Be positive: customized reference databases and new, local barcodes balance false taxonomic assignments in metabarcoding studies
Background In metabarcoding analyses, the taxonomic assignment is crucial to place sequencing data in biological and ecological contexts. This fundamental step depends on a reference database, which should have a good taxonomic coverage to avoid unassigned sequences. However, this goal is rarely ach...
প্রধান লেখক: | Francesco Mugnai, Federica Costantini, Anne Chenuil, Michèle Leduc, José Miguel Gutiérrez Ortega, Emese Meglécz |
---|---|
বিন্যাস: | প্রবন্ধ |
ভাষা: | English |
প্রকাশিত: |
PeerJ Inc.
2023-01-01
|
মালা: | PeerJ |
বিষয়গুলি: | |
অনলাইন ব্যবহার করুন: | https://peerj.com/articles/14616.pdf |
অনুরূপ উপাদানগুলি
অনুরূপ উপাদানগুলি
-
How reliable is metabarcoding for pollen identification? An evaluation of different taxonomic assignment strategies by cross-validation
অনুযায়ী: Gilles San Martin, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-01-01) -
To denoise or to cluster, that is not the question: optimizing pipelines for COI metabarcoding and metaphylogeography
অনুযায়ী: Adrià Antich, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-04-01) -
An improved statistical model for taxonomic assignment of metagenomics
অনুযায়ী: Yujing Yao, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018-10-01) -
Comparison of morphological, DNA barcoding, and metabarcoding characterizations of freshwater nematode communities
অনুযায়ী: Janina Schenk, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-03-01) -
Tackling critical parameters in metazoan meta-barcoding experiments: a preliminary study based on coxI DNA barcode
অনুযায়ী: Bachir Balech, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018-06-01)