k-mer Similarity, Networks of Microbial Genomes, and Taxonomic Rank

ABSTRACT Microbial genomes have been shaped by parent-to-offspring (vertical) descent and lateral genetic transfer. These processes can be distinguished by alignment-based inference and comparison of phylogenetic trees for individual gene families, but this approach is not scalable to whole-genome s...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính: Guillaume Bernard, Paul Greenfield, Mark A. Ragan, Cheong Xin Chan
Định dạng: Bài viết
Ngôn ngữ:English
Được phát hành: American Society for Microbiology 2018-10-01
Loạt:mSystems
Những chủ đề:
Truy cập trực tuyến:https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.00257-18