Changes in dynamics upon oligomerization regulate substrate binding and allostery in amino acid kinase family members.

Changes in dynamics upon oligomerization regulate substrate binding and allostery in amino acid kinase family members.

Oligomerization is a functional requirement for many proteins. The interfacial interactions and the overall packing geometry of the individual monomers are viewed as important determinants of the thermodynamic stability and allosteric regulation of oligomers. The present study focuses on the role of...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Enrique Marcos, Ramon Crehuet, Ivet Bahar
Định dạng:	Bài viết
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	Public Library of Science (PLoS) 2011-09-01
Loạt:	PLoS Computational Biology
Truy cập trực tuyến:	http://europepmc.org/articles/PMC3182869?pdf=render

Những quyển sách tương tự

On the conservation of the slow conformational dynamics within the amino acid kinase family: NAGK the paradigm.
Bằng: Enrique Marcos, et al.
Được phát hành: (2010-04-01)

Dynamic allostery in substrate binding by human thymidylate synthase
Bằng: Jeffrey P Bonin, et al.
Được phát hành: (2022-10-01)

Allostery of atypical modulators at oligomeric G protein-coupled receptors
Bằng: Rabindra V. Shivnaraine, et al.
Được phát hành: (2021-04-01)

Dynamic Allostery Mediated by a Conserved Tryptophan in the Tec Family Kinases.
Bằng: Nikita Chopra, et al.
Được phát hành: (2016-03-01)

Phosphorylation is switch of L-type pyruvate kinase allostery
Bằng: Faustova Ilona, et al.
Được phát hành: (2010-04-01)

ATPase subdomain IA is a mediator of interdomain allostery in Hsp70 molecular chaperones.
Bằng: Ignacio J General, et al.
Được phát hành: (2014-05-01)

Computational modeling of cAMP-dependent protein kinase allostery
Bằng: Andrei Izvolski, et al.
Được phát hành: (2023-11-01)

Genetic Mutations in the S-loop of Human Glutathione Synthetase: Links Between Substrate Binding, Active Site Structure and Allostery
Bằng: Brandall L. Ingle, et al.
Được phát hành: (2019-01-01)

Editorial: Understanding Protein Dynamics, Binding and Allostery for Drug Design
Bằng: Guang Hu, et al.
Được phát hành: (2021-04-01)

Kinase Domain Is a Dynamic Hub for Driving LRRK2 Allostery
Bằng: Susan S. Taylor, et al.
Được phát hành: (2020-10-01)

Wandering about allostery
Bằng: Maurizio Brunori
Được phát hành: (2024-08-01)

Decoding the mechanisms of allostery
Bằng: Saif Khan, et al.
Được phát hành: (2023-06-01)

Modeling Spatial Correlation of DNA Deformation: DNA Allostery in Protein Binding
Bằng: Xu, Xinliang, et al.
Được phát hành: (2014)

High-resolution structure of the amino acid transporter AdiC reveals insights into the role of water molecules and networks in oligomerization and substrate binding
Bằng: Hüseyin Ilgü, et al.
Được phát hành: (2021-08-01)

Allostery can convert binding free energies into concerted domain motions in enzymes
Bằng: Nicole Stéphanie Galenkamp, et al.
Được phát hành: (2024-11-01)

Ligand structure controlled allostery in cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit
Bằng: Kuznetsov Aleksei, et al.
Được phát hành: (2009-06-01)

Is allostery a fuzzy concept?
Bằng: Veronica Morea, et al.
Được phát hành: (2024-07-01)

Convergent allostery in ribonucleotide reductase
Bằng: William C. Thomas, et al.
Được phát hành: (2019-06-01)

The role of the N domain in substrate binding, oligomerization, and allosteric regulation of the AAA+ Lon protease
Bằng: Wohlever, Matthew L
Được phát hành: (2013)

Hsp70 oligomerization is mediated by an interaction between the interdomain linker and the substrate-binding domain
Bằng: Aprile, F, et al.
Được phát hành: (2013)

Hsp70 oligomerization is mediated by an interaction between the interdomain linker and the substrate-binding domain.
Bằng: Francesco A Aprile, et al.
Được phát hành: (2013-01-01)

Deconstructing allostery by computational assessment of the binding determinants of allosteric PTP1B modulators
Bằng: Adele Hardie, et al.
Được phát hành: (2023-06-01)

GMP Synthetase: Allostery, Structure, and Function
Bằng: Lionel Ballut, et al.
Được phát hành: (2023-09-01)

Dynamic allostery in thrombin—a review
Bằng: Elizabeth A. Komives
Được phát hành: (2023-06-01)

NMR Methods to Study Dynamic Allostery.
Bằng: Sarina Grutsch, et al.
Được phát hành: (2016-03-01)

Ack1: activation and regulation by allostery.
Bằng: Ketan S Gajiwala, et al.
Được phát hành: (2013-01-01)

Possible mechanism and clinical potentials of allostery
Bằng: Peixin Huang, et al.
Được phát hành: (2014-12-01)

Structures of S. aureus thymidylate kinase reveal an atypical active site configuration and an intermediate conformational state upon substrate binding.
Bằng: Kotaka, M, et al.
Được phát hành: (2006)

Author Correction: Allostery can convert binding free energies into concerted domain motions in enzymes
Bằng: Nicole Stéphanie Galenkamp, et al.
Được phát hành: (2025-01-01)

Structure based biophysical characterization of the PROPPIN Atg18 shows Atg18 oligomerization upon membrane binding
Bằng: Scacioc, A, et al.
Được phát hành: (2018)

Designing allostery-inspired response in mechanical networks
Bằng: Rocks, Jason W., et al.
Được phát hành: (2017)

Investigating potential allostery in the transcription factor CREB
Bằng: Chung, NL
Được phát hành: (2020)

HIV-1 Envelope Conformation, Allostery, and Dynamics
Bằng: Ashley Lauren Bennett, et al.
Được phát hành: (2021-05-01)

Allostery and Epistasis: Emergent Properties of Anisotropic Networks
Bằng: Paul Campitelli, et al.
Được phát hành: (2020-06-01)

Structural Basis for Allostery in PLP-dependent Enzymes
Bằng: Jenny U. Tran, et al.
Được phát hành: (2022-04-01)

Insights into the molecular mechanism of allostery in Hsp70s
Bằng: Matthias Peter Mayer, et al.
Được phát hành: (2015-10-01)

A unified view of "how allostery works".
Bằng: Chung-Jung Tsai, et al.
Được phát hành: (2014-02-01)

Allostery through DNA drives phenotype switching
Bằng: Gabriel Rosenblum, et al.
Được phát hành: (2021-05-01)

Force-dependent allostery of the α-catenin actin-binding domain controls adherens junction dynamics and functions
Bằng: Noboru Ishiyama, et al.
Được phát hành: (2018-11-01)

Receptor oligomerization in family B1 of G-protein-coupled receptors: Focus on BRET investigations and the link between GPCR oligomerization and binding cooperativity
Bằng: Sarah Norklit Roed, et al.
Được phát hành: (2012-05-01)