim poremećajima. S napredovanjem tehnologije i sve većom dostupnošću cjelogenomskog sekvenciranja, u skoroj budućnosti se očekuje i povećanje genomskih baza koje bi omogućile interpretaciju velike količine podataka koju ova metoda generira, čime bi se ubrzalo uvođenje ove moćne metode u rutinsku medicinsku skrb kod pacijenata s genetskim poremećajima. |
| first_indexed | 2024-04-24T09:07:53Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-0f09f97f8cb34eff98d10239c3721a68 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0024-3477 1849-2177 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-24T09:07:53Z |
| publishDate | 2023-01-01 |
| publisher | Hrvatski liječnički zbor |
| record_format | Article |
| series | Liječnički vjesnik |
| spelling | doaj.art-0f09f97f8cb34eff98d10239c3721a682024-04-15T18:28:20ZengHrvatski liječnički zborLiječnički vjesnik0024-34771849-21772023-01-01145Supp 125626310.26800/LV-145-supl1-36Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajimaFeodora Stipoljev0Maja OrozAna VičićOdjel za laboratorijsku citogenetiku, Klinika za ginekologiju i porodništvo, Klinička bolnica “Sveti Duh”, ZagrebGenetska testiranja kod pacijenata s neurorazvojnim poremećajima vrlo su važna za postavljanje konačne dijagnoze. Prema trenutnim smjernicama prve metode izbora uključuju komparativnu genomsku hibridizaciju na mikropostroju te genetsko testiranje fragilnog X sindroma. Cjeloeksomsko sekvenciranje koje omogućuje detekciju jednonukleotidnih varijanti u kodirajućim regijama gena predstavlja sljedeći dijagnostički korak. Dijagnostički prinos komparativne genomske hibridizacije na mikropostroju raste do 15%, a cjeloeksomskog sekvenciranja čak do 40%. Međutim, kod velikog broja pacijenata (čak do 50%) etiologija neurorazvojnih poremećaja ostaje nerazjašnjena. Danas su poznati mnogi genetski mehanizmi koje nije moguće ustanoviti rutinskim dijagnostičkim metodama, a uključuju varijante broja kopija u nekodirajućim regulacijskim DNA regijama, varijante broja kopija koje utječu na strukturu i funkciju topoloških domena, duboke intronske varijante u kodirajućim genima kao i metilacijske obrasce u genomu. Navedene genske promjene moguće je detektirati novijim tehnologijama kao što je cjelogenomsko sekvenciranje i mapiranje topoloških domena (Hi-C sekvenciranje). Cjelogenomskim sekvenciranjem moguće je odrediti i precizne točke loma u naoko balansiranim kromosomskim razmještanjima. Uvođenje cjelogenomskog sekvenciranja u rutinsku dijagnostiku genetskih bolesti svakako bi povećalo dijagnostički prinos i omogućilo postavljanje dijagnoze za velik broj pacijenata s neurorazvojnim poremećajima. S napredovanjem tehnologije i sve većom dostupnošću cjelogenomskog sekvenciranja, u skoroj budućnosti se očekuje i povećanje genomskih baza koje bi omogućile interpretaciju velike količine podataka koju ova metoda generira, čime bi se ubrzalo uvođenje ove moćne metode u rutinsku medicinsku skrb kod pacijenata s genetskim poremećajima.https://hrcak.srce.hr/file/434062NEURORAZVOJNI POREMEĆAJIACGHCJELOEKSOMSKO SEKVENCIRANJECJELOGENOMSKO SEKVENCIRANJE |
| spellingShingle | Feodora Stipoljev Maja Oroz Ana Vičić Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima Liječnički vjesnik NEURORAZVOJNI POREMEĆAJI ACGH CJELOEKSOMSKO SEKVENCIRANJE CJELOGENOMSKO SEKVENCIRANJE |
| title | Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima |
| title_full | Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima |
| title_fullStr | Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima |
| title_full_unstemmed | Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima |
| title_short | Genomski dijagnostički algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremećajima |
| title_sort | genomski dijagnosticki algoritmi u obiteljima s djecom s neurorazvojnim poremecajima |
| topic | NEURORAZVOJNI POREMEĆAJI ACGH CJELOEKSOMSKO SEKVENCIRANJE CJELOGENOMSKO SEKVENCIRANJE |
| url | https://hrcak.srce.hr/file/434062 |
| work_keys_str_mv | AT feodorastipoljev genomskidijagnostickialgoritmiuobiteljimasdjecomsneurorazvojnimporemecajima AT majaoroz genomskidijagnostickialgoritmiuobiteljimasdjecomsneurorazvojnimporemecajima AT anavicic genomskidijagnostickialgoritmiuobiteljimasdjecomsneurorazvojnimporemecajima |