LD-based SNP and genotype calling from next-generation sequencing reads.

LD-based SNP and genotype calling from next-generation sequencing reads.

<p>Next-generation sequencing is revolutionising in genetics, where base-by base information for the whole genome is available for a large sample of individuals. This type of data is becoming commonly used and will continue to be in the near future. One of the first questions arising is the id...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Tác giả chính:	Menelaou, A
Tác giả khác:	Marchini, J
Định dạng:	Luận văn
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2012
Những chủ đề:	Mathematical genetics and bioinformatics (statistics)

Những quyển sách tương tự

HLA*IMP - an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes
Bằng: Dilthey, A, et al.
Được phát hành: (2011)

Statistical methods for genotype microarray data on large cohorts of individuals
Bằng: O'Connell, JM
Được phát hành: (2014)

Genotype calling and phasing using next-generation sequencing reads and a haplotype scaffold.
Bằng: Menelaou, A, et al.
Được phát hành: (2013)

Genetic and genomic analysis of Arabidopsis thaliana with low-coverage next-generation sequencing data
Bằng: Imprialou, M
Được phát hành: (2015)

Inferring the fine-scale structure and evolution of recombination from high-throughput genome sequencing
Bằng: Venn, O
Được phát hành: (2013)

Statistical challenges in the detection of mutation and variation using high throughput sequencing
Bằng: Pfeifer, S
Được phát hành: (2012)

Bayesian and frequentist methods and analyses of genome-wide association studies
Bằng: Vukcevic, D
Được phát hành: (2009)

Statistical methods for mapping complex traits
Bằng: Allchin, L
Được phát hành: (2014)

Statistical methods for the analysis of genetic association studies
Bằng: Su, Z
Được phát hành: (2008)

Bayesian methods for fine mapping in genetic association studies
Bằng: Frangou, E
Được phát hành: (2013)

Probabilistic models of RNA secondary structure
Bằng: Anderson, JWJ
Được phát hành: (2013)

The detection, structure and uses of extended haplotype identity in population genetic data
Bằng: Xifara, DK
Được phát hành: (2014)

Genome annotation and selectional analysis of viral evolution
Bằng: de Groot, S
Được phát hành: (2008)

Comparative analysis of derived mutations across human populations.
Bằng: Feder, A, et al.
Được phát hành: (2013)

NucleoFinder: a statistical approach for the detection of nucleosome positions
Bằng: Becker, J, et al.
Được phát hành: (2013)

Genotype imputation methods for next generation datasets
Bằng: Rubinacci, S
Được phát hành: (2020)

Next generation sequencing in disease-relevant tissues
Bằng: Clifford, H
Được phát hành: (2016)

Bayesian methods for estimating human ancestry using whole genome SNP data
Bằng: Churchhouse, C
Được phát hành: (2012)

Application of the Neutral Indel Model to genome sequences for diverse metazoans
Bằng: Meader, S
Được phát hành: (2010)

Statistical models for single-cell data
Bằng: Pierson, E
Được phát hành: (2015)

The estimation of recombination rates from population genetic data
Bằng: Auton, A
Được phát hành: (2007)

vSNP: a SNP pipeline for the generation of transparent SNP matrices and phylogenetic trees from whole genome sequencing data sets
Bằng: Jessica Hicks, et al.
Được phát hành: (2024-06-01)

Multilocus sequence analysis of the pathogen Neisseria meningitidis
Bằng: Wilson, D
Được phát hành: (2005)

Multiple sequence analysis in the presence of alignment uncertainty
Bằng: Herman, J, et al.
Được phát hành: (2014)

Large-scale genetic analysis of quantitative traits
Bằng: Randall, J, et al.
Được phát hành: (2012)

Design and analysis of genome-wide association studies
Bằng: Barrett, J
Được phát hành: (2008)

An integrated genomic approach for the identification and analysis of single nucleotide polymorphisms that affect cancer in humans
Bằng: Repapi, E
Được phát hành: (2013)

Statistical analysis of natural selection in RNA virus populations
Bằng: Bhatt, S
Được phát hành: (2010)

Simultaneous estimation of population size changes and splits times using importance sampling
Bằng: Forest, M
Được phát hành: (2014)

Gene x gene interactions in genome wide association studies
Bằng: Bhattacharya, K
Được phát hành: (2014)

Quantifying the underestimation of relative risks from genome-wide association studies
Bằng: Spencer, C, et al.
Được phát hành: (2011)

On genetic variants underlying common disease
Bằng: Hechter, E
Được phát hành: (2011)

A method for the identification of biological pathways
Bằng: Honti, F
Được phát hành: (2014)

Evolution of highly fecund organisms
Bằng: Miller, L
Được phát hành: (2015)

Extensions of the case-control design in genome-wide association studies
Bằng: Loizides, C
Được phát hành: (2012)

Multilocus approaches to the detection of disease susceptibility regions: methods and applications
Bằng: Ciampa, J
Được phát hành: (2012)

Protein protein interactions, evolutionary rate, abundance and age
Bằng: Saeed, R, et al.
Được phát hành: (2006)

Cotranslational protein folding - fact or fiction?
Bằng: Deane, C, et al.
Được phát hành: (2007)

Using phylogeny to improve genome-wide distant homology recognition
Bằng: Abeln, S, et al.
Được phát hành: (2007)

Modelling sequential protein folding under kinetic control
Bằng: Huard, F, et al.
Được phát hành: (2006)