An efficient algorithm for statistical multiple alignment on arbitrary phylogenetic trees.
We present an efficient algorithm for statistical multiple alignment based on the TKF91 model of Thorne, Kishino, and Felsenstein (1991) on an arbitrary k-leaved phylogenetic tree. The existing algorithms use a hidden Markov model approach, which requires at least O( radical 5(k)) states and leads t...
Հիմնական հեղինակներ: | Lunter, G, Miklós, I, Song, Y, Hein, J |
---|---|
Ձևաչափ: | Journal article |
Լեզու: | English |
Հրապարակվել է: |
2003
|
Նմանատիպ նյութեր
-
Phylogenetic automata, pruning, and multiple alignment
: Westesson, O, և այլն
Հրապարակվել է: (2011) -
Bayesian phylogenetic inference under a statistical insertion-deletion model
: Lunter, G, և այլն
Հրապարակվել է: (2003) -
Polynomial algorithms for the Maximal Pairing Problem: efficient phylogenetic targeting on arbitrary trees
: Stadler Peter F, և այլն
Հրապարակվել է: (2010-06-01) -
An algorithm for statistical alignment of sequences related by a binary tree.
: Hein, J
Հրապարակվել է: (2001) -
Genome-wide functional element detection using pairwise statistical alignment outperforms multiple genome footprinting techniques.
: Satija, R, և այլն
Հրապարակվել է: (2010)